238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2043 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  613  9.999999999999999e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  98.68 
 
 		 303 aa  605  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2938  cation diffusion facilitator family transporter  43.09 
 
 		 308 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2130  cation efflux protein  43.56 
 
 		 329 aa  268  8.999999999999999e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.052432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2718  cation efflux protein  43.56 
 
 		 317 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3086  cation diffusion facilitator family transporter  43.23 
 
 		 308 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0625445  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5197  cation efflux protein  40.79 
 
 		 341 aa  265  7e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0750922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1502  cation diffusion facilitator family transporter  44.41 
 
 		 312 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000419943  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1607  cation diffusion facilitator family transporter  44.07 
 
 		 312 aa  262  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0711616  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1766  cation diffusion facilitator family transporter  44.07 
 
 		 312 aa  262  4.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394316  hitchhiker  0.00956613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3985  cation efflux protein  40.92 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1227  cation efflux protein  40.59 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4191  cation efflux protein  39.93 
 
 		 319 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1256  cation efflux protein  40.59 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2392  cation diffusion facilitator family transporter  39.66 
 
 		 300 aa  246  4e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546441 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0350  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 		 307 aa  243  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  38.64 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 		 303 aa  232  5e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0225  cation diffusion facilitator family transporter  37.29 
 
 		 370 aa  222  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0856806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37230  cation diffusion facilitator family transporter  36.03 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1226  cation diffusion facilitator family transporter  33.11 
 
 		 327 aa  182  7e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2127  cation diffusion facilitator family transporter  29.67 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  26.91 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1874  cation efflux family protein  24.91 
 
 		 268 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135582  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2240  cation diffusion facilitator family transporter  24.66 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  25.59 
 
 		 317 aa  122  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0337  cation efflux protein  27.95 
 
 		 257 aa  112  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  21.59 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001476  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  23.57 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1043  putative cation efflux pump  29.03 
 
 		 227 aa  94.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05417  hypothetical protein  24.12 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1615  cation transporter, permease component  20.53 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0151047  normal  0.0448748 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0284  cation diffusion facilitator family transporter  26.35 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  25.69 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  23.88 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  25.69 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  23.66 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  20.31 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  25.26 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12062  hypothetical protein  25.84 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  23.18 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1489  cation diffusion facilitator family transporter  28.37 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1511  cation diffusion facilitator family transporter  28.37 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  27.17 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1487  cation diffusion facilitator family transporter  28.37 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  22.79 
 
 		 366 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0853  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 479 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  22.3 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  24.42 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  21.95 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  23.16 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  25.11 
 
 		 460 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  22.64 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  22.76 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  26.11 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  24.23 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  23.24 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  22.94 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  22.12 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  21.15 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0532  ferrous-iron efflux pump FieF  21.13 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.800383  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  25.78 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  22.64 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  23.03 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  23.02 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  21.76 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1297  cation efflux family protein  24.17 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1178  cation efflux family protein  24.17 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.349373  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  22.61 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1902  cation diffusion facilitator family transporter  27.32 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  23.53 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  22.79 
 
 		 478 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  25.09 
 
 		 384 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  23.7 
 
 		 385 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  24.9 
 
 		 328 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  20.96 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  21.9 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  23.7 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  20.16 
 
 		 401 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  22.8 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  23.7 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  23.33 
 
 		 385 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  23.68 
 
 		 404 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  23.68 
 
 		 404 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1123  ferrous-iron efflux pump FieF  19.93 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00791465  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  21.4 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3356  cation diffusion facilitator family transporter  24.71 
 
 		 382 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2184  cation diffusion facilitator family transporter  24.29 
 
 		 303 aa  53.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  21.71 
 
 		 303 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  22.03 
 
 		 307 aa  53.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  22.01 
 
 		 295 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  23.33 
 
 		 318 aa  52.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  23.89 
 
 		 422 aa  52.8  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  20.99 
 
 		 337 aa  52.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1554  cation diffusion facilitator family transporter  21.9 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.199907  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  23.5 
 
 		 291 aa  52.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3105  cation diffusion facilitator family transporter  25.19 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3015  cation diffusion facilitator family transporter  25.19 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0754  cation diffusion facilitator family transporter  22.88 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00172245  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3009  cation diffusion facilitator family transporter  24.31 
 
 		 382 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>