More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2013 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  56.48 
 
 
586 aa  716    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  59.56 
 
 
586 aa  743    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
589 aa  1219    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  98.64 
 
 
589 aa  1205    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  54.78 
 
 
585 aa  645    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  57.04 
 
 
587 aa  680    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 
592 aa  682    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 
592 aa  665    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 
588 aa  674    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  58.5 
 
 
611 aa  706    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  56.71 
 
 
584 aa  682    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 
586 aa  664    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 
598 aa  625  1e-178  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0294  arginyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 
609 aa  628  1e-178  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1946  arginyl-tRNA synthetase  51.08 
 
 
609 aa  618  1e-176  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2239  arginyl-tRNA synthetase  51.25 
 
 
609 aa  621  1e-176  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 
579 aa  597  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3866  arginyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 
587 aa  596  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.42649  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0720  arginyl-tRNA synthetase  53.29 
 
 
587 aa  597  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 
579 aa  597  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 
554 aa  533  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 
554 aa  529  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 
554 aa  523  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
561 aa  518  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 
561 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
559 aa  513  1e-144  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
559 aa  514  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
570 aa  510  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 
556 aa  499  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
556 aa  496  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
556 aa  496  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
556 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
556 aa  497  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 
551 aa  496  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
556 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
556 aa  495  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 
556 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
556 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
550 aa  493  9.999999999999999e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
556 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
556 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 
563 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 
556 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
551 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 
561 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
557 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
556 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 
556 aa  486  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
551 aa  488  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
561 aa  485  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 
559 aa  480  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 
551 aa  478  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
553 aa  473  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
562 aa  472  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 
560 aa  472  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 
562 aa  474  1e-132  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
562 aa  472  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
562 aa  473  1e-132  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 
550 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
564 aa  467  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
551 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1081  arginyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
556 aa  467  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
562 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
575 aa  467  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_002936  DET1270  arginyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
556 aa  460  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0106385  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
553 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
553 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 
564 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 
556 aa  461  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  39.97 
 
 
564 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 
546 aa  456  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
568 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0632  arginyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
564 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
561 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 
564 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
546 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2036  arginyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
561 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.432071  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1019  arginyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
563 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.637999  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
569 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 
553 aa  440  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2782  arginyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
557 aa  434  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.535695  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0405  arginyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 
542 aa  429  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0430  arginyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
594 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0410  arginyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
594 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0084  arginyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
594 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0592  arginyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
594 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597736  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3099  arginyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
594 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1997  arginyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
594 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2291  arginyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
594 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2178  arginyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 
590 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0332  arginyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
567 aa  422  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.960888  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1728  arginyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
581 aa  423  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231273  normal  0.529501 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0343  arginyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
577 aa  422  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401675  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29980  arginyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
551 aa  420  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661681  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0355  arginyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 
594 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2767  arginyl-tRNA synthetase  40 
 
 
583 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0538697 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0903  arginyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 
580 aa  420  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0188  arginyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 
594 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3705  arginyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
585 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.893232 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4490  arginyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
561 aa  419  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.703488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>