27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1940 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1940  hypothetical protein  100 
 
 
534 aa  1070    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2323  hypothetical protein  36.12 
 
 
354 aa  196  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2330  hypothetical protein  46.67 
 
 
304 aa  166  8e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2459  hypothetical protein  38.31 
 
 
294 aa  163  7e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2316  hypothetical protein  34.19 
 
 
294 aa  149  9e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1567  hypothetical protein  29.18 
 
 
431 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1579  hypothetical protein  27.35 
 
 
464 aa  92.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1436  hypothetical protein  26.09 
 
 
815 aa  91.3  5e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0147013 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1423  hypothetical protein  26.55 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1120  hypothetical protein  26.18 
 
 
781 aa  80.5  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0112  cyclin domain-containing protein  30.42 
 
 
770 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34199  predicted protein  26.36 
 
 
471 aa  68.6  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0110  hypothetical protein  29.89 
 
 
254 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34148  predicted protein  25.53 
 
 
466 aa  60.1  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0271154  normal  0.859268 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  25.78 
 
 
1266 aa  58.5  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0526  hypothetical protein  25.46 
 
 
372 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1356  GALA protein 4  28.16 
 
 
620 aa  57  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222227  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1227  hypothetical protein  26.9 
 
 
430 aa  56.6  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643545 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1477  hypothetical protein  23.8 
 
 
614 aa  53.5  0.000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.1 
 
 
1107 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1903  hypothetical protein  32.77 
 
 
204 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1383  hypothetical protein  24.78 
 
 
465 aa  48.9  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42557  predicted protein  24.12 
 
 
692 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2293  predicted protein  27.27 
 
 
432 aa  47  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.531902 
 
 
-
 
NC_003296  RS01686  GALA protein 1  25.9 
 
 
661 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1800  GALA protein  30.85 
 
 
401 aa  43.9  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0919922 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1914  hypothetical protein  28.49 
 
 
204 aa  43.5  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>