17 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Mlg_0001  CDS  NC_008340  75  1430  1356  chromosomal replication initiation protein  YP_740850  unclonable  7.64641e-07  normal  0.435321  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0195  CDS  NC_008340  226766  227773  1008  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  YP_741040  unclonable  1.4787e-07  normal  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0416  CDS  NC_008340  465925  466653  729  hypothetical protein  YP_741260  unclonable  2.86057e-08  normal  0.0207815  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0590  CDS  NC_008340  642484  642861  378  type IV pilus assembly PilZ  YP_741434  hitchhiker  0.0040025  unclonable  1.11393e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0591  CDS  NC_008340  642915  643775  861  bifunctional 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/ 5,10-methylene-tetrahydrofolate cyclohydrolase  YP_741435  hitchhiker  7.4286e-06  unclonable  2.01088e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0592  CDS  NC_008340  644453  645295  843  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  YP_741436  hitchhiker  8.01291e-07  unclonable  2.22313e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0593  CDS  NC_008340  645765  646871  1107  porin  YP_741437  unclonable  1.97819e-07  unclonable  2.88423e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0594  CDS  NC_008340  647221  648285  1065  porin  YP_741438  unclonable  2.27625e-07  unclonable  3.18865e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_0613  CDS  NC_008340  664134  664652  519  phasin family protein  YP_741457  unclonable  1.22223e-08  hitchhiker  6.864e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_2599  CDS  NC_008340  2945050  2945727  678  nitroreductase  YP_743429  unclonable  4.44768e-08  hitchhiker  2.147e-05  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_2676  CDS  NC_008340  3030615  3030818  204  cold-shock DNA-binding protein family protein  YP_743506  hitchhiker  2.56327e-06  unclonable  1.4308e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_2677  CDS  NC_008340  3031106  3032089  984  hypothetical protein  YP_743507  unclonable  4.40708e-07  hitchhiker  1.63518e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_2788  CDS  NC_008340  3170819  3171847  1029  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  YP_743618  unclonable  1.33752e-07  normal  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_R0022  tRNA  NC_008340  643969  644045  77  tRNA-Pro    hitchhiker  4.45739e-07  unclonable  9.38504e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_R0023  tRNA  NC_008340  644094  644170  77  tRNA-Arg    hitchhiker  4.16946e-08  unclonable  9.7747e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_R0024  tRNA  NC_008340  644208  644283  76  tRNA-His    hitchhiker  4.41767e-08  unclonable  9.7747e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mlg_R0025  tRNA  NC_008340  644290  644365  76  tRNA-Lys    hitchhiker  4.16946e-08  unclonable  9.48259e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>