More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Met-5 on replicon NC_006274
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  tRNA-Met-4  tRNA-Met  100 
 
 
80 bp  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00179817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-5  tRNA-Met  100 
 
 
80 bp  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.996221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  100 
 
 
80 bp  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000520832  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5022  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00192595  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4991  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5720  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0159176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0078  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000612862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0127  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00272429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-6  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00021362  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0105  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0093247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0057  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0039  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0062  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0052  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0013  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0029  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000365135 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5049  tRNA-Met  97.44 
 
 
79 bp  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236234  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0224  tRNA-Met  97.44 
 
 
79 bp  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000093753  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4566  tRNA-Met  97.44 
 
 
79 bp  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236234  normal  0.0841904 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5037  tRNA-Met  97.44 
 
 
79 bp  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.794581  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0081  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000214937  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0060  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189075  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0022  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136375  normal  0.0369046 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0131  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.14207  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS03939  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS03940  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0023  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205789  normal  0.0373381 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0073  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0082  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000739583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0057  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000630751  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0010  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00010521  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0090  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419074  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0052  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0858392  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0026  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0368817  normal  0.25242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0027  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0686525  normal  0.260083 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0076  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0262196  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0058  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263555  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0056  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0113  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000187631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0042  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0046  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150428  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0047  tRNA-Met  97.37 
 
 
77 bp  135  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0306  tRNA-Met  96.15 
 
 
79 bp  131  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5710  tRNA-Met  96.15 
 
 
79 bp  131  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-2  tRNA-Met  96.15 
 
 
80 bp  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0182265  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-7  tRNA-Met  96.15 
 
 
80 bp  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-3  tRNA-Met  96.15 
 
 
80 bp  131  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00436106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-4  tRNA-Met  96.15 
 
 
80 bp  131  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-6  tRNA-Met  96.15 
 
 
80 bp  131  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00001255  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-2  tRNA-Met  96.15 
 
 
80 bp  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0383767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-3  tRNA-Met  96.15 
 
 
80 bp  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000267735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-8  tRNA-Met  96.15 
 
 
80 bp  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4773  tRNA-Met  96.15 
 
 
79 bp  131  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000665438  hitchhiker  6.54659e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5737  tRNA-Met  96.15 
 
 
79 bp  131  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000112746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0604  tRNA-Met  96.15 
 
 
79 bp  131  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000969852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0865  tRNA-Met  96.15 
 
 
79 bp  131  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000813952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5678  tRNA-Met  96.15 
 
 
79 bp  131  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5667  tRNA-Met  96.15 
 
 
79 bp  131  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000879492  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0529  tRNA-Met  96.15 
 
 
79 bp  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1797900000000004e-29 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0282  tRNA-Met  96.15 
 
 
79 bp  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0790  tRNA-Met  96.15 
 
 
79 bp  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3991e-32 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5807  tRNA-Met  96.15 
 
 
79 bp  131  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00231597  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-2  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0970138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5667  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5675  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000376256  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5699  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000350684  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0030  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00091315  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0024  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000157655  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0036  tRNA-Met  97.26 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.465493  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0013  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.0245771 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0039  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0109  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000630943  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0042  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238456  normal  0.634383 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0020  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0014  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0024  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-2  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.527253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-4  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000768608  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0034  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0023  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000339625  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0058  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000407746  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0027  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0920329  hitchhiker  0.000285559 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0006  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.0000000000568844  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0022  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000159989  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0042  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0290864  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0020  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0013  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0557998  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0014  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0018085  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0023  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.247152  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0069  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0035  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.575749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna34  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.775098  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0068  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0016  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69639  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0046  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.363544  normal  0.0435272 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0016  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0676778  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0014  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0043  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>