More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0002 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006365  plpp0002  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  825    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00393773  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0035  putative protein sopA  84.58 
 
 		 406 aa  717    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0067  plasmid partition protein A  84.58 
 
 		 406 aa  718    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4177  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.76 
 
 		 387 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  31.7 
 
 		 405 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0007  plasmid-partitioning protein SopA  33.85 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.26 
 
 		 407 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0073  plasmid-partitioning protein SopA  33.76 
 
 		 391 aa  180  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728582 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0045  plasmid-partitioning protein SopA  33.25 
 
 		 385 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0022  plasmid-partitioning protein SopA  33.76 
 
 		 388 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19504  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4250  plasmid-partitioning protein SopA  33.16 
 
 		 388 aa  179  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.100676 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.65 
 
 		 404 aa  179  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7789  plasmid partitioning protein RepA  30.83 
 
 		 405 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.45198  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.3 
 
 		 420 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4789  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.18 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.076168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6017  plasmid partitioning protein RepA  30.79 
 
 		 398 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0237613  normal  0.19813 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  30.05 
 
 		 399 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  30.81 
 
 		 403 aa  172  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.19 
 
 		 397 aa  172  9e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6108  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.83 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  28.57 
 
 		 405 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  30.29 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7172  plasmid partitioning protein RepA  29.82 
 
 		 398 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300814 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7204  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.5 
 
 		 383 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  30.15 
 
 		 420 aa  169  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  30.93 
 
 		 409 aa  169  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  28.3 
 
 		 405 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.66 
 
 		 410 aa  168  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4023  ATPase, ParA type  30.1 
 
 		 392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5873  plasmid partitioning protein RepA  29.37 
 
 		 405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128849  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.44 
 
 		 383 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0009  plasmid-partitioning protein SopA  30.14 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0766545 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  30.61 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  29.07 
 
 		 404 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5377  plasmid partitioning protein RepA  28.76 
 
 		 405 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408708  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.76 
 
 		 391 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0001  putative replication protein A  28.05 
 
 		 408 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  29.02 
 
 		 408 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  28.61 
 
 		 405 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4023  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03067  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  27.74 
 
 		 408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4711  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.39 
 
 		 404 aa  154  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  27.3 
 
 		 397 aa  153  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  30.39 
 
 		 397 aa  153  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.18 
 
 		 401 aa  152  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.11 
 
 		 404 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  29.32 
 
 		 408 aa  150  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6162  plasmid partitioning protein RepA  28.4 
 
 		 404 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.49965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  30.13 
 
 		 397 aa  150  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5035  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.72 
 
 		 399 aa  150  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4671  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.49 
 
 		 397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  29.64 
 
 		 371 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  29.4 
 
 		 408 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  28.3 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6054  plasmid partitioning protein RepA  30.83 
 
 		 398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5337  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.89 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  27.76 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  28.57 
 
 		 394 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.47 
 
 		 405 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.42 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.73 
 
 		 408 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.46 
 
 		 400 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4689  plasmid partitioning protein RepA  29.92 
 
 		 402 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10454  normal  0.803552 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3591  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.98 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.35 
 
 		 398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.23 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4456  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.31 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.3 
 
 		 404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4213  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.49 
 
 		 466 aa  132  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3948  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.54 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0159296  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.21 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4322  hypothetical protein  26 
 
 		 435 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131093 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3692  hypothetical protein  26.21 
 
 		 468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.576535  normal  0.38395 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2483  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  26 
 
 		 435 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.111676  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.1 
 
 		 397 aa  126  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1423  ParA family ATPase  25.97 
 
 		 468 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273364  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3855  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.48 
 
 		 463 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.743489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6315  plasmid partitioning ATPase ParA  26.81 
 
 		 396 aa  123  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.68 
 
 		 303 aa  122  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3887  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.66 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.54 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3406  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.73 
 
 		 487 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.798032 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4082  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.6 
 
 		 484 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.525863  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.85 
 
 		 329 aa  120  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.83 
 
 		 352 aa  119  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3840  ATPase, ParA type  25.49 
 
 		 484 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535208  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.41 
 
 		 317 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.22 
 
 		 329 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4242  hypothetical protein  25.49 
 
 		 484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.514474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.62 
 
 		 309 aa  116  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.71 
 
 		 287 aa  115  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  33.98 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3773  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.51 
 
 		 469 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200831  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0095  plasmid partition protein ParA  22.31 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.82 
 
 		 362 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.16 
 
 		 402 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4451  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.31 
 
 		 399 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.375885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4546  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.31 
 
 		 399 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.931063  normal  0.514808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>