72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0077 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006365  plpp0077  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  555  1e-157  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  hitchhiker  0.00231876  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1405  hypothetical protein  81.2 
 
 
266 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1588  hypothetical protein  80.83 
 
 
266 aa  452  1e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0389  Beta-lactamase  45.12 
 
 
281 aa  230  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.384736 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0373  beta-lactamase precursor  40.38 
 
 
269 aa  200  2e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313009  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2719  class D beta-lactamase  40.77 
 
 
269 aa  199  4e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.886076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2872  class D beta-lactamase  40.77 
 
 
269 aa  198  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314604  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02005  oxacillin hydrolase  41.3 
 
 
272 aa  197  1e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1106  class D beta-lactamase  40.38 
 
 
473 aa  197  1e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.56971  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4544  Beta-lactamase  39.84 
 
 
266 aa  197  2e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.487352  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2849  Beta-lactamase  41.27 
 
 
269 aa  196  2e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3379  Beta-lactamase  40.43 
 
 
320 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4137  Beta-lactamase  40.43 
 
 
270 aa  190  3e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4788  Beta-lactamase  40.43 
 
 
270 aa  190  3e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.802032  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3930  Beta-lactamase  39.83 
 
 
275 aa  185  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.204659 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3817  Beta-lactamase  39.83 
 
 
275 aa  185  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485737 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1053  beta-lactamase class D  37.8 
 
 
295 aa  183  2e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1441  Beta-lactamase  41.98 
 
 
279 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.653891 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0184  Beta-lactamase  38.36 
 
 
288 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2637  Beta-lactamase  34.54 
 
 
279 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.578583  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0412  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.87 
 
 
283 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0605163 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0951  Beta-lactamase  34.18 
 
 
268 aa  101  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3016  Beta-lactamase  30.41 
 
 
264 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.535281 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0483  putative beta-lactamase  33.17 
 
 
303 aa  99  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0120  Beta-lactamase  29.9 
 
 
262 aa  99  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0837  beta-lactamase, putative  32.26 
 
 
265 aa  99  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1887  beta-lactamase class D  30.23 
 
 
272 aa  97.8  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.131226  normal  0.0179427 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3962  Beta-lactamase  31.98 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4075  Beta-lactamase  31.98 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.709144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8961  Beta-lactamase  32.08 
 
 
302 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3440  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.48 
 
 
265 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal  0.234091 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3353  Beta-lactamase  30.73 
 
 
277 aa  95.9  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3328  Beta-lactamase  31.48 
 
 
265 aa  95.5  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.306621  normal  0.885767 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0694  Beta-lactamase  31.48 
 
 
265 aa  95.9  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  5.96311e-06  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  34.54 
 
 
596 aa  95.5  8e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3398  Beta-lactamase  29.61 
 
 
272 aa  95.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.130069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2340  twin-arginine translocation pathway signal  27.31 
 
 
272 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0669803  normal  0.380486 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1050  Beta-lactamase  32.5 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250127 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3220  Beta-lactamase  29.15 
 
 
268 aa  94  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0828246  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2332  Beta-lactamase  27.92 
 
 
266 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.428372  normal  0.506587 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1109  Beta-lactamase  31.78 
 
 
261 aa  92.8  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00564969  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0838  Beta-lactamase  30.81 
 
 
295 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  4.82216e-05 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5028  Beta-lactamase (OXA-5), class D  29.03 
 
 
272 aa  92.4  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1596  Beta-lactamase  30.96 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.569759  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3124  Beta-lactamase  28.06 
 
 
271 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0301  Beta-lactamase  29.44 
 
 
264 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  2.9774e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3157  Beta-lactamase  30.73 
 
 
270 aa  91.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3522  Beta-lactamase  30.3 
 
 
295 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0845  Beta-lactamase  30.3 
 
 
295 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.965986  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3505  Beta-lactamase  26.09 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0813  Beta-lactamase  30.3 
 
 
295 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00568131  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6316  beta-lactamase PSE-2  30.2 
 
 
262 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  30.61 
 
 
585 aa  89.7  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  30.61 
 
 
585 aa  89.7  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  30.61 
 
 
585 aa  89.7  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72760  putative beta-lactamase  29 
 
 
262 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40823  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2040  Beta-lactamase  29.41 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1435  Beta-lactamase  31.8 
 
 
262 aa  86.3  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0427  Beta-lactamase  27.36 
 
 
306 aa  84.7  1e-15  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2220  beta-lactamase  31.98 
 
 
282 aa  84.3  2e-15  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.526982  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0344  beta-lactamase  27.23 
 
 
253 aa  84  3e-15  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148651  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2477  Beta-lactamase  28.84 
 
 
260 aa  79  8e-14  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0424  Beta-lactamase  27.5 
 
 
271 aa  77  3e-13  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1383  conserved hypothetical protein, possible beta-lactamase  27.24 
 
 
248 aa  76.3  5e-13  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0907  Beta-lactamase  26.2 
 
 
267 aa  75.1  1e-12  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.175545  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1460  regulatory protein BlaR1  26.73 
 
 
585 aa  74.7  2e-12  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000102574  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2825  Beta-lactamase  27.45 
 
 
405 aa  73.9  3e-12  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.141892  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2748  Beta-lactamase  27.45 
 
 
585 aa  73.6  3e-12  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.282517  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0211  Beta-lactamase  22.99 
 
 
274 aa  73.2  4e-12  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0004  regulatory protein BlaR1  27.18 
 
 
585 aa  72.8  5e-12  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0356117  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1276  Beta-lactamase  26.87 
 
 
272 aa  71.6  1e-11  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.261729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 
639 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>