222 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
VEA_000195  CDS  NC_013457  211378  211917  540  cytochrome b561  YP_003287348  unclonable  1.87144e-10  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000196  CDS  NC_013457  212092  212334  243  hypothetical protein  YP_003287349  unclonable  4.84737e-11  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000297  CDS  NC_013457  320477  321715  1239  oxalate/formate antiporter  YP_003287450  unclonable  3.77663e-09  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000327  CDS  NC_013457  372025  372993  969  transcriptional regulator AraC family  YP_003287480  unclonable  7.91228e-10  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000328  CDS  NC_013457  373081  373467  387  HTH-type transcriptional regulator CueR  YP_003287481  unclonable  7.37909e-11  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000329  CDS  NC_013457  373522  374277  756  ferric vibriobactin enterobactin transport system ATP-binding protein  YP_003287482  unclonable  3.65879e-10  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000330  CDS  NC_013457  374280  375230  951  iron(III) ABC transporter permease protein  YP_003287483  unclonable  9.47678e-10  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000331  CDS  NC_013457  375223  376092  870  iron(III) ABC transporter permease protein  YP_003287484  unclonable  5.24649e-10  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000332  CDS  NC_013457  376181  377089  909  ferric vibriobactin enterobactin transport system substrate-binding protein VctP  YP_003287485  unclonable  9.38047e-10  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000448  CDS  NC_013457  511526  513604  2079  VgrG protein  YP_003287601  unclonable  1.07078e-07  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000449  CDS  NC_013457  513677  514195  519  Hcp protein  YP_003287602  unclonable  1.34513e-10  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000565  CDS  NC_013457  663012  664358  1347  putative magnesium transporter MgtE  YP_003287716  unclonable  5.121e-09  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000606  CDS  NC_013457  704731  705873  1143  zinc-regulated TonB-dependent outer membrane receptor  YP_003287757  unclonable  1.26678e-09  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000960  CDS  NC_013457  1091038  1091391  354  hypothetical protein  YP_003288110  unclonable  1.06853e-10  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001153  CDS  NC_013457  1320135  1320647  513  hypothetical protein  YP_003288303  unclonable  2.82051e-10  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001284  CDS  NC_013457  1459702  1461807  2106  putative iron(III) compound receptor  YP_003288432  unclonable  1.65675e-07  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001285  CDS  NC_013457  1461995  1463806  1812  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  YP_003288433  unclonable  3.63731e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001392  CDS  NC_013457  1576352  1577203  852  beta-lactamase  YP_003288540  unclonable  7.30239e-10  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001393  CDS  NC_013457  1577470  1578792  1323  putative oxidoreductase  YP_003288541  unclonable  7.00174e-09  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001520  CDS  NC_013457  1716965  1717645  681  acyl dehydratase  YP_003288668  unclonable  3.77103e-10  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001521  CDS  NC_013457  1717705  1718529  825  ABC transporter substrate-binding protein  YP_003288669  unclonable  6.47387e-10  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001592  CDS  NC_013457  1806347  1807546  1200  putative lipoprotein  YP_003288738  unclonable  6.86161e-09  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001593  CDS  NC_013457  1807637  1808305  669  putative two-component response regulator  YP_003288739  unclonable  6.60606e-10  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001620  CDS  NC_013456  9853  10914  1062  endopeptidase  YP_003284248  unclonable  1.3528e-07  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001674  CDS  NC_013456  71845  72816  972  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  YP_003284302  unclonable  1.0929e-07  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001721  CDS  NC_013456  119008  119121  114  LSU ribosomal protein L36p  YP_003284349  unclonable  3.73745e-09  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001722  CDS  NC_013456  119160  120494  1335  preprotein translocase SecY subunit  YP_003284350  unclonable  2.28975e-07  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001733  CDS  NC_013456  124740  124994  255  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  YP_003284361  unclonable  7.5143e-09  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001734  CDS  NC_013456  124994  125185  192  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  YP_003284362  unclonable  7.90983e-09  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001735  CDS  NC_013456  125185  125595  411  LSU ribosomal protein L16p (L10e)  YP_003284363  unclonable  1.45291e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001820  CDS  NC_013456  208955  209191  237  LSU ribosomal protein L28p  YP_003284448  unclonable  4.91703e-09  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001821  CDS  NC_013456  209494  210168  675  DNA repair protein RadC  YP_003284449  unclonable  1.98963e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001822  CDS  NC_013456  210283  211956  1674  methyl-accepting chemotaxis protein  YP_003284450  unclonable  1.24429e-06  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001823  CDS  NC_013456  212150  213349  1200  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenoylcysteine synthetase  YP_003284451  unclonable  2.13304e-07  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001824  CDS  NC_013456  213521  214111  591  transcriptional regulator  YP_003284452  unclonable  4.10739e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_001917  CDS  NC_013456  310656  313442  2787  DNA polymerase I  YP_003284545  unclonable  3.49897e-05  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002008  CDS  NC_013456  417580  418680  1101  DNA polymerase III beta subunit  YP_003284636  unclonable  9.97729e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002022  CDS  NC_013456  431256  432137  882  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  YP_003284650  unclonable  1.00798e-07  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002023  CDS  NC_013456  432378  432716  339  ATP synthase protein I  YP_003284651  unclonable  1.72705e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002141  CDS  NC_013456  558858  559715  858  RNA polymerase sigma factor RpoH  YP_003284769  unclonable  1.81562e-07  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002166  CDS  NC_013456  589166  590350  1185  translation elongation factor Tu  YP_003284794  unclonable  1.48186e-07  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002167  CDS  NC_013456  590617  590997  381  preprotein translocase subunit SecE  YP_003284795  unclonable  9.2259e-09  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002168  CDS  NC_013456  591011  591559  549  transcription antitermination protein NusG  YP_003284796  unclonable  1.18825e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002169  CDS  NC_013456  591724  592152  429  LSU ribosomal protein L11p (L12e)  YP_003284797  unclonable  7.5143e-09  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002170  CDS  NC_013456  592157  592858  702  LSU ribosomal protein L1p (L10Ae)  YP_003284798  unclonable  1.79792e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002171  CDS  NC_013456  593152  593646  495  LSU ribosomal protein L10p (P0)  YP_003284799  unclonable  1.09594e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002219  CDS  NC_013456  667013  667702  690  copper-sensing two-component system response regulator CpxR  YP_003284847  unclonable  5.72967e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002220  CDS  NC_013456  667893  668405  513  P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc- resistance associated protein  YP_003284848  unclonable  2.85493e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002292  CDS  NC_013456  746077  746859  783  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FkpA precursor  YP_003284919  unclonable  5.28098e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002293  CDS  NC_013456  747045  747725  681  hypothetical protein  YP_003284920  unclonable  3.31987e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002294  CDS  NC_013456  747722  748117  396  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusD  YP_003284921  unclonable  9.90562e-09  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002295  CDS  NC_013456  748114  748470  357  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusC  YP_003284922  unclonable  8.67918e-09  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002296  CDS  NC_013456  748568  748753  186  hypothetical protein  YP_003284923  unclonable  4.39536e-09  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002297  CDS  NC_013456  748931  749305  375  SSU ribosomal protein S12p (S23e)  YP_003284924  unclonable  9.70736e-09  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002298  CDS  NC_013456  749407  749877  471  SSU ribosomal protein S7p (S5e)  YP_003284925  unclonable  1.49814e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002299  CDS  NC_013456  749953  752052  2100  translation elongation factor G  YP_003284926  unclonable  3.15857e-06  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002300  CDS  NC_013456  752206  753390  1185  translation elongation factor Tu  YP_003284927  unclonable  1.49708e-07  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002327  CDS  NC_013456  783662  784093  432  shikimate kinase I  YP_003284954  unclonable  1.18825e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002337  CDS  NC_013456  791205  792605  1401  replicative DNA helicase  YP_003284964  unclonable  2.92135e-07  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002383  CDS  NC_013456  851976  853019  1044  rod shape-determining protein MreB  YP_003285010  unclonable  5.33641e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002392  CDS  NC_013456  864844  867753  2910  RNA polymerase associated protein RapA  YP_003285019  unclonable  6.09656e-05  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002441  CDS  NC_013456  914017  915270  1254  HD-GYP domain-containing protein  YP_003285068  unclonable  1.72513e-07  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002443  CDS  NC_013456  924418  926043  1626  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  YP_003285070  unclonable  5.7049e-07  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002504  CDS  NC_013456  986312  988531  2220  GTP pyrophosphokinase (p)ppGpp synthetase I  YP_003285131  unclonable  5.45051e-06  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002522  CDS  NC_013456  1007198  1008385  1188  aspartokinase  YP_003285149  unclonable  3.43675e-07  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002523  CDS  NC_013456  1008478  1008675  198  carbon storage regulator  YP_003285150  unclonable  1.81679e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002541  CDS  NC_013456  1028492  1029232  741  hypothetical protein  YP_003285168  unclonable  3.86478e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002542  CDS  NC_013456  1029260  1029874  615  dephospho-CoA kinase  YP_003285169  unclonable  2.91324e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002543  CDS  NC_013456  1029875  1030744  870  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  YP_003285170  unclonable  5.28098e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002563  CDS  NC_013456  1053083  1054444  1362  poly(A) polymerase  YP_003285190  unclonable  3.29901e-07  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002564  CDS  NC_013456  1054552  1055415  864  glutamyl-Q-tRNA synthetase  YP_003285191  unclonable  5.02231e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002565  CDS  NC_013456  1055512  1055958  447  C4-type zinc finger protein, DksA/TraR family  YP_003285192  unclonable  1.5142e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002571  CDS  NC_013456  1067130  1067498  369  hypothetical protein  YP_003285198  unclonable  1.60923e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002572  CDS  NC_013456  1067687  1068025  339  nitrogen regulatory protein P-II  YP_003285199  unclonable  1.56099e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002573  CDS  NC_013456  1068137  1069282  1146  ammonium transporter  YP_003285200  unclonable  1.32513e-07  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002574  CDS  NC_013456  1069435  1070448  1014  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  YP_003285201  unclonable  7.22094e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002603  CDS  NC_013456  1109844  1111826  1983  cell division protein FtsH  YP_003285230  unclonable  1.82706e-06  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002604  CDS  NC_013456  1111930  1112709  780  dihydropteroate synthase  YP_003285231  unclonable  4.06473e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002605  CDS  NC_013456  1112729  1114069  1341  phosphoglucosamine mutase  YP_003285232  unclonable  2.48269e-07  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002606  CDS  NC_013456  1114291  1114629  339  preprotein translocase subunit SecG  YP_003285233  unclonable  1.04181e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002637  CDS  NC_013456  1149419  1151509  2091  translation elongation factor G-like protein  YP_003285264  unclonable  3.82305e-06  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002680  CDS  NC_013456  1202499  1202747  249  hypothetical protein  YP_003285307  unclonable  9.2259e-09  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002870  CDS  NC_013456  1398227  1399438  1212  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase KASI  YP_003285497  unclonable  1.08179e-07  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002909  CDS  NC_013456  1446250  1446660  411  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  YP_003285536  unclonable  1.32728e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002910  CDS  NC_013456  1446776  1447597  822  hypothetical protein  YP_003285537  unclonable  5.67141e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002911  CDS  NC_013456  1447699  1447983  285  putative cytoplasmic protein  YP_003285538  unclonable  7.5143e-09  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002912  CDS  NC_013456  1448083  1449096  1014  L-asparaginase  YP_003285539  unclonable  9.87582e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002930  CDS  NC_013456  1470105  1470743  639  multiple antibiotic transporter  YP_003285557  unclonable  4.49619e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002934  CDS  NC_013456  1475774  1476358  585  superoxide dismutase (Fe)  YP_003285561  unclonable  3.74974e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002935  CDS  NC_013456  1476628  1476978  351  glutaredoxin-related protein  YP_003285562  unclonable  1.92998e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002936  CDS  NC_013456  1477053  1477682  630  thioredoxin  YP_003285563  unclonable  4.72775e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002937  CDS  NC_013456  1477758  1479035  1278  hypothetical protein  YP_003285564  unclonable  3.04263e-07  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002938  CDS  NC_013456  1479112  1479756  645  ribonuclease T  YP_003285565  unclonable  3.94372e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002939  CDS  NC_013456  1479823  1479951  129  hypothetical protein  YP_003285566  unclonable  7.59474e-09  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002940  CDS  NC_013456  1480020  1480901  882  sodium-type flagellar protein MotY precursor  YP_003285567  unclonable  8.66037e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002993  CDS  NC_013456  1541353  1542378  1026  phosphate:acyl-ACP acyltransferase PlsX  YP_003285620  unclonable  8.0713e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002994  CDS  NC_013456  1542384  1543334  951  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase KASIII  YP_003285621  unclonable  7.98745e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002995  CDS  NC_013456  1543410  1544333  924  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  YP_003285622  unclonable  7.98745e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002996  CDS  NC_013456  1544377  1545114  738  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  YP_003285623  unclonable  4.87281e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_002997  CDS  NC_013456  1545361  1545594  234  acyl carrier protein  YP_003285624  unclonable  1.14141e-08  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>