More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2680 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2680  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  818    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2552  hypothetical protein  96.18 
 
 
393 aa  794    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  59.19 
 
 
393 aa  480  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  57.03 
 
 
392 aa  471  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  57.5 
 
 
399 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  57.36 
 
 
393 aa  474  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  57.03 
 
 
392 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  56.23 
 
 
392 aa  463  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  55.89 
 
 
394 aa  464  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4487  HI0933 family protein  57.5 
 
 
399 aa  464  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  57.18 
 
 
460 aa  458  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  56.93 
 
 
460 aa  458  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  55.7 
 
 
397 aa  458  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  57.18 
 
 
398 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  54.68 
 
 
398 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  55.78 
 
 
413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  54.68 
 
 
398 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  54.43 
 
 
398 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  54.68 
 
 
398 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  54.68 
 
 
398 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  54.85 
 
 
401 aa  451  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  56.92 
 
 
411 aa  449  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  51.92 
 
 
392 aa  448  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  55.87 
 
 
398 aa  449  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  55.08 
 
 
394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  55.84 
 
 
394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0515  hypothetical protein  55.53 
 
 
392 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0623  hypothetical protein  55.14 
 
 
428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1635  hypothetical protein  52.1 
 
 
405 aa  445  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4838  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  56.46 
 
 
400 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  55.22 
 
 
392 aa  446  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  55.58 
 
 
393 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0223  HI0933 family protein  56.2 
 
 
400 aa  442  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0476  hypothetical protein  57.47 
 
 
394 aa  442  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  54.8 
 
 
397 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  54.71 
 
 
397 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  55.84 
 
 
394 aa  442  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3830  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  56.2 
 
 
400 aa  442  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4826  hypothetical protein  56.43 
 
 
393 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270305  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  55.58 
 
 
394 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03341  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  55.95 
 
 
400 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.542782  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4953  hypothetical protein  56.17 
 
 
393 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683781  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5002  hypothetical protein  56.17 
 
 
393 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.32275  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3781  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  55.95 
 
 
400 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3974  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  56.2 
 
 
400 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03294  hypothetical protein  55.95 
 
 
400 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3691  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  56.2 
 
 
400 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3115  FAD-dependent oxidoreductase of HI0933-like family protein  56.28 
 
 
400 aa  438  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0224  hypothetical protein  56.2 
 
 
400 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0801  hypothetical protein  55.78 
 
 
395 aa  438  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  54.8 
 
 
397 aa  438  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  55.33 
 
 
394 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  55.58 
 
 
394 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  55.33 
 
 
394 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  54.82 
 
 
394 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  55.13 
 
 
396 aa  436  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5008  conserved hypothetical protein TIGR00275  55.15 
 
 
392 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  54.57 
 
 
394 aa  435  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  51.77 
 
 
396 aa  437  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  53.33 
 
 
396 aa  433  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  54.57 
 
 
394 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3906  hypothetical protein  54.57 
 
 
397 aa  434  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2099  hypothetical protein  54.92 
 
 
396 aa  433  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  52.31 
 
 
394 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  54.31 
 
 
394 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1725  hypothetical protein  55.01 
 
 
397 aa  431  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.685186 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  52.04 
 
 
393 aa  432  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  54.24 
 
 
394 aa  431  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4212  hypothetical protein  56.35 
 
 
394 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  51.79 
 
 
393 aa  426  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1513  hypothetical protein  51.65 
 
 
392 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0512  hypothetical protein  54.91 
 
 
410 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  54.1 
 
 
399 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2832  flavoprotein  50.89 
 
 
392 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  51.39 
 
 
394 aa  421  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1463  hypothetical protein  50.38 
 
 
392 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261664  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0183  hypothetical protein  49.18 
 
 
438 aa  412  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0398  HI0933 family protein  52.44 
 
 
406 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00801709 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  51.93 
 
 
393 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3694  HI0933-like protein  52.76 
 
 
398 aa  414  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  49.24 
 
 
393 aa  413  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0202  HI0933-like protein  49.05 
 
 
433 aa  410  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.309698  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  51.15 
 
 
394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1441  HI0933-like protein  51.4 
 
 
394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  51.92 
 
 
392 aa  402  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0366  HI0933 family protein  51.68 
 
 
406 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2555  hypothetical protein  52.73 
 
 
396 aa  398  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00730633  hitchhiker  0.0000156467 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0680  HI0933-like protein  52.17 
 
 
394 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  47.75 
 
 
405 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0691  HI0933 family protein  48.32 
 
 
414 aa  386  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  48.07 
 
 
414 aa  382  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  48.33 
 
 
392 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1831  HI0933-like protein  50.25 
 
 
402 aa  382  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.000611752  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0271  hypothetical protein  48.86 
 
 
401 aa  384  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  47.7 
 
 
393 aa  381  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0499  HI0933 family protein  47.3 
 
 
398 aa  381  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0205832 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1860  HI0933-like protein  50.65 
 
 
381 aa  378  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.479593  normal  0.0118098 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2413  hypothetical protein  48.46 
 
 
390 aa  376  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1232  hypothetical protein  46.41 
 
 
402 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0902529  normal  0.743867 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0137  hypothetical protein  46.62 
 
 
405 aa  372  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>