31 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CPS_0266  CDS  NC_003910  269136  270863  1728  hypothetical protein  YP_267033  unclonable  0.00886751  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0292  CDS  NC_003910  302274  302951  678  hypothetical protein  YP_267058  unclonable  0.000146713  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0293  CDS  NC_003910  303135  303527  393  hypothetical protein  YP_267059  unclonable  4.15499e-05  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0550  CDS  NC_003910  547968  548984  1017  NifR3/Smm1 family protein  YP_267308  unclonable  0.000498133  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_0951  CDS  NC_003910  957226  958518  1293  hypothetical protein  YP_267700  unclonable  0.00169672  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_1750  CDS  NC_003910  1795596  1796324  729  transcriptional regulatory protein CpxR  YP_268481  unclonable  0.000216865  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_1751  CDS  NC_003910  1796529  1796987  459  hypothetical protein  YP_268482  unclonable  7.49705e-05  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_2103  CDS  NC_003910  2187299  2188534  1236  hypothetical protein  YP_268830  unclonable  0.00124197  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_2281  CDS  NC_003910  2380310  2381779  1470  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  YP_269001  unclonable  0.0036441  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_2334  CDS  NC_003910  2432907  2433587  681  cytidylate kinase  YP_269054  unclonable  0.000116453  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_2335  CDS  NC_003910  2433740  2435401  1662  30S ribosomal protein S1  YP_269055  unclonable  0.00568908  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_2649  CDS  NC_003910  2753184  2754470  1287  glucose/galactose transporter family protein  YP_269363  unclonable  0.000985214  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_2692  CDS  NC_003910  2801113  2802402  1290  zinc carboxypeptidase family protein  YP_269406  unclonable  0.0016795  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_2833  tRNA  NC_003910  2963930  2964005  76  tRNA-Glu    unclonable  1.02319e-05  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_2834  tRNA  NC_003910  2964109  2964184  76  tRNA-Ala    unclonable  1.18902e-05  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_2889  tRNA  NC_003910  3024992  3025067  76  tRNA-Asn    unclonable  1.82855e-05  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_2890  tRNA  NC_003910  3025108  3025183  76  tRNA-Asn    unclonable  2.00194e-05  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_2891  tRNA  NC_003910  3025224  3025299  76  tRNA-Asn    unclonable  1.94238e-05  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_2892  tRNA  NC_003910  3025340  3025415  76  tRNA-Asn    unclonable  1.82855e-05  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_2984  CDS  NC_003910  3124275  3125813  1539  sulfatase family protein  YP_269684  unclonable  0.00336122  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_3164  CDS  NC_003910  3295782  3297527  1746  batD protein  YP_269860  unclonable  0.00886751  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_3232  CDS  NC_003910  3360743  3361978  1236  aminotransferase AlaT  YP_269922  unclonable  0.00114602  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_3236  CDS  NC_003910  3364002  3365729  1728  acetolactate synthase III, large subunit, biosynthetic type  YP_269926  unclonable  0.00702842  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_3240  CDS  NC_003910  3369541  3371211  1671  glutaminyl-tRNA synthetase  YP_269930  unclonable  0.00746606  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_3595  CDS  NC_003910  3732698  3733744  1047  MutT/nudix family protein  YP_270263  unclonable  0.000478506  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_3738  CDS  NC_003910  3899199  3900602  1404  hypothetical protein  YP_270405  unclonable  0.00183877  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_3784  CDS  NC_003910  3949230  3950504  1275  ATP-dependent protease ATP-binding subunit ClpX  YP_270451  unclonable  0.00164592  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_4042  CDS  NC_003910  4251552  4252787  1236  allantoate amidohydrolase  YP_270699  unclonable  0.00143061  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_4085  CDS  NC_003910  4299484  4299855  372  putative granule-associated protein  YP_270740  unclonable  1.62145e-05  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_4086  CDS  NC_003910  4300039  4300902  864  putative granule-associated protein  YP_270741  unclonable  0.00010965  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
CPS_4879  CDS  NC_003910  5174875  5175702  828  hypothetical protein  YP_271518  unclonable  0.000399602  n/a    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>