284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2897 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2897  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  530  1e-149  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2750  hypothetical protein  98.03 
 
 
254 aa  519  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0964  hypothetical protein  56.6 
 
 
336 aa  304  8.000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1838  hypothetical protein  55.88 
 
 
333 aa  298  7e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1760  hypothetical protein  55.46 
 
 
330 aa  297  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0425355  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  54.66 
 
 
339 aa  297  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2290  hypothetical protein  55.04 
 
 
333 aa  296  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2261  hypothetical protein  55.04 
 
 
330 aa  296  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000101343  normal  0.473461 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001128  rhodanese domain protein  53.14 
 
 
326 aa  295  6e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331641  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4798  hypothetical protein  54.47 
 
 
341 aa  294  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3407  rhodanese domain-containing protein  52.1 
 
 
328 aa  293  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  54.62 
 
 
309 aa  293  3e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06657  hypothetical protein  52.3 
 
 
326 aa  292  4e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0411  hypothetical protein  53.81 
 
 
352 aa  291  7e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0216  hypothetical protein  52.92 
 
 
326 aa  290  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32074  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2130  hypothetical protein  53.78 
 
 
334 aa  290  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0370  hypothetical protein  53.81 
 
 
352 aa  289  3e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  53.81 
 
 
323 aa  289  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2535  rhodanese domain-containing protein  53.78 
 
 
331 aa  288  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.848457  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01937  hypothetical protein  54.31 
 
 
323 aa  288  8e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00833582  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0115  rhodanese domain-containing protein  55.02 
 
 
306 aa  287  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0878  hypothetical protein  52.97 
 
 
332 aa  286  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000330025  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2481  hypothetical protein  53.78 
 
 
334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000621581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2378  hypothetical protein  53.78 
 
 
334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000317317  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2366  hypothetical protein  53.78 
 
 
334 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000582492  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1981  hypothetical protein  53.36 
 
 
334 aa  284  9e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000899017  hitchhiker  0.0000000957074 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0394  hypothetical protein  52.12 
 
 
337 aa  282  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.845819  hitchhiker  0.00000114431 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  53.65 
 
 
304 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0088  hypothetical protein  52.36 
 
 
314 aa  280  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  53.65 
 
 
302 aa  280  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1781  hypothetical protein  51.26 
 
 
326 aa  280  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1535  hypothetical protein  52.34 
 
 
350 aa  279  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2660  rhodanese domain-containing protein  51.26 
 
 
326 aa  279  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  normal  0.0411957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1365  hypothetical protein  53.22 
 
 
310 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137534  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3956  hypothetical protein  53.22 
 
 
310 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.765325  normal  0.0181852 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2100  hypothetical protein  51.85 
 
 
326 aa  278  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1973  rhodanese domain-containing protein  51.26 
 
 
332 aa  278  6e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000137009  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1758  hypothetical protein  53.22 
 
 
310 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2524  rhodanese domain-containing protein  50.84 
 
 
327 aa  278  8e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3915  rhodanese domain-containing protein  52.99 
 
 
257 aa  277  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1349  hypothetical protein  52.79 
 
 
310 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1693  hypothetical protein  51.07 
 
 
312 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782277  normal  0.169861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4661  hypothetical protein  50 
 
 
312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0559413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53180  hypothetical protein  50 
 
 
312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0682  Rhodanese domain protein  52.14 
 
 
294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3658  hypothetical protein  51.93 
 
 
317 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.451808  normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4090  hypothetical protein  51.5 
 
 
313 aa  272  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1734  rhodanese-like domain protein  51.5 
 
 
317 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.668839  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2825  rhodanese-like protein  53.22 
 
 
305 aa  271  6e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3823  hypothetical protein  51.72 
 
 
314 aa  265  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1939  rhodanese domain-containing protein  44.66 
 
 
316 aa  262  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2782  rhodanese domain-containing protein  50.86 
 
 
315 aa  261  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3401  Rhodanese domain protein  50 
 
 
309 aa  261  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1961  rhodanese-like protein  48.75 
 
 
319 aa  260  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3699  Rhodanese domain protein  49.14 
 
 
309 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2937  rhodanese-like protein  45.9 
 
 
316 aa  258  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.751975  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1091  rhodanese-like domain-containing protein  46.59 
 
 
305 aa  254  7e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4255  rhodanese domain-containing protein  48.05 
 
 
305 aa  249  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1892  rhodanese-like protein  45.64 
 
 
269 aa  249  3e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0081  rhodanese family protein  46.8 
 
 
305 aa  248  5e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0086  rhodanese family protein  46.8 
 
 
308 aa  248  7e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1135  rhodanese domain-containing protein  49.14 
 
 
275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2196  hypothetical protein  47.23 
 
 
255 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1635  rhodanese-like protein  44.49 
 
 
327 aa  236  2e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0011  rhodanese-like protein  45.26 
 
 
301 aa  236  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.921465 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0850  rhodanese domain-containing protein  45.06 
 
 
322 aa  236  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2998  rhodanese-like sulfurtransferase  45.11 
 
 
255 aa  235  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317205  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3659  rhodanese domain-containing protein  42.92 
 
 
322 aa  234  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245407  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3418  rhodanese domain-containing protein  44.73 
 
 
317 aa  233  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0529326  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1078  rhodanese-like protein  44.26 
 
 
255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0473759  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1677  rhodanese domain-containing protein  44.73 
 
 
311 aa  229  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0239386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  43.15 
 
 
555 aa  230  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3429  rhodanese-like protein  46.32 
 
 
299 aa  223  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10921  sulfurtransferase  43.88 
 
 
320 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0147  rhodanese-like protein  42.06 
 
 
242 aa  223  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.744417  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3348  rhodanese domain protein  45.45 
 
 
313 aa  221  6e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.305803  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0255  rhodanese domain-containing protein  44.86 
 
 
302 aa  221  7e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1395  rhodanese-like protein  41.2 
 
 
305 aa  221  8e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0206  rhodanese-like protein  44.44 
 
 
274 aa  218  6e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0896  rhodanese domain-containing protein  45.15 
 
 
275 aa  217  2e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.259251  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1235  rhodanese domain-containing protein  42.13 
 
 
312 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0119154 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14861  sulfurtransferase  42.62 
 
 
319 aa  215  5e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.612505 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0654  rhodanese-like  43.04 
 
 
319 aa  214  8e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.597958  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09971  sulfurtransferase  42.02 
 
 
310 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1434  hypothetical protein  40.43 
 
 
328 aa  194  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0127519  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1859  Rhodanese domain protein  42.22 
 
 
314 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52383  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12001  sulfurtransferase  41.98 
 
 
310 aa  192  6e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.982527  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1105  rhodanese-like protein  42.45 
 
 
310 aa  192  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4043  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 
263 aa  192  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0638463 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0588  hypothetical protein  39.92 
 
 
327 aa  191  8e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000631193  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2316  hypothetical protein  40.34 
 
 
320 aa  190  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12011  sulfurtransferase  41 
 
 
310 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.303044  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2206  rhodanese superfamily protein  40 
 
 
282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2770  hypothetical protein  39.38 
 
 
318 aa  188  5.999999999999999e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.302608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2713  hypothetical protein  39.38 
 
 
318 aa  188  5.999999999999999e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0311305  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1324  hypothetical protein  38.36 
 
 
319 aa  188  5.999999999999999e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0753  rhodanese superfamily protein  40.16 
 
 
282 aa  188  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0476  hypothetical protein  40.33 
 
 
328 aa  187  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.217138  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2404  rhodanese superfamily protein  38.78 
 
 
287 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954244  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2535  rhodanese superfamily protein  38.37 
 
 
282 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>