114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2055 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2055  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  202  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0294  hypothetical cytosolic protein  73.68 
 
 		 96 aa  156  8e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.479939  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1899  GIY-YIG catalytic domain-containing protein  73.68 
 
 		 96 aa  156  8e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3124  Excinuclease ABC C subunit domain protein  59.77 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0814  excinuclease ABC subunit C  62.35 
 
 		 111 aa  116  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.683613  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0358  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  57.14 
 
 		 96 aa  115  9.999999999999999e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2855  Excinuclease ABC C subunit domain protein  59.77 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675434  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3101  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  55.79 
 
 		 95 aa  113  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2226  excinuclease ABC subunit C  51.61 
 
 		 119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.163339  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3382  excinuclease ABC subunit C  52.17 
 
 		 120 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114521  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2170  excinuclease ABC subunit C  51.65 
 
 		 98 aa  110  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.013295  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5085  Excinuclease ABC C subunit domain protein  55.06 
 
 		 95 aa  110  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1984  Excinuclease ABC C subunit domain protein  55.56 
 
 		 100 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569269  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3180  excinuclease ABC subunit C  53.26 
 
 		 95 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734981  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4335  Excinuclease ABC C subunit domain protein  54.35 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0231895  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4225  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.06 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0073463  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1144  hypothetical protein  55.56 
 
 		 97 aa  107  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2524  excinuclease ABC subunit C  57.14 
 
 		 100 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0651  excinuclease ABC subunit C  58.33 
 
 		 115 aa  107  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0670127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0706  excinuclease ABC subunit C  56.67 
 
 		 101 aa  106  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3175  excinuclease ABC subunit C  52.22 
 
 		 95 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  55.81 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0916  excinuclease ABC subunit C  58.43 
 
 		 95 aa  103  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4264  excinuclease ABC subunit C  54.35 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604611  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1409  excinuclease ABC subunit C  48.91 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2291  excinuclease ABC subunit C  47.87 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361879  normal  0.317834 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1975  excinuclease ABC subunit C  58.06 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2181  excinuclease ABC subunit C  49.45 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00892068  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0877  excinuclease ABC subunit C  52.22 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0039  hypothetical protein  51.69 
 
 		 97 aa  100  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0717  hypothetical protein  51.69 
 
 		 97 aa  100  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0882  hypothetical protein  51.69 
 
 		 97 aa  100  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1812  hypothetical protein  51.69 
 
 		 97 aa  100  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1852  hypothetical protein  51.69 
 
 		 97 aa  100  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1944  hypothetical protein  51.69 
 
 		 97 aa  100  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2051  hypothetical protein  51.69 
 
 		 97 aa  100  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2896  hypothetical protein  51.69 
 
 		 97 aa  100  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0285  excinuclease ABC subunit C  53.85 
 
 		 95 aa  100  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722146  normal  0.992997 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0331  hypothetical protein  51.69 
 
 		 97 aa  100  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0733  excinuclease ABC subunit C  48.45 
 
 		 104 aa  100  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.579236  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2352  excinuclease ABC subunit C  52.87 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.51382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7339  putative excinuclease ABC, C subunit  56.04 
 
 		 101 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2430  excinuclease ABC subunit C  56.47 
 
 		 102 aa  99.4  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3151  excinuclease ABC subunit C  48.42 
 
 		 96 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0891506  normal  0.0226516 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1328  excinuclease ABC subunit C  55.17 
 
 		 95 aa  98.2  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0827  excinuclease ABC subunit C  49.44 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437312 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2599  excinuclease ABC subunit C  52.94 
 
 		 100 aa  98.2  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1362  excinuclease ABC subunit C  55.81 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2878  excinuclease ABC subunit C  51.06 
 
 		 95 aa  98.6  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00418139  hitchhiker  0.000396722 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0883  excinuclease ABC subunit C  54.84 
 
 		 114 aa  97.4  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227593  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0003  excinuclease ABC subunit C  47.87 
 
 		 95 aa  97.1  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1965  excinuclease ABC subunit C  51.58 
 
 		 95 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.70444 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1266  excinuclease ABC subunit C  46.81 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0720825  normal  0.107878 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0101  excinuclease ABC subunit C  45.74 
 
 		 95 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.873181  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2889  excinuclease ABC subunit C  47.31 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0492999  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4684  excinuclease ABC subunit C  48.94 
 
 		 99 aa  95.5  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1053  excinuclease ABC, C subunit  44.68 
 
 		 110 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.175656  normal  0.959304 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2057  excinuclease ABC subunit C  44.68 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05260  endo/excinuclease amino terminal domain protein  53.01 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.509703  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05250  endo/excinuclease amino terminal domain protein  51.65 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2997  excinuclease ABC subunit C  50.57 
 
 		 95 aa  91.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.867299  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1655  excinuclease ABC subunit C  58.43 
 
 		 98 aa  91.3  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05230  hypothetical protein  47.19 
 
 		 100 aa  90.5  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.610254  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2914  excinuclease ABC subunit C  46.32 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00677745  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2317  excinuclease ABC subunit C  48.86 
 
 		 98 aa  87.4  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0365776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2227  excinuclease ABC subunit C  48.89 
 
 		 107 aa  86.7  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000408802  hitchhiker  0.0000527007 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0767  excinuclease ABC subunit C  47.25 
 
 		 102 aa  86.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.464931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0895  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.91 
 
 		 99 aa  86.3  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00270858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4056  excinuclease ABC subunit C  46.07 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2602  Excinuclease ABC C subunit domain protein  47.67 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000820325  normal  0.0436651 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1277  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.94 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.129449  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2807  excinuclease ABC subunit C  42.22 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171123  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3672  excinuclease ABC subunit C  42.22 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.246174  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0957  excinuclease ABC subunit C  41.11 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00735212  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05270  hypothetical protein  42.68 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4036  hypothetical protein  43.59 
 
 		 79 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0893  excinuclease ABC subunit C  37.78 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4673  excinuclease ABC subunit C  38.71 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0203068  normal  0.740164 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09001  hypothetical protein  47.22 
 
 		 80 aa  70.1  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3906  excinuclease ABC subunit C  52.38 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647444  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01100  hypothetical protein  40.98 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2665  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.42 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0964299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1648  excinuclease ABC subunit C  36.76 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.732413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7672  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.44 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  35.06 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0509  excinuclease ABC subunit C  38.37 
 
 		 82 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.107949  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0522  excinuclease ABC subunit C  38.37 
 
 		 82 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.199527  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0376  excinuclease ABC subunit C  32.95 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.604182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3514  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.04 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1038  hypothetical protein  38.16 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2245  excinuclease ABC subunit C  36 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3525  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.44 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.506874  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0126  hypothetical protein  33.33 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0778  hypothetical protein  32.14 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.68184  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3649  Excinuclease ABC C subunit domain protein  33.33 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1913  hypothetical protein  27.91 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.915766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0140  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.84 
 
 		 166 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.59 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1073  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.06 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081744 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4267  excinuclease ABC subunit C  32.89 
 
 		 180 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>