More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0088 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  526  1e-148  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  48.41 
 
 		 249 aa  254  7e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  47.62 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  34.65 
 
 		 254 aa  155  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  36.15 
 
 		 244 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  37.4 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  36.61 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  36.22 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  37.01 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  37.01 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  32.1 
 
 		 242 aa  149  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  36.47 
 
 		 243 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 245 aa  149  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  36.47 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  36.61 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  34.1 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  34.13 
 
 		 254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  35.25 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  34.38 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  34.02 
 
 		 252 aa  141  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  34.88 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 250 aa  140  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6769  transcriptional regulator, MerR family  35.27 
 
 		 254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.220453  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  33.97 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  31.37 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 252 aa  122  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  29.15 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  28.92 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  29.37 
 
 		 253 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  30.56 
 
 		 252 aa  118  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  30.74 
 
 		 254 aa  117  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  26.02 
 
 		 278 aa  115  8.999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  30.47 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  29.64 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  29.69 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  28.17 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  29.03 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  24.29 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  25.4 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  28.86 
 
 		 252 aa  99.4  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  27.93 
 
 		 284 aa  96.3  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0134  transcriptional regulator, MerR family  32.1 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 251 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 251 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  30.04 
 
 		 244 aa  95.5  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  27.67 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  28.35 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0639  transcriptional regulator, MerR family  30.34 
 
 		 261 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0217  transcriptional regulator, MerR family  30.8 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  23.24 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  25.47 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  27.17 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  37.37 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2840  MerR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  43.21 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0837  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1021  transcriptional regulator, MerR family  37.74 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10693e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  38.18 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  29.44 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5021  MerR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0829  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  26.24 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1826  MerR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  45.71 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  39.76 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  39.76 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4916  multidrug-efflux transporter 1 regulator  47.54 
 
 		 64 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0877  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0931  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  38.53 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2871  TipAS antibiotic-recognition  29.38 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1107  transcriptional regulator, MerR family  46.38 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0275  transcriptional regulator, MerR family  37.97 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.524855  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  37.35 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  37 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  34.62 
 
 		 314 aa  65.5  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>