More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2258 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2258  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  569  1e-161  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2229  hypothetical protein  99.28 
 
 		 279 aa  565  1e-160  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  51.5 
 
 		 280 aa  274  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  51.5 
 
 		 280 aa  273  3e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  46.89 
 
 		 276 aa  244  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  46.57 
 
 		 282 aa  241  9e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  43.91 
 
 		 272 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2810  glutamate racemase  45.52 
 
 		 308 aa  227  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  47.57 
 
 		 266 aa  224  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  42.7 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  45.31 
 
 		 272 aa  219  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  46.06 
 
 		 278 aa  219  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  44.15 
 
 		 288 aa  217  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  45.31 
 
 		 276 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  45.38 
 
 		 272 aa  215  7e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  43.66 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  46.9 
 
 		 278 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1214  glutamate racemase  44.53 
 
 		 268 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0088  glutamate racemase  41.29 
 
 		 311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  39.53 
 
 		 267 aa  208  8e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  43.73 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  44.15 
 
 		 272 aa  207  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  38.78 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  40.89 
 
 		 275 aa  205  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  40.89 
 
 		 275 aa  205  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  43.56 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  43.56 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  43.73 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  37.89 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  37.78 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  38.98 
 
 		 268 aa  195  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  39.54 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  38.64 
 
 		 291 aa  192  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  37.45 
 
 		 274 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  38.15 
 
 		 271 aa  188  8e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  38.4 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  38.64 
 
 		 269 aa  186  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  38.87 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  41.82 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  36.02 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  43.35 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  39.1 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  42.69 
 
 		 259 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  40 
 
 		 281 aa  182  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  41.23 
 
 		 291 aa  181  8.000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  38.93 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0680  glutamate racemase  36.2 
 
 		 281 aa  181  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  37.78 
 
 		 284 aa  179  5.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  39.25 
 
 		 264 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  40.15 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  38.65 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  38.93 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  35.8 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  38.08 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0541  glutamate racemase  41.85 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000256058  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1031  glutamate racemase  39.1 
 
 		 275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00684957  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0806  glutamate racemase  38.35 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0847  glutamate racemase  38.35 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  36.4 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0942  glutamate racemase  38.35 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000979949 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  38.58 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  38.93 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2583  glutamate racemase  38.6 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00016554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0939  glutamate racemase  38.72 
 
 		 275 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  35.97 
 
 		 269 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  35.97 
 
 		 269 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  35.97 
 
 		 269 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  35.97 
 
 		 269 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  35.97 
 
 		 269 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  35.97 
 
 		 269 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  36.12 
 
 		 267 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  35.97 
 
 		 267 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  35.97 
 
 		 269 aa  171  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  35.97 
 
 		 269 aa  171  9e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0755  glutamate racemase  38.72 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  35.97 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  37.69 
 
 		 277 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  38.61 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0885  glutamate racemase  40.08 
 
 		 268 aa  170  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  37.84 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  38.7 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  42.24 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  42.24 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  42.86 
 
 		 276 aa  168  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  33.58 
 
 		 295 aa  169  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  35.91 
 
 		 295 aa  168  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  37.02 
 
 		 270 aa  168  9e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  38.43 
 
 		 276 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  32.21 
 
 		 264 aa  168  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  38.52 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  39.73 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0872  glutamate racemase  39.76 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  37.45 
 
 		 263 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  35.04 
 
 		 271 aa  165  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1323  glutamate racemase  38.72 
 
 		 285 aa  165  9e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.123332  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  38.64 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  37.98 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  37.31 
 
 		 360 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  37.45 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2737  glutamate racemase  37.69 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>