222 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
VEA_000195  CDS  NC_013457  211378  211917  -  540  cytochrome b561  YP_003287348  unclonable  0.000000000187144  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000196  CDS  NC_013457  212092  212334  -  243  hypothetical protein  YP_003287349  unclonable  0.0000000000484737  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000297  CDS  NC_013457  320477  321715  +  1239  oxalate/formate antiporter  YP_003287450  unclonable  0.00000000377663  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000327  CDS  NC_013457  372025  372993  +  969  transcriptional regulator AraC family  YP_003287480  unclonable  0.000000000791228  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000328  CDS  NC_013457  373081  373467  +  387  HTH-type transcriptional regulator CueR  YP_003287481  unclonable  0.0000000000737909  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000329  CDS  NC_013457  373522  374277  -  756  ferric vibriobactin enterobactin transport system ATP-binding protein  YP_003287482  unclonable  0.000000000365879  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000330  CDS  NC_013457  374280  375230  -  951  iron(III) ABC transporter permease protein  YP_003287483  unclonable  0.000000000947678  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000331  CDS  NC_013457  375223  376092  -  870  iron(III) ABC transporter permease protein  YP_003287484  unclonable  0.000000000524649  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000332  CDS  NC_013457  376181  377089  -  909  ferric vibriobactin enterobactin transport system substrate-binding protein VctP  YP_003287485  unclonable  0.000000000938047  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000448  CDS  NC_013457  511526  513604  -  2079  VgrG protein  YP_003287601  unclonable  0.000000107078  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000449  CDS  NC_013457  513677  514195  -  519  Hcp protein  YP_003287602  unclonable  0.000000000134513  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000565  CDS  NC_013457  663012  664358  +  1347  putative magnesium transporter MgtE  YP_003287716  unclonable  0.000000005121  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000606  CDS  NC_013457  704731  705873  -  1143  zinc-regulated TonB-dependent outer membrane receptor  YP_003287757  unclonable  0.00000000126678  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000960  CDS  NC_013457  1091038  1091391  +  354  hypothetical protein  YP_003288110  unclonable  0.000000000106853  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001153  CDS  NC_013457  1320135  1320647  -  513  hypothetical protein  YP_003288303  unclonable  0.000000000282051  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001284  CDS  NC_013457  1459702  1461807  -  2106  putative iron(III) compound receptor  YP_003288432  unclonable  0.000000165675  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001285  CDS  NC_013457  1461995  1463806  +  1812  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  YP_003288433  unclonable  0.0000000363731  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001392  CDS  NC_013457  1576352  1577203  -  852  beta-lactamase  YP_003288540  unclonable  0.000000000730239  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001393  CDS  NC_013457  1577470  1578792  +  1323  putative oxidoreductase  YP_003288541  unclonable  0.00000000700174  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001520  CDS  NC_013457  1716965  1717645  +  681  acyl dehydratase  YP_003288668  unclonable  0.000000000377103  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001521  CDS  NC_013457  1717705  1718529  -  825  ABC transporter substrate-binding protein  YP_003288669  unclonable  0.000000000647387  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001592  CDS  NC_013457  1806347  1807546  -  1200  putative lipoprotein  YP_003288738  unclonable  0.00000000686161  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001593  CDS  NC_013457  1807637  1808305  +  669  putative two-component response regulator  YP_003288739  unclonable  0.000000000660606  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001620  CDS  NC_013456  9853  10914  -  1062  endopeptidase  YP_003284248  unclonable  0.00000013528  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001674  CDS  NC_013456  71845  72816  +  972  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  YP_003284302  unclonable  0.00000010929  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001721  CDS  NC_013456  119008  119121  -  114  LSU ribosomal protein L36p  YP_003284349  unclonable  0.00000000373745  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001722  CDS  NC_013456  119160  120494  -  1335  preprotein translocase SecY subunit  YP_003284350  unclonable  0.000000228975  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001733  CDS  NC_013456  124740  124994  -  255  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  YP_003284361  unclonable  0.0000000075143  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001734  CDS  NC_013456  124994  125185  -  192  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  YP_003284362  unclonable  0.00000000790983  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001735  CDS  NC_013456  125185  125595  -  411  LSU ribosomal protein L16p (L10e)  YP_003284363  unclonable  0.0000000145291  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001820  CDS  NC_013456  208955  209191  -  237  LSU ribosomal protein L28p  YP_003284448  unclonable  0.00000000491703  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001821  CDS  NC_013456  209494  210168  -  675  DNA repair protein RadC  YP_003284449  unclonable  0.0000000198963  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001822  CDS  NC_013456  210283  211956  -  1674  methyl-accepting chemotaxis protein  YP_003284450  unclonable  0.00000124429  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001823  CDS  NC_013456  212150  213349  +  1200  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenoylcysteine synthetase  YP_003284451  unclonable  0.000000213304  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001824  CDS  NC_013456  213521  214111  +  591  transcriptional regulator  YP_003284452  unclonable  0.0000000410739  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001917  CDS  NC_013456  310656  313442  -  2787  DNA polymerase I  YP_003284545  unclonable  0.0000349897  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002008  CDS  NC_013456  417580  418680  -  1101  DNA polymerase III beta subunit  YP_003284636  unclonable  0.0000000997729  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002022  CDS  NC_013456  431256  432137  +  882  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  YP_003284650  unclonable  0.000000100798  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002023  CDS  NC_013456  432378  432716  +  339  ATP synthase protein I  YP_003284651  unclonable  0.0000000172705  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002141  CDS  NC_013456  558858  559715  +  858  RNA polymerase sigma factor RpoH  YP_003284769  unclonable  0.000000181562  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002166  CDS  NC_013456  589166  590350  +  1185  translation elongation factor Tu  YP_003284794  unclonable  0.000000148186  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002167  CDS  NC_013456  590617  590997  +  381  preprotein translocase subunit SecE  YP_003284795  unclonable  0.0000000092259  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002168  CDS  NC_013456  591011  591559  +  549  transcription antitermination protein NusG  YP_003284796  unclonable  0.0000000118825  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002169  CDS  NC_013456  591724  592152  +  429  LSU ribosomal protein L11p (L12e)  YP_003284797  unclonable  0.0000000075143  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002170  CDS  NC_013456  592157  592858  +  702  LSU ribosomal protein L1p (L10Ae)  YP_003284798  unclonable  0.0000000179792  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002171  CDS  NC_013456  593152  593646  +  495  LSU ribosomal protein L10p (P0)  YP_003284799  unclonable  0.0000000109594  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002219  CDS  NC_013456  667013  667702  -  690  copper-sensing two-component system response regulator CpxR  YP_003284847  unclonable  0.0000000572967  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002220  CDS  NC_013456  667893  668405  +  513  P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc- resistance associated protein  YP_003284848  unclonable  0.0000000285493  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002292  CDS  NC_013456  746077  746859  +  783  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FkpA precursor  YP_003284919  unclonable  0.0000000528098  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002293  CDS  NC_013456  747045  747725  +  681  hypothetical protein  YP_003284920  unclonable  0.0000000331987  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002294  CDS  NC_013456  747722  748117  +  396  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusD  YP_003284921  unclonable  0.00000000990562  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002295  CDS  NC_013456  748114  748470  +  357  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusC  YP_003284922  unclonable  0.00000000867918  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002296  CDS  NC_013456  748568  748753  +  186  hypothetical protein  YP_003284923  unclonable  0.00000000439536  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002297  CDS  NC_013456  748931  749305  +  375  SSU ribosomal protein S12p (S23e)  YP_003284924  unclonable  0.00000000970736  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002298  CDS  NC_013456  749407  749877  +  471  SSU ribosomal protein S7p (S5e)  YP_003284925  unclonable  0.0000000149814  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002299  CDS  NC_013456  749953  752052  +  2100  translation elongation factor G  YP_003284926  unclonable  0.00000315857  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002300  CDS  NC_013456  752206  753390  +  1185  translation elongation factor Tu  YP_003284927  unclonable  0.000000149708  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002327  CDS  NC_013456  783662  784093  +  432  shikimate kinase I  YP_003284954  unclonable  0.0000000118825  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002337  CDS  NC_013456  791205  792605  +  1401  replicative DNA helicase  YP_003284964  unclonable  0.000000292135  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002383  CDS  NC_013456  851976  853019  +  1044  rod shape-determining protein MreB  YP_003285010  unclonable  0.0000000533641  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002392  CDS  NC_013456  864844  867753  +  2910  RNA polymerase associated protein RapA  YP_003285019  unclonable  0.0000609656  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002441  CDS  NC_013456  914017  915270  +  1254  HD-GYP domain-containing protein  YP_003285068  unclonable  0.000000172513  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002443  CDS  NC_013456  924418  926043  -  1626  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  YP_003285070  unclonable  0.00000057049  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002504  CDS  NC_013456  986312  988531  +  2220  GTP pyrophosphokinase (p)ppGpp synthetase I  YP_003285131  unclonable  0.00000545051  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002522  CDS  NC_013456  1007198  1008385  +  1188  aspartokinase  YP_003285149  unclonable  0.000000343675  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002523  CDS  NC_013456  1008478  1008675  +  198  carbon storage regulator  YP_003285150  unclonable  0.0000000181679  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002541  CDS  NC_013456  1028492  1029232  -  741  hypothetical protein  YP_003285168  unclonable  0.0000000386478  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002542  CDS  NC_013456  1029260  1029874  -  615  dephospho-CoA kinase  YP_003285169  unclonable  0.0000000291324  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002543  CDS  NC_013456  1029875  1030744  -  870  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  YP_003285170  unclonable  0.0000000528098  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002563  CDS  NC_013456  1053083  1054444  -  1362  poly(A) polymerase  YP_003285190  unclonable  0.000000329901  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002564  CDS  NC_013456  1054552  1055415  -  864  glutamyl-Q-tRNA synthetase  YP_003285191  unclonable  0.0000000502231  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002565  CDS  NC_013456  1055512  1055958  -  447  C4-type zinc finger protein, DksA/TraR family  YP_003285192  unclonable  0.000000015142  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002571  CDS  NC_013456  1067130  1067498  +  369  hypothetical protein  YP_003285198  unclonable  0.0000000160923  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002572  CDS  NC_013456  1067687  1068025  +  339  nitrogen regulatory protein P-II  YP_003285199  unclonable  0.0000000156099  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002573  CDS  NC_013456  1068137  1069282  +  1146  ammonium transporter  YP_003285200  unclonable  0.000000132513  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002574  CDS  NC_013456  1069435  1070448  +  1014  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  YP_003285201  unclonable  0.0000000722094  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002603  CDS  NC_013456  1109844  1111826  +  1983  cell division protein FtsH  YP_003285230  unclonable  0.00000182706  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002604  CDS  NC_013456  1111930  1112709  +  780  dihydropteroate synthase  YP_003285231  unclonable  0.0000000406473  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002605  CDS  NC_013456  1112729  1114069  +  1341  phosphoglucosamine mutase  YP_003285232  unclonable  0.000000248269  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002606  CDS  NC_013456  1114291  1114629  +  339  preprotein translocase subunit SecG  YP_003285233  unclonable  0.0000000104181  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002637  CDS  NC_013456  1149419  1151509  +  2091  translation elongation factor G-like protein  YP_003285264  unclonable  0.00000382305  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002680  CDS  NC_013456  1202499  1202747  -  249  hypothetical protein  YP_003285307  unclonable  0.0000000092259  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002870  CDS  NC_013456  1398227  1399438  +  1212  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase KASI  YP_003285497  unclonable  0.000000108179  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002909  CDS  NC_013456  1446250  1446660  +  411  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  YP_003285536  unclonable  0.0000000132728  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002910  CDS  NC_013456  1446776  1447597  -  822  hypothetical protein  YP_003285537  unclonable  0.0000000567141  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002911  CDS  NC_013456  1447699  1447983  +  285  putative cytoplasmic protein  YP_003285538  unclonable  0.0000000075143  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002912  CDS  NC_013456  1448083  1449096  -  1014  L-asparaginase  YP_003285539  unclonable  0.0000000987582  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002930  CDS  NC_013456  1470105  1470743  -  639  multiple antibiotic transporter  YP_003285557  unclonable  0.0000000449619  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002934  CDS  NC_013456  1475774  1476358  -  585  superoxide dismutase (Fe)  YP_003285561  unclonable  0.0000000374974  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002935  CDS  NC_013456  1476628  1476978  +  351  glutaredoxin-related protein  YP_003285562  unclonable  0.0000000192998  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002936  CDS  NC_013456  1477053  1477682  +  630  thioredoxin  YP_003285563  unclonable  0.0000000472775  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002937  CDS  NC_013456  1477758  1479035  -  1278  hypothetical protein  YP_003285564  unclonable  0.000000304263  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002938  CDS  NC_013456  1479112  1479756  -  645  ribonuclease T  YP_003285565  unclonable  0.0000000394372  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002939  CDS  NC_013456  1479823  1479951  -  129  hypothetical protein  YP_003285566  unclonable  0.00000000759474  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002940  CDS  NC_013456  1480020  1480901  +  882  sodium-type flagellar protein MotY precursor  YP_003285567  unclonable  0.0000000866037  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002993  CDS  NC_013456  1541353  1542378  +  1026  phosphate:acyl-ACP acyltransferase PlsX  YP_003285620  unclonable  0.000000080713  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002994  CDS  NC_013456  1542384  1543334  +  951  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase KASIII  YP_003285621  unclonable  0.0000000798745  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002995  CDS  NC_013456  1543410  1544333  +  924  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  YP_003285622  unclonable  0.0000000798745  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002996  CDS  NC_013456  1544377  1545114  +  738  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  YP_003285623  unclonable  0.0000000487281  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002997  CDS  NC_013456  1545361  1545594  +  234  acyl carrier protein  YP_003285624  unclonable  0.0000000114141  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>