More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene pE33L466_0046 on replicon NC_007103
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  88.54 
 
 
516 aa  905    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  90.68 
 
 
516 aa  919    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  91.07 
 
 
516 aa  924    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  90.49 
 
 
516 aa  917    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  90.68 
 
 
516 aa  919    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  90.68 
 
 
516 aa  919    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  100 
 
 
532 aa  1055    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  90.68 
 
 
516 aa  919    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  90.49 
 
 
516 aa  917    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  90.68 
 
 
516 aa  919    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  90.29 
 
 
516 aa  915    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  56.92 
 
 
505 aa  581  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  57.2 
 
 
504 aa  579  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  56.32 
 
 
505 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  55.93 
 
 
505 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  55.93 
 
 
505 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  55.93 
 
 
505 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  55.73 
 
 
505 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  55.73 
 
 
505 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  55.73 
 
 
505 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  56.8 
 
 
504 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  55.56 
 
 
504 aa  571  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  53.4 
 
 
503 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  52.4 
 
 
498 aa  547  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  48.23 
 
 
523 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  45.83 
 
 
508 aa  430  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  44.72 
 
 
546 aa  426  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  41.02 
 
 
577 aa  419  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  44.67 
 
 
490 aa  417  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  43.11 
 
 
506 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  45.04 
 
 
525 aa  412  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  43.05 
 
 
548 aa  412  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  43.05 
 
 
548 aa  412  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  44.06 
 
 
531 aa  412  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6409  choline/carnitine/betaine transporter  40.54 
 
 
585 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  44.52 
 
 
659 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  44.3 
 
 
659 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  42.46 
 
 
530 aa  403  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  40.75 
 
 
600 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  44.4 
 
 
520 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  44.4 
 
 
520 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  40.55 
 
 
657 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  42.69 
 
 
497 aa  395  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  42.55 
 
 
551 aa  397  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  45.12 
 
 
550 aa  393  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  41.57 
 
 
544 aa  393  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  39.16 
 
 
573 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  41.68 
 
 
545 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  39.18 
 
 
583 aa  391  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  39.92 
 
 
573 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  42.54 
 
 
526 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  37.5 
 
 
610 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1132  choline/carnitine/betaine transporter  37.62 
 
 
574 aa  385  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  42.52 
 
 
637 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  38.49 
 
 
582 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1122  transporter, BCCT family protein  48.04 
 
 
515 aa  382  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  41.67 
 
 
531 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  38.22 
 
 
582 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2914  choline/carnitine/betaine transporter  39 
 
 
611 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34631  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  41.99 
 
 
661 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  36.94 
 
 
573 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  38.22 
 
 
582 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00590  choline/carnitine/betaine transport  39.02 
 
 
592 aa  381  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0767816  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  39.56 
 
 
494 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  44.11 
 
 
542 aa  380  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  42.31 
 
 
606 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  38.9 
 
 
580 aa  382  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0184  BCCT transporter  39.23 
 
 
602 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2025  choline/carnitine/betaine transporter  43.33 
 
 
533 aa  378  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3326  choline/carnitine/betaine transporter  44.8 
 
 
525 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188195  normal  0.774831 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  39.76 
 
 
667 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  40.85 
 
 
538 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  41.09 
 
 
656 aa  375  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2288  choline/carnitine/betaine transporter  38.06 
 
 
582 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  39.41 
 
 
685 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  42.19 
 
 
580 aa  371  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3628  choline/carnitine/betaine transporter  37.69 
 
 
581 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  42.64 
 
 
682 aa  370  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1362  choline/carnitine/betaine transport  43.06 
 
 
673 aa  372  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000623924  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2676  choline/carnitine/betaine transporter  37.19 
 
 
582 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3341  choline/carnitine/betaine transporter  41.23 
 
 
637 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2105  choline/carnitine/betaine transporter  38.06 
 
 
581 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  42.83 
 
 
661 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  40.92 
 
 
524 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  40.19 
 
 
530 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  39 
 
 
603 aa  366  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  45 
 
 
660 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  42.02 
 
 
606 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  41.38 
 
 
682 aa  367  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  40.79 
 
 
583 aa  364  3e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1441  choline/carnitine/betaine transporter  43.09 
 
 
658 aa  363  4e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3716  choline/carnitine/betaine transporter  37.06 
 
 
629 aa  361  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.903721  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25390  choline/carnitine/betaine transport  40.4 
 
 
514 aa  360  3e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.229483  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4142  choline/carnitine/betaine transporter  39.45 
 
 
602 aa  359  6e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  39.1 
 
 
646 aa  359  6e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  41.03 
 
 
541 aa  359  7e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1337  choline/carnitine/betaine transport  40.77 
 
 
687 aa  359  9e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1542  choline/carnitine/betaine transporter  43.09 
 
 
658 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.869304  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1805  choline/carnitine/betaine transporter  43.13 
 
 
664 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.376035  hitchhiker  0.00814736 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2804  choline/carnitine/betaine transporter  43.09 
 
 
658 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>