104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2649 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2649  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  701    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2519  hypothetical protein  98.84 
 
 		 345 aa  694    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00210  lysin domain-containing protein  42.47 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0021  hypothetical protein  42.17 
 
 		 341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156222  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0020  peptidoglycan-binding LysM  39.94 
 
 		 341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0176  LysM domain protein  39.94 
 
 		 341 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0018  peptidoglycan-binding LysM  40.36 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00180  peptidoglycan-binding LysM protein  40.36 
 
 		 341 aa  226  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0309659  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0056  peptidoglycan-binding LysM  37.78 
 
 		 345 aa  225  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3013  peptidoglycan-binding LysM  37.75 
 
 		 345 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0044  peptidoglycan-binding LysM  38.23 
 
 		 338 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0194  peptidoglycan-binding LysM  38.25 
 
 		 383 aa  212  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2629  peptidoglycan-binding LysM  35.69 
 
 		 338 aa  209  7e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.829323  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2842  LysM domain-containing protein  35.47 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0022  hypothetical protein  35.52 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.124597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0188  peptidoglycan-binding LysM  36.34 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749903 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0020  peptidoglycan-binding LysM  34.01 
 
 		 343 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0349  peptidoglycan-binding LysM  34.88 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0885534 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  34.83 
 
 		 388 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  32.25 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2274  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  35.31 
 
 		 389 aa  179  8e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514615 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3861  peptidoglycan-binding LysM  35.13 
 
 		 409 aa  177  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4640  peptidoglycan-binding LysM  33.89 
 
 		 408 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  32.3 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2087  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  32.94 
 
 		 393 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0834  peptidoglycan-binding LysM  33.24 
 
 		 401 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3879  peptidoglycan-binding LysM  32.78 
 
 		 430 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  32.04 
 
 		 364 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  31.74 
 
 		 395 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2136  hypothetical protein  31.09 
 
 		 377 aa  169  7e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2464  peptidoglycan-binding LysM  31.13 
 
 		 377 aa  168  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5114  Peptidoglycan-binding LysM  35.88 
 
 		 405 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3566  peptidoglycan-binding LysM  31.85 
 
 		 358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4083  peptidoglycan-binding LysM  34.56 
 
 		 420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0030  peptidoglycan-binding LysM  30.27 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4687  peptidoglycan-binding LysM  34.09 
 
 		 417 aa  163  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0013  peptidoglycan-binding LysM-like protein  29.7 
 
 		 403 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0028  peptidoglycan-binding LysM  30 
 
 		 374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.198583 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0025  peptidoglycan-binding LysM  31.37 
 
 		 374 aa  162  6e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0036  peptidoglycan-binding LysM  29.73 
 
 		 374 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243599 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0033  LysM domain-containing protein  30.24 
 
 		 378 aa  159  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0077  peptidoglycan-binding LysM  31.58 
 
 		 360 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4050  peptidoglycan-binding LysM  33.79 
 
 		 426 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.021914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0044  LysM domain-containing protein  30.88 
 
 		 346 aa  156  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.764087  normal  0.149636 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0282  putative signal peptide protein  33.14 
 
 		 387 aa  153  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04054  LysM domain protein  31.69 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3395  Peptidoglycan-binding LysM  33.51 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0025  peptidoglycan-binding LysM  30.57 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0032  Peptidoglycan-binding LysM  28.49 
 
 		 376 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235775 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0032  peptidoglycan-binding LysM  28.49 
 
 		 376 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0033  peptidoglycan-binding LysM  28.49 
 
 		 376 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0028  peptidoglycan-binding LysM  28.49 
 
 		 376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0036  peptidoglycan-binding LysM  31.02 
 
 		 367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.971795  normal  0.107314 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0021  LysM domain-containing protein  30.42 
 
 		 361 aa  147  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3735  peptidoglycan-binding LysM  28.76 
 
 		 365 aa  142  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.315042  hitchhiker  0.00230648 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0019  Peptidoglycan-binding LysM  29.8 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0018  LysM domain protein  29.8 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0039  peptidoglycan-binding LysM  29.28 
 
 		 369 aa  139  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.357546 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0025  peptidoglycan-binding LysM  30.77 
 
 		 369 aa  136  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00023  Peptidoglycan-binding LysM  29.25 
 
 		 367 aa  132  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.574097  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3586  Peptidoglycan-binding LysM  26.51 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002058  LysM domain-containing protein  29.26 
 
 		 364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0032  peptidoglycan-binding LysM  28.03 
 
 		 362 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0076  putative cell wall degradation enzyme  31.34 
 
 		 353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00390  hypothetical protein  28.33 
 
 		 364 aa  122  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2472  hypothetical protein  28.89 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0024  peptidoglycan-binding LysM  28.57 
 
 		 359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1930  hypothetical protein  27.91 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1866  peptidoglycan-binding LysM  27.13 
 
 		 384 aa  110  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0530  peptidoglycan-binding LysM  26.28 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3268  Peptidoglycan-binding LysM  28.05 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000361142  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2887  Peptidoglycan-binding LysM  28.12 
 
 		 440 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2794  Peptidoglycan-binding LysM  27.83 
 
 		 440 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0244523  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2701  peptidoglycan-binding LysM  28.45 
 
 		 440 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2866  hypothetical protein  30 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2695  peptidoglycan-binding LysM  25.42 
 
 		 435 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.123815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2551  LysM domain-containing protein  26.89 
 
 		 335 aa  89.7  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3691  peptidoglycan-binding LysM  24.93 
 
 		 340 aa  89.4  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000027016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0889  peptidoglycan-binding LysM  26.1 
 
 		 333 aa  87.8  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000030411  hitchhiker  0.00000000000323717 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0409  LysM domain-containing protein  23.61 
 
 		 333 aa  86.7  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000322112  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1527  Peptidoglycan-binding LysM  26.39 
 
 		 338 aa  86.3  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27524e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2713  Peptidoglycan-binding LysM  26.57 
 
 		 335 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292431  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0537  peptidoglycan-binding LysM  27.37 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201658  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0501  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  25 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  40.68 
 
 		 219 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 		 142 aa  49.7  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  46.81 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  42.55 
 
 		 663 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  43.14 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1755  peptidoglycan-binding LysM  36.92 
 
 		 195 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.273127 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0917  LysM domain/BON superfamily protein  29.49 
 
 		 166 aa  47  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  41.51 
 
 		 1079 aa  46.2  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0326  LysM domain protein  44.68 
 
 		 377 aa  46.2  0.0009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0219877  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  33.85 
 
 		 161 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  33.85 
 
 		 161 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  45.65 
 
 		 389 aa  43.9  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  32.31 
 
 		 158 aa  43.5  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4948  Peptidoglycan-binding LysM  34.38 
 
 		 153 aa  43.5  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  38.18 
 
 		 1051 aa  43.1  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0459  LysM domain/BON superfamily protein  29.23 
 
 		 168 aa  43.1  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>