154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Gln-1 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  100 
 
 
75 bp  149  1e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0049  tRNA-Gln  93.33 
 
 
75 bp  109  9e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.0255901 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0012  tRNA-Gln  92 
 
 
75 bp  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.376695  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0001  tRNA-Gln  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.275531 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0002  tRNA-Gln  90.54 
 
 
75 bp  91.7  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0051  tRNA-Gln  89.33 
 
 
75 bp  85.7  1e-15  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0079  tRNA-Gln  91.18 
 
 
74 bp  79.8  8e-14  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  88.89 
 
 
72 bp  79.8  8e-14  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0070  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  1.11082e-06  normal  0.043537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0041  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.96114e-06  hitchhiker  2.77547e-11 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0012  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12185  normal  0.483393 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6012  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0072  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  1.24926e-06  normal  0.0423905 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0022  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.310652  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0074  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  7.39317e-06  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0011  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305007  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0033  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0036  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  3e-13  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0023  tRNA-Gln  86.67 
 
 
75 bp  69.9  8e-11  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0444305  normal  0.71139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0014  tRNA-Gln  86.67 
 
 
75 bp  69.9  8e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.349887  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0016  tRNA-Gln  86.67 
 
 
75 bp  69.9  8e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160581  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0047  tRNA-Gln  86.67 
 
 
75 bp  69.9  8e-11  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.907945  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0022  tRNA-Gln  86.67 
 
 
75 bp  69.9  8e-11  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.827155  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0008  tRNA-Gln  86.67 
 
 
75 bp  69.9  8e-11  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.865665  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0021  tRNA-Gln  86.67 
 
 
75 bp  69.9  8e-11  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0591367 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0074  tRNA-Gln  86.67 
 
 
75 bp  69.9  8e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.181678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0064  tRNA-Gln  86.67 
 
 
75 bp  69.9  8e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0043  tRNA-Gln  86.67 
 
 
75 bp  69.9  8e-11  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.394082  normal 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  86.67 
 
 
75 bp  69.9  8e-11  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00709266  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0069  tRNA-Gln  86.67 
 
 
75 bp  69.9  8e-11  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476746  normal  0.206288 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0036  tRNA-Gln  86.67 
 
 
75 bp  69.9  8e-11  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  4.27859e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  86.67 
 
 
75 bp  69.9  8e-11  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0017  tRNA-Gln  86.67 
 
 
75 bp  69.9  8e-11  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0205795  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4327  tRNA-Gln  86.67 
 
 
75 bp  69.9  8e-11  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0022  tRNA-Gln  86.67 
 
 
75 bp  69.9  8e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598023  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0024  tRNA-Gln  89.47 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0040  tRNA-Gln  86.84 
 
 
76 bp  63.9  5e-09  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  2.47527e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0515  tRNA-Gln  93.18 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0048  tRNA-Gln  86.11 
 
 
72 bp  63.9  5e-09  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509197 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t06  tRNA-Gln  93.18 
 
 
72 bp  63.9  5e-09  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0008  tRNA-Gln  93.18 
 
 
75 bp  63.9  5e-09  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.970868  normal  0.737558 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0007  tRNA-Gln  93.18 
 
 
75 bp  63.9  5e-09  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.791549  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0025  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  2e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0035  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  2e-08  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.446482  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0018  tRNA-Gln  97.14 
 
 
75 bp  61.9  2e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000387356  hitchhiker  1.87085e-08 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA16  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  2e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4346  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  2e-08  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.850854  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0016  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  2e-08  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194756  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0041  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  2e-08  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0017  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  2e-08  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  2.20842e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0028  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  2e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0064  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  2e-08  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00065623  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0029  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  2e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0004  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  2e-08  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.40819e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1847  tRNA-Gln  92.16 
 
 
73 bp  61.9  2e-08  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0046  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  2e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.11041  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0092  tRNA-Gln  94.59 
 
 
74 bp  58  3e-07  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.603959  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0006  tRNA-Gln  85.51 
 
 
75 bp  58  3e-07  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.404831 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0829  tRNA-Gln  92.68 
 
 
77 bp  58  3e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  7.99298e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0049  tRNA-Gln  84.72 
 
 
72 bp  56  1e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859256  hitchhiker  2.16539e-07 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1924  tRNA-Gln  88.46 
 
 
75 bp  56  1e-06  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00590264  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0168  tRNA-Gln  84.72 
 
 
72 bp  56  1e-06  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0236  tRNA-Gln  88.46 
 
 
75 bp  56  1e-06  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0012758  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0032  tRNA-Gln  84.72 
 
 
72 bp  56  1e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  3.08987e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0127  tRNA-Gln  84 
 
 
75 bp  54  5e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.19757e-05  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0109  tRNA-Gln  84 
 
 
75 bp  54  5e-06  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  9.80988e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0117  tRNA-Gln  84 
 
 
75 bp  54  5e-06  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.21705e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0126  tRNA-Gln  84 
 
 
75 bp  54  5e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.74735e-05  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0118  tRNA-Gln  84 
 
 
75 bp  54  5e-06  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.19427e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0029  tRNA-Gln  84 
 
 
75 bp  54  5e-06  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0046  tRNA-Gln  84 
 
 
75 bp  54  5e-06  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.53716e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0103  tRNA-Gln  84 
 
 
75 bp  54  5e-06  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  5.61751e-07  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0110  tRNA-Gln  84 
 
 
75 bp  54  5e-06  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  3.74074e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0101  tRNA-Gln  84 
 
 
75 bp  54  5e-06  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  2.60011e-06  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0019  tRNA-Gln  84 
 
 
75 bp  54  5e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349932  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0017  tRNA-Gln  84 
 
 
75 bp  54  5e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.37477e-05  normal  0.142924 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0104  tRNA-Gln  84 
 
 
75 bp  54  5e-06  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  5.37672e-07  normal  0.102798 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0053  tRNA-Gln  87.04 
 
 
72 bp  52  2e-05  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  6.8806e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0052  tRNA-Gln  85.48 
 
 
72 bp  52  2e-05  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0062  tRNA-Gln  89.13 
 
 
77 bp  52  2e-05  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866763  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0046  tRNA-Gln  89.13 
 
 
77 bp  52  2e-05  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.450062 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0009  tRNA-Gln  89.13 
 
 
77 bp  52  2e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0016  tRNA-Gln  87.04 
 
 
72 bp  52  2e-05  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  3.63551e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t011  tRNA-Gln  84.85 
 
 
75 bp  52  2e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  8.94711e-10  hitchhiker  5.11472e-10 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t012  tRNA-Gln  84.85 
 
 
75 bp  52  2e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.1091e-08  hitchhiker  4.74372e-10 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0795  tRNA-Gln  90.24 
 
 
75 bp  50.1  7e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000207498  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0735  tRNA-Gln  90.24 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  5.20956e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0794  tRNA-Gln  90.24 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000236079  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0761  tRNA-Gln  90.24 
 
 
75 bp  50.1  7e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.67269e-07  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0033  tRNA-Gln  90.24 
 
 
75 bp  50.1  7e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  3.63695e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0736  tRNA-Gln  90.24 
 
 
75 bp  50.1  7e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  5.56049e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0830  tRNA-Gln  90.24 
 
 
75 bp  50.1  7e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  7.84737e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0001  tRNA-Gln  85.96 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.587536  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0721  tRNA-Gln  90.24 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.53053e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0722  tRNA-Gln  90.24 
 
 
75 bp  50.1  7e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  9.07062e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0782  tRNA-Gln  90.24 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  7.22917e-05  normal  0.446267 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0783  tRNA-Gln  90.24 
 
 
75 bp  50.1  7e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  5.82426e-06  normal  0.4419 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0760  tRNA-Gln  90.24 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.352e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0069  tRNA-Gln  85.96 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0063  tRNA-Gln  90.24 
 
 
75 bp  50.1  7e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0160878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>