More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2024 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  97.7 
 
 		 217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  66.05 
 
 		 226 aa  304  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  65.12 
 
 		 215 aa  302  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  65.12 
 
 		 215 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  65.12 
 
 		 215 aa  298  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  65.12 
 
 		 215 aa  298  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  65.12 
 
 		 215 aa  298  6e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  64.19 
 
 		 215 aa  297  8e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  64.65 
 
 		 264 aa  297  9e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  64.19 
 
 		 215 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  64.79 
 
 		 216 aa  292  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  63.26 
 
 		 215 aa  291  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  65.28 
 
 		 217 aa  288  4e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  65.28 
 
 		 217 aa  288  5.0000000000000004e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  63.98 
 
 		 227 aa  286  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  64.93 
 
 		 223 aa  285  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  61.14 
 
 		 213 aa  285  4e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  61.14 
 
 		 213 aa  285  4e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  63.51 
 
 		 233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  61.61 
 
 		 213 aa  281  5.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  61.9 
 
 		 212 aa  279  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  63.81 
 
 		 215 aa  278  6e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  60.19 
 
 		 227 aa  275  4e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  61.61 
 
 		 213 aa  275  5e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  59.24 
 
 		 232 aa  271  6e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  61.14 
 
 		 214 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  61.14 
 
 		 214 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  58.57 
 
 		 212 aa  265  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  59.33 
 
 		 234 aa  263  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  66.84 
 
 		 193 aa  261  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  58.57 
 
 		 216 aa  259  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  53.57 
 
 		 245 aa  249  3e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  54.02 
 
 		 244 aa  246  1e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  53.12 
 
 		 244 aa  243  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  44.76 
 
 		 210 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  44.88 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  47.85 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  43.9 
 
 		 210 aa  194  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  43.9 
 
 		 210 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  43.87 
 
 		 226 aa  192  4e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  45.93 
 
 		 212 aa  190  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  44.55 
 
 		 211 aa  184  7e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  42.31 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  42.25 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  42.33 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  43.13 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  41.23 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  41.82 
 
 		 226 aa  174  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  40.28 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  39.81 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  40.57 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  42.08 
 
 		 202 aa  152  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  41.67 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  35.24 
 
 		 225 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  38.05 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  39.22 
 
 		 202 aa  137  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  39.71 
 
 		 202 aa  135  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  31.98 
 
 		 253 aa  118  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  32.51 
 
 		 258 aa  108  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  35.92 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  30.58 
 
 		 258 aa  99.8  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  33.18 
 
 		 216 aa  98.2  8e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  32.41 
 
 		 216 aa  98.2  9e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  30.2 
 
 		 280 aa  95.9  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  39.16 
 
 		 260 aa  93.6  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  31.63 
 
 		 216 aa  92.8  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  29.8 
 
 		 274 aa  92.4  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 216 aa  92  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  33 
 
 		 195 aa  91.7  7e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  30.62 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  27.83 
 
 		 230 aa  86.3  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  38.98 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  30.73 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  29 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  27.62 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  27.54 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  30.14 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  32.35 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  29.27 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0978  hypothetical protein  27.12 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  30.3 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  32.18 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2254  radical activating enzyme  26.96 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499803  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  26.96 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  27.54 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  27.83 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  28.89 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  34.4 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  28.5 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  32.22 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  34.4 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1899  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  30.77 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  33.64 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2116  radical activating enzyme  26.5 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.054229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>