More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2262 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
290 aa  594  1e-169  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  99.31 
 
 
290 aa  592  1e-168  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  59.79 
 
 
291 aa  331  7.000000000000001e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  59.79 
 
 
291 aa  331  7.000000000000001e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  55.94 
 
 
292 aa  322  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  54.3 
 
 
292 aa  317  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  54.55 
 
 
292 aa  315  6e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  55.79 
 
 
294 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  54.2 
 
 
292 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  55.05 
 
 
291 aa  311  1e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  55.32 
 
 
286 aa  310  1e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  53.85 
 
 
290 aa  306  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  54.17 
 
 
292 aa  305  8.000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  53.5 
 
 
292 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  53.5 
 
 
292 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  52.23 
 
 
292 aa  300  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  48.47 
 
 
300 aa  300  2e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 
292 aa  298  9e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  53 
 
 
287 aa  297  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  51.89 
 
 
291 aa  296  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  51.19 
 
 
293 aa  295  4e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  51.39 
 
 
297 aa  295  4e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  51.39 
 
 
289 aa  295  5e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  53.29 
 
 
295 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  53.29 
 
 
295 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  51.38 
 
 
290 aa  293  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  52.45 
 
 
292 aa  291  7e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 
294 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  52.6 
 
 
295 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  49.32 
 
 
292 aa  290  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 
292 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
292 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 
290 aa  290  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
292 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
292 aa  290  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
292 aa  290  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  49.15 
 
 
299 aa  289  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
292 aa  290  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  49.15 
 
 
299 aa  289  3e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  50.68 
 
 
292 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 
290 aa  290  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  51.93 
 
 
293 aa  290  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
292 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  49.15 
 
 
293 aa  289  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 
292 aa  288  6e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 
292 aa  288  6e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 
290 aa  288  8e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 
292 aa  287  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  49.32 
 
 
292 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1908  dihydrodipicolinate synthase  52.58 
 
 
293 aa  286  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0114932  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 
290 aa  285  5e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  52.88 
 
 
292 aa  285  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  51.04 
 
 
294 aa  285  7e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 
290 aa  285  9e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1980  dihydrodipicolinate synthase  49.65 
 
 
294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 
294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  49.31 
 
 
296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2552  dihydrodipicolinate synthase  52.13 
 
 
294 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000411762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2667  dihydrodipicolinate synthase  52.13 
 
 
294 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000190321  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1792  dihydrodipicolinate synthase  52.13 
 
 
294 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368333  hitchhiker  0.00000000144356 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
294 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2590  dihydrodipicolinate synthase  52.13 
 
 
294 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000266276  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  50.69 
 
 
297 aa  282  5.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1656  dihydrodipicolinate synthase  52.13 
 
 
294 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1879  dihydrodipicolinate synthase  51.77 
 
 
294 aa  281  9e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  47.24 
 
 
294 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  51.45 
 
 
292 aa  280  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  46.88 
 
 
320 aa  279  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2340  dihydrodipicolinate synthase  51.77 
 
 
294 aa  279  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00299163  hitchhiker  0.000000559319 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2412  dihydrodipicolinate synthase  51.77 
 
 
294 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0470285  hitchhiker  0.00564144 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 
292 aa  279  4e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  49.65 
 
 
294 aa  279  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 
298 aa  279  5e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 
298 aa  279  5e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  48.59 
 
 
319 aa  278  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  49.65 
 
 
297 aa  278  7e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1702  dihydrodipicolinate synthase  51.06 
 
 
294 aa  278  8e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000467042  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
296 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1860  dihydrodipicolinate synthase  49.32 
 
 
293 aa  276  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151494  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 
298 aa  277  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  47.92 
 
 
302 aa  276  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  49.31 
 
 
323 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  49.31 
 
 
292 aa  275  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1864  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
294 aa  275  8e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000003415  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  47.92 
 
 
293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2177  dihydrodipicolinate synthase  47.92 
 
 
294 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000474227  normal  0.485402 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0492  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 
298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  48.58 
 
 
300 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  48.58 
 
 
300 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  48.58 
 
 
300 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  45.83 
 
 
300 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2379  dihydrodipicolinate synthase  49.65 
 
 
293 aa  272  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  51.22 
 
 
290 aa  272  6e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  51.22 
 
 
290 aa  272  6e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  46.88 
 
 
308 aa  271  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>