More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2462 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  741    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  98.88 
 
 
356 aa  734    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  56.98 
 
 
365 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  50.84 
 
 
363 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  52.19 
 
 
365 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  51.6 
 
 
344 aa  377  1e-103  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  49.15 
 
 
360 aa  375  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  49.71 
 
 
355 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  49.71 
 
 
355 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  49.71 
 
 
355 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  48.98 
 
 
353 aa  360  2e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  47.29 
 
 
363 aa  357  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  52.15 
 
 
367 aa  354  1e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  48.69 
 
 
360 aa  351  8.999999999999999e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  49 
 
 
380 aa  348  6e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  48.4 
 
 
376 aa  341  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  47.85 
 
 
360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  48.02 
 
 
356 aa  325  8.000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  46.33 
 
 
369 aa  301  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  45.32 
 
 
360 aa  290  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  40 
 
 
366 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  30.62 
 
 
357 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  30.34 
 
 
357 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  34.12 
 
 
341 aa  176  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  30.43 
 
 
351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  32.16 
 
 
348 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  30.14 
 
 
351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  30.14 
 
 
351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  34.04 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  33.43 
 
 
359 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  31.67 
 
 
360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  31.75 
 
 
348 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  31.16 
 
 
348 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  33.24 
 
 
357 aa  155  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  30.15 
 
 
353 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  31.45 
 
 
348 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  31.16 
 
 
348 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  28.28 
 
 
353 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  30.37 
 
 
357 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  29.34 
 
 
353 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  29.25 
 
 
353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  28.53 
 
 
351 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  28.24 
 
 
351 aa  143  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  30.17 
 
 
418 aa  138  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  28.78 
 
 
348 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  30.55 
 
 
360 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  28.37 
 
 
358 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  27.67 
 
 
351 aa  133  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  28.25 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  31.31 
 
 
343 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 
363 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  27.71 
 
 
350 aa  125  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 
351 aa  123  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  28.18 
 
 
355 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  26.76 
 
 
362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  26.08 
 
 
416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  25.5 
 
 
356 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
779 aa  66.6  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  29.8 
 
 
285 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  29.8 
 
 
285 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  34.95 
 
 
779 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  35.05 
 
 
1676 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  28.1 
 
 
285 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  32.67 
 
 
263 aa  60.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0398  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE, putative  29.32 
 
 
258 aa  59.7  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_341  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase  29.93 
 
 
258 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  25.58 
 
 
274 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 
249 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0377  demethylmenaquinone methyltransferase  29.41 
 
 
258 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370247  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  30 
 
 
269 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 
262 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  33.96 
 
 
402 aa  57.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 
249 aa  57  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  28.8 
 
 
209 aa  56.6  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  30 
 
 
269 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  27.39 
 
 
209 aa  56.6  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  28.16 
 
 
780 aa  56.2  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  31.85 
 
 
189 aa  56.2  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  27.7 
 
 
269 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
280 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.27 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  29.1 
 
 
279 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  30.95 
 
 
253 aa  55.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  34 
 
 
653 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
237 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  27.03 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 
263 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.13 
 
 
402 aa  55.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.13 
 
 
209 aa  54.3  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3565  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.62 
 
 
352 aa  54.3  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  27.2 
 
 
209 aa  54.3  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.36 
 
 
258 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  22.96 
 
 
411 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  27.89 
 
 
355 aa  53.1  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.64 
 
 
270 aa  53.1  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.78 
 
 
259 aa  53.1  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1083  hypothetical protein  26.61 
 
 
254 aa  53.1  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  28.71 
 
 
263 aa  53.1  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  28.71 
 
 
263 aa  53.1  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  28.71 
 
 
263 aa  53.1  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>