More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1989 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  261  3e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  99.22 
 
 		 128 aa  259  8.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  68.29 
 
 		 128 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  66.39 
 
 		 127 aa  177  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  66.94 
 
 		 127 aa  176  9e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  66.39 
 
 		 127 aa  175  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  66.39 
 
 		 127 aa  174  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  66.12 
 
 		 127 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  66.12 
 
 		 127 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  66.12 
 
 		 127 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  66.12 
 
 		 127 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  65.29 
 
 		 127 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0360  endoribonuclease L-PSP  65.29 
 
 		 127 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000617851 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  65.29 
 
 		 127 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  65.29 
 
 		 127 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  63.64 
 
 		 127 aa  167  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  61.48 
 
 		 128 aa  168  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  64.46 
 
 		 126 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  64.46 
 
 		 126 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  64.46 
 
 		 127 aa  166  8e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  61.98 
 
 		 127 aa  166  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  60.33 
 
 		 128 aa  166  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0357  putative endoribonuclease L-PSP  64.46 
 
 		 127 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00527339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  64.46 
 
 		 127 aa  166  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  64.46 
 
 		 126 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  62.81 
 
 		 126 aa  165  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  62.6 
 
 		 128 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  62.18 
 
 		 127 aa  164  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  62.81 
 
 		 126 aa  163  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  60.98 
 
 		 128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1215  YjgF-like protein  62.3 
 
 		 128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  61.98 
 
 		 127 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  60.33 
 
 		 130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  62.81 
 
 		 126 aa  161  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  61.98 
 
 		 126 aa  161  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  62.81 
 
 		 126 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  61.98 
 
 		 126 aa  160  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  61.98 
 
 		 126 aa  159  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  61.98 
 
 		 126 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  58.68 
 
 		 128 aa  156  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  57.02 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  59.02 
 
 		 127 aa  152  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  57.94 
 
 		 128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  59.32 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  55.2 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  55.2 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  59.06 
 
 		 129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  55.28 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  55.37 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1777  translation initiation inhibitor  56.45 
 
 		 148 aa  140  6e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00398011  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  51.61 
 
 		 151 aa  140  7e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0410  putative endoribonuclease L-PSP  56.1 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000330558  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2126  endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158455  hitchhiker  0.000014394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 		 140 aa  133  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  51.22 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0470  endoribonuclease L-PSP  60.66 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.720081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0574  putative endoribonuclease L-PSP  47.24 
 
 		 131 aa  127  6e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000328511  hitchhiker  0.00876549 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 126 aa  127  8.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  47.41 
 
 		 126 aa  124  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 125 aa  124  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  48.74 
 
 		 125 aa  124  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 		 127 aa  123  9e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  48.31 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 125 aa  120  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 		 126 aa  120  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  47.11 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  45.69 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  48.28 
 
 		 124 aa  117  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  46.09 
 
 		 126 aa  116  9e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  46.61 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 131 aa  115  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  43.59 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21490  endoribonuclease L-PSP, putative  45.16 
 
 		 124 aa  114  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  47.41 
 
 		 125 aa  114  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 		 128 aa  114  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  43.48 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 		 127 aa  114  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  43.22 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 125 aa  114  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  44.44 
 
 		 128 aa  114  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 		 128 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 		 127 aa  113  7.999999999999999e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>