31 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CPS_0266  CDS  NC_003910  269136  270863  -  1728  hypothetical protein  YP_267033  unclonable  0.00886751  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0292  CDS  NC_003910  302274  302951  -  678  hypothetical protein  YP_267058  unclonable  0.000146713  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0293  CDS  NC_003910  303135  303527  -  393  hypothetical protein  YP_267059  unclonable  0.0000415499  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0550  CDS  NC_003910  547968  548984  +  1017  NifR3/Smm1 family protein  YP_267308  unclonable  0.000498133  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0951  CDS  NC_003910  957226  958518  +  1293  hypothetical protein  YP_267700  unclonable  0.00169672  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_1750  CDS  NC_003910  1795596  1796324  -  729  transcriptional regulatory protein CpxR  YP_268481  unclonable  0.000216865  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_1751  CDS  NC_003910  1796529  1796987  +  459  hypothetical protein  YP_268482  unclonable  0.0000749705  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_2103  CDS  NC_003910  2187299  2188534  +  1236  hypothetical protein  YP_268830  unclonable  0.00124197  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_2281  CDS  NC_003910  2380310  2381779  +  1470  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  YP_269001  unclonable  0.0036441  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_2334  CDS  NC_003910  2432907  2433587  +  681  cytidylate kinase  YP_269054  unclonable  0.000116453  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_2335  CDS  NC_003910  2433740  2435401  +  1662  30S ribosomal protein S1  YP_269055  unclonable  0.00568908  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_2649  CDS  NC_003910  2753184  2754470  -  1287  glucose/galactose transporter family protein  YP_269363  unclonable  0.000985214  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_2692  CDS  NC_003910  2801113  2802402  -  1290  zinc carboxypeptidase family protein  YP_269406  unclonable  0.0016795  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_2833  tRNA  NC_003910  2963930  2964005  -  76  tRNA-Glu    unclonable  0.0000102319  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_2834  tRNA  NC_003910  2964109  2964184  -  76  tRNA-Ala    unclonable  0.0000118902  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_2889  tRNA  NC_003910  3024992  3025067  +  76  tRNA-Asn    unclonable  0.0000182855  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_2890  tRNA  NC_003910  3025108  3025183  +  76  tRNA-Asn    unclonable  0.0000200194  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_2891  tRNA  NC_003910  3025224  3025299  +  76  tRNA-Asn    unclonable  0.0000194238  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_2892  tRNA  NC_003910  3025340  3025415  +  76  tRNA-Asn    unclonable  0.0000182855  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_2984  CDS  NC_003910  3124275  3125813  +  1539  sulfatase family protein  YP_269684  unclonable  0.00336122  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_3164  CDS  NC_003910  3295782  3297527  +  1746  batD protein  YP_269860  unclonable  0.00886751  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_3232  CDS  NC_003910  3360743  3361978  +  1236  aminotransferase AlaT  YP_269922  unclonable  0.00114602  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_3236  CDS  NC_003910  3364002  3365729  +  1728  acetolactate synthase III, large subunit, biosynthetic type  YP_269926  unclonable  0.00702842  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_3240  CDS  NC_003910  3369541  3371211  -  1671  glutaminyl-tRNA synthetase  YP_269930  unclonable  0.00746606  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_3595  CDS  NC_003910  3732698  3733744  -  1047  MutT/nudix family protein  YP_270263  unclonable  0.000478506  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_3738  CDS  NC_003910  3899199  3900602  -  1404  hypothetical protein  YP_270405  unclonable  0.00183877  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_3784  CDS  NC_003910  3949230  3950504  -  1275  ATP-dependent protease ATP-binding subunit ClpX  YP_270451  unclonable  0.00164592  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_4042  CDS  NC_003910  4251552  4252787  -  1236  allantoate amidohydrolase  YP_270699  unclonable  0.00143061  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_4085  CDS  NC_003910  4299484  4299855  -  372  putative granule-associated protein  YP_270740  unclonable  0.0000162145  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_4086  CDS  NC_003910  4300039  4300902  -  864  putative granule-associated protein  YP_270741  unclonable  0.00010965  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_4879  CDS  NC_003910  5174875  5175702  +  828  hypothetical protein  YP_271518  unclonable  0.000399602  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>