126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2208 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2208  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  593  1e-168  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2180  hypothetical protein  97.56 
 
 
287 aa  579  1e-164  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3392  hypothetical protein  57.03 
 
 
299 aa  351  8e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3517  hypothetical protein  57.03 
 
 
299 aa  350  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3694  hypothetical protein  56.32 
 
 
279 aa  350  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0410237 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4062  hypothetical protein  55.68 
 
 
305 aa  349  3e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3406  hypothetical protein  56.06 
 
 
310 aa  349  4e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1061  hypothetical protein  56.65 
 
 
299 aa  348  7e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359459 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3296  hypothetical protein  56.65 
 
 
299 aa  347  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0967  hypothetical protein  55.6 
 
 
319 aa  345  7e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3398  hypothetical protein  52.92 
 
 
303 aa  344  8e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0783117  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0904  hypothetical protein  55.68 
 
 
312 aa  341  8e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0971  hypothetical protein  55.47 
 
 
293 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1009  hypothetical protein  55.47 
 
 
293 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0975  hypothetical protein  55.51 
 
 
293 aa  333  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2831  hypothetical protein  52.83 
 
 
301 aa  325  7e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2222  hypothetical protein  54.37 
 
 
278 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0527  hypothetical protein  50.91 
 
 
292 aa  301  7.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.754891  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1558  hypothetical protein  51.37 
 
 
283 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.103302 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3267  protein of unknown function DUF692  49.24 
 
 
339 aa  287  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4400  hypothetical protein  48.67 
 
 
278 aa  280  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1262  hypothetical protein  44.94 
 
 
318 aa  278  8e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.328602  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0735  hypothetical protein  48.03 
 
 
294 aa  277  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.291211 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0587  hypothetical protein  43.11 
 
 
313 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0642886  normal  0.716102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1242  hypothetical protein  41.04 
 
 
298 aa  236  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.933604 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2032  hypothetical protein  42.24 
 
 
285 aa  231  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392339  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4790  hypothetical protein  40.81 
 
 
300 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1430  hypothetical protein  42.75 
 
 
307 aa  226  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51935  normal  0.711146 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4684  hypothetical protein  43.51 
 
 
278 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34246  normal  0.868171 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1607  hypothetical protein  42.59 
 
 
320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5938  hypothetical protein  39.15 
 
 
308 aa  225  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002084  hypothetical protein  43.35 
 
 
289 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4384  hypothetical protein  39.63 
 
 
300 aa  223  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0181481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3392  hypothetical protein  40.53 
 
 
300 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0757  hypothetical protein  41.7 
 
 
276 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4647  hypothetical protein  43.23 
 
 
298 aa  222  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0120  hypothetical protein  40.47 
 
 
290 aa  222  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0724  hypothetical protein  39.42 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0732  hypothetical protein  44.4 
 
 
275 aa  221  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00353  hypothetical protein  41.2 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0773  hypothetical protein  39.86 
 
 
316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.91386  normal  0.243423 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0992  hypothetical protein  41.29 
 
 
277 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1029  hypothetical protein  41.29 
 
 
277 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.752115 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6305  hypothetical protein  40.94 
 
 
280 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.380484  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0712  hypothetical protein  44.15 
 
 
275 aa  218  7e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4775  hypothetical protein  39.55 
 
 
290 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0704  hypothetical protein  39.03 
 
 
289 aa  217  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0846  hypothetical protein  41.24 
 
 
311 aa  215  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2174  hypothetical protein  37.09 
 
 
303 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2030  hypothetical protein  37.09 
 
 
293 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5128  hypothetical protein  37.83 
 
 
307 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3066  hypothetical protein  39.93 
 
 
277 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37853  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3130  hypothetical protein  36.88 
 
 
292 aa  207  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0303  hypothetical protein  37.78 
 
 
296 aa  207  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.371477 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2359  hypothetical protein  37.68 
 
 
311 aa  206  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2688  hypothetical protein  39.69 
 
 
297 aa  205  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118004  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2240  hypothetical protein  40.62 
 
 
278 aa  205  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000381376  hitchhiker  0.000876549 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1004  hypothetical protein  38.16 
 
 
290 aa  202  6e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863702  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2081  hypothetical protein  39.25 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3094  hypothetical protein  41.98 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0944  hypothetical protein  39.85 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.98615 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1305  hypothetical protein  38.22 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0297196  normal  0.064547 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1503  hypothetical protein  38.67 
 
 
283 aa  199  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.310146  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3108  hypothetical protein  36.33 
 
 
283 aa  198  9e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01094  hypothetical protein  38.46 
 
 
283 aa  198  9e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0997289  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2398  hypothetical protein  38.81 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3297  hypothetical protein  38.81 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.867164 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2190  hypothetical protein  38.13 
 
 
277 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.84391  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2959  hypothetical protein  34.74 
 
 
298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0652339  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0291  protein of unknown function DUF692  40.07 
 
 
282 aa  196  5.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2857  hypothetical protein  39.06 
 
 
278 aa  195  6e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000347655 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2852  hypothetical protein  37.87 
 
 
281 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.972172  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3962  hypothetical protein  36.5 
 
 
296 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.019618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2003  hypothetical protein  38.91 
 
 
277 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1723  hypothetical protein  39.68 
 
 
283 aa  193  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2620  hypothetical protein  36.26 
 
 
288 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000591272  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1557  hypothetical protein  37.09 
 
 
286 aa  191  8e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.189943  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1764  hypothetical protein  37.12 
 
 
289 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0025937  normal  0.0109092 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2259  hypothetical protein  36.33 
 
 
279 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000651935  normal  0.545232 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2412  hypothetical protein  37.5 
 
 
287 aa  190  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00339272  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2331  hypothetical protein  36.19 
 
 
279 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000989316  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2579  hypothetical protein  36.74 
 
 
289 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00624438  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2695  hypothetical protein  36.36 
 
 
289 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00011236  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2386  hypothetical protein  37.74 
 
 
289 aa  188  8e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000122506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3153  hypothetical protein  39.05 
 
 
280 aa  188  9e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0753442  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1775  hypothetical protein  37.97 
 
 
281 aa  188  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2900  hypothetical protein  36.26 
 
 
282 aa  188  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2307  hypothetical protein  36.78 
 
 
300 aa  188  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2008  hypothetical protein  35.16 
 
 
279 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2450  hypothetical protein  35.8 
 
 
279 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00881658  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1554  hypothetical protein  38.4 
 
 
280 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.220831 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0811  hypothetical protein  33.91 
 
 
313 aa  186  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5627  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1381  hypothetical protein  35.16 
 
 
295 aa  185  7e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0499971  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2550  hypothetical protein  37 
 
 
283 aa  185  7e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.446305  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20741  hypothetical protein  35.85 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1788  hypothetical protein  36.19 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0989  hypothetical protein  36.92 
 
 
276 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2533  hypothetical protein  34.97 
 
 
309 aa  179  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00022761 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1305  hypothetical protein  37.55 
 
 
291 aa  178  8e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.330385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6045  hypothetical protein  34.2 
 
 
283 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0730342  normal  0.483974 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>