274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lppt10 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lppt10  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt10  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  97.22 
 
 		 74 bp  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2370  tRNA-Gly  97.22 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00487087  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0040  tRNA-Gly  97.22 
 
 		 74 bp  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.983411  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 74 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00109047  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 74 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.951593  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0036  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 74 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.048485  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0077  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 74 bp  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000000693473  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 74 bp  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0062  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 74 bp  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0005  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  103  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000162881  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt05  tRNA-Gly  93.06 
 
 		 74 bp  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt05  tRNA-Gly  93.06 
 
 		 74 bp  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0309  tRNA-Gly  93.06 
 
 		 74 bp  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0054  tRNA-Gly  93.06 
 
 		 74 bp  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.809782  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0005  tRNA-Gly  93.06 
 
 		 74 bp  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000107449  hitchhiker  0.00000669742 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0056  tRNA-Gly  93.06 
 
 		 74 bp  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0001  tRNA-Gly  93.06 
 
 		 74 bp  103  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0030  tRNA-Gly  93.06 
 
 		 74 bp  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000137956  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0049  tRNA-Gly  93.06 
 
 		 74 bp  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  0.991667 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0026  tRNA-Gly  93.06 
 
 		 74 bp  103  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0011  tRNA-Gly  93.06 
 
 		 74 bp  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0110  tRNA-Gly  92.96 
 
 		 71 bp  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0032  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000435638  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0032  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000507298  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0004  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0263126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0071  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000022788  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0071  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000447795  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0004  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.017851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0004  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0013  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25240  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0029  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000023442  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0032  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.274432  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0067  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.294367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0060  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0043  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000110087  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0064  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0059  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0318  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000203347  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0052  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000802106  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0028  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1872  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0196085  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0086  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795168  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35500  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0002  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0003  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1135  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0092  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000423712  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0081  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0459508  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1005  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000280162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0088  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555629  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3118  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3090  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20543  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1514  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0267785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2036  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0008  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0353733  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0061  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.944304  normal  0.76215 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0025  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0024  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0781725  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0025  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.458906 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0744  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3055  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379519  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0025  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.633427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2577  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0033  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.544366 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0057  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0032  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0030  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0538391 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0080  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0050  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0016  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000070019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0028  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0057  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0025  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.896099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0035  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.812042  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0059  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.000543343  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0045  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0153561 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0025  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0051  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.637651  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0004  tRNA-Gly  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786418  normal  0.400526 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26280  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0034  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000457466  normal  0.978086 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09150  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0613367 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna5  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627053  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0053  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000571258  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0020  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00132609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0017  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.77032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0024  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0004  tRNA-Gly  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0001  tRNA-Gly  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.508752  normal  0.0130418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38700  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0014  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.030133  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0040  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0090  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0055  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>