69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Val-1 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  tRNA-Val-1  tRNA-Val  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0259741  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0066  tRNA-Val  90.91 
 
 
74 bp  75.8  1e-12  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0004  tRNA-Val  89.39 
 
 
74 bp  67.9  3e-10  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3161t  tRNA-Val  88.46 
 
 
73 bp  56  1e-06  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0023  tRNA-Ala  88.24 
 
 
76 bp  54  4e-06  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.756244  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0018  tRNA-Ala  88.24 
 
 
73 bp  54  4e-06  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.916069 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0023  tRNA-Ala  88.24 
 
 
76 bp  54  4e-06  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0009  tRNA-Pro  87.76 
 
 
74 bp  50.1  7e-05  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0065  tRNA-Val  92.68 
 
 
75 bp  50.1  7e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0619  tRNA-Val  88.68 
 
 
74 bp  50.1  7e-05  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000198516  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0009  tRNA-Pro  87.76 
 
 
74 bp  50.1  7e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.687606  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0008  tRNA-Pro  87.76 
 
 
74 bp  50.1  7e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0003  tRNA-Ala  90.24 
 
 
76 bp  50.1  7e-05  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0157571  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0009  tRNA-Pro  87.76 
 
 
74 bp  50.1  7e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565399  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0052  tRNA-Ala  90.24 
 
 
76 bp  50.1  7e-05  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.786637  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0054  tRNA-Ala  90.24 
 
 
76 bp  50.1  7e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0015  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  2.09319e-09  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0021  tRNA-Val  87.5 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.357184  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0021  tRNA-Val  87.5 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0029  tRNA-Val  87.5 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2208  tRNA-Val  86.27 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2130  tRNA-Val  86.27 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0028  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0063  tRNA-Val  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  6.80631e-07  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0061  tRNA-Val  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  5.99859e-08  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0037  tRNA-Val  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  1.98123e-09  normal  0.111595 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0025  tRNA-Thr  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0021  tRNA-Asn  100 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  2.56576e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0048  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.395e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0047  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  1.12802e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0023  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169137  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t26  tRNA-Lys  96.15 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0014  tRNA-Phe  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.58788  hitchhiker  0.00239858 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0098  tRNA-Phe  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.772561 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0033  tRNA-Lys  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.972639 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0044  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00224472  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4583  tRNA-Lys  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0571835  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0033  tRNA-Val  90.48 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0011  tRNA-Thr  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0110448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0005  tRNA-Val  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.642292 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0016  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0352775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0022  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.786941  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1335  hypothetical protein  96.15 
 
 
207 bp  44.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0040  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0031  tRNA-Lys  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199067  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0033  tRNA-Thr  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07729  tRNA-Trp  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0051  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124425  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0001  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2312  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0031  tRNA-Lys  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0033  tRNA-Lys  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146569  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14002  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0882  tRNA-Lys  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000531124  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1295  tRNA-Lys  96.15 
 
 
78 bp  44.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0080  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  2.42401e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0098  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  5.73413e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2305  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  8.31031e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0028  tRNA-Gly  88.1 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  3.19369e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0013  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276155  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0025  tRNA-Lys  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445908  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0034  tRNA-Ala  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2619  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0471247  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0036  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  2.93435e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0079  tRNA-Val  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  2.80112e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0078  tRNA-Val  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  2.94531e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0050  tRNA-Val  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  7.17049e-10  hitchhiker  1.86152e-05 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2626  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0100  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  5.56304e-10  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>