299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Phe-1 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0023  tRNA-Phe  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt23  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0020  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000566617  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0022  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0738  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0028  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0193  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0260  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2156  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2770  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0191  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.285642  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0250  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1867  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2455  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0046  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0051  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0676526  normal  0.132155 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0022  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.688613  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0017  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t12  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0141221  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0011  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00215934  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0171  tRNA-Phe  98.04 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0048  tRNA-Phe  96.36 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07689  tRNA-Phe  94.74 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.754049  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0054  tRNA-Phe  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.826126  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0059  tRNA-Phe  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.851819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tPhe01  tRNA-Phe  96.15 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0044  tRNA-Phe  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0015  tRNA-Phe  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.689116  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0111  tRNA-Phe  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0238914  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0060  tRNA-Phe  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456959  normal  0.0307991 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0078  tRNA-Phe  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00739535  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0047  tRNA-Phe  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0075  tRNA-Phe  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R13  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0039  tRNA-Phe  91.94 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0036  tRNA-Phe  91.94 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000856432  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0044  tRNA-Phe  91.94 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0044  tRNA-Phe  91.94 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0044  tRNA-Phe  91.94 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0010  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0030  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0867415  normal  0.184559 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0028  tRNA-Phe  94.23 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0054  tRNA-Phe  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0016  tRNA-Phe  94.23 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0001  tRNA-Phe  97.73 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0729187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0046  tRNA-Phe  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0053  tRNA-Phe  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.744233  normal  0.828825 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0059  tRNA-Phe  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.383057  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0040  tRNA-Asn  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0275291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0067  tRNA-Phe  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0001  tRNA-Phe  88 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0473028  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0039  tRNA-Phe  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892118  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  97.62 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0008  tRNA-Phe  90.32 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0043  tRNA-Phe  90.32 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0067  tRNA-Phe  90.32 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000000833232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0037  tRNA-Phe  90.32 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0406321  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3122t  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000556833  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03594  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0038  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03603  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0207  tRNA-Phe  97.56 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3124t  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000666953  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03599  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03596  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0035  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639366  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0208  tRNA-Phe  97.56 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0062  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.357988  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0001  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238457 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0061  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000736114  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0036  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000108389  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3119t  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000473964  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3194t  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.166642  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2873  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223193  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2870  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.65469e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2875  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.76547e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1605  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.841854 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0030  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0006  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna097  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688692  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna099  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000457869  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna104  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000422121  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna102  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000397196  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0038  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000542826  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1570  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1596  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250101  normal  0.561376 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0039  tRNA-Phe  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000106148  normal  0.0231387 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0133  tRNA-Phe  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.091812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0023  tRNA-Phe  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00944199  normal  0.946189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0105  tRNA-Phe  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000135806  normal  0.713625 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0007  tRNA-Phe  88.24 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0572306 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0111  tRNA-Phe  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000403582  normal  0.792835 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0165  tRNA-Phe  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.337836  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0047  tRNA-Phe  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000000558983  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0093  tRNA-Phe  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136229  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0052  tRNA-Phe  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00638125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0050  tRNA-Phe  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00823452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0025  tRNA-Phe  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000140314  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>