More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Met-3 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  tRNA-Met-3  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.390156  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0046  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6011  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.991195 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0007  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0188037  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0054  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.965262  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0081  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.681899  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0076  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00786304  normal  0.218816 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0036  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0068  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.347514  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0049  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0058  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0349408  decreased coverage  0.0094622 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0043  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.343772 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0039  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0035  tRNA-Met  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0055  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0012  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0038  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21039  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0007  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0088  tRNA-Met  94.59 
 
 
74 bp  115  2e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-3  tRNA-Met  94.59 
 
 
74 bp  115  2e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-4  tRNA-Met  94.59 
 
 
74 bp  115  2e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.567742  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-5  tRNA-Met  94.59 
 
 
74 bp  115  2e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0026  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0027  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0057  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492622  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0056  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0045  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0060  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0054  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA11  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113777  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0063  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00364456  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0025  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.279282  normal  0.0688605 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0021    93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.24709  hitchhiker  0.00028661 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0019  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0084  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0249486  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0068  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0032  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0335468  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0473  tRNA-Met  94.81 
 
 
76 bp  113  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0073  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  8.21998e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0046  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0048  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.459863  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0022  tRNA-Met  94.44 
 
 
77 bp  111  2e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t058  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0442009  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3199t  tRNA-Met  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.976924  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3203t  tRNA-Met  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3197t  tRNA-Met  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3201t  tRNA-Met  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0021  tRNA-Met  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.114788  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0068  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.368098  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6553  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4553  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0060  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00315069  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0062  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0035  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0055  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0007  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.737492  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4581  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0059  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.644136  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1081  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.599791  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0263  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0067  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0059  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0044  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.801756  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0045  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0059  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1788  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0993553  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1580  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0010  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  5.63126e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1016  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0036  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0683362 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0015  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0025  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0370437  normal  0.116281 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0024  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0236841  normal  0.117231 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0023  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_R0068  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0060  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.514034  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0053  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.668184 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0041  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.485765 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6556  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0069  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0043  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.399945  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0009  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0489  tRNA-Met  93.51 
 
 
76 bp  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.107964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0228  tRNA-Met  93.51 
 
 
76 bp  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.883109  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0046  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt12  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0037  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0041  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0078  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0061  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464968  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0079  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0229  tRNA-Met  93.51 
 
 
76 bp  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0037  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0023  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0080  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00406069  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4356  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4351  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4307  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0026  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0076  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.195191  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>