More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1892 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  940    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  99.15 
 
 		 473 aa  935    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  49.11 
 
 		 467 aa  447  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  49.11 
 
 		 467 aa  446  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  48.07 
 
 		 474 aa  437  1e-121  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  48.07 
 
 		 474 aa  437  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  41.04 
 
 		 464 aa  340  5e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  41.27 
 
 		 464 aa  340  5e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  41.32 
 
 		 476 aa  330  5.0000000000000004e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  41.32 
 
 		 470 aa  329  7e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  39.41 
 
 		 475 aa  311  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  36.64 
 
 		 474 aa  309  8e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  35.78 
 
 		 490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  38.17 
 
 		 475 aa  305  8.000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  35.42 
 
 		 466 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  33.05 
 
 		 469 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  34.75 
 
 		 494 aa  296  7e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  35.92 
 
 		 473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  34.51 
 
 		 495 aa  279  9e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  33.12 
 
 		 499 aa  276  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  35.21 
 
 		 480 aa  275  2.0000000000000002e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156631 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  32.76 
 
 		 508 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3825  glutamate/gamma-aminobutyrate anti-porter  33.89 
 
 		 506 aa  262  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1629  hypothetical protein  36.55 
 
 		 445 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0552  glutamate/GABA antiporter  33.4 
 
 		 506 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1623  hypothetical protein  36.32 
 
 		 445 aa  257  3e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4375  amino acid permease-associated region  29.94 
 
 		 495 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  30.3 
 
 		 472 aa  233  8.000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  32 
 
 		 473 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  32 
 
 		 473 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  32 
 
 		 473 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  32 
 
 		 473 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  32 
 
 		 473 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2317  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter family protein  28.63 
 
 		 472 aa  227  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  28.96 
 
 		 511 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  28.96 
 
 		 511 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.96 
 
 		 511 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  28.96 
 
 		 511 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.96 
 
 		 511 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.96 
 
 		 511 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.96 
 
 		 511 aa  212  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.96 
 
 		 511 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  28.96 
 
 		 511 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0883  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  28.96 
 
 		 511 aa  206  9e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1412  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  30.38 
 
 		 503 aa  200  3.9999999999999996e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0796975  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1507  glutamate:gamma-aminobutyrate antiporter family protein  28.41 
 
 		 485 aa  200  6e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1297  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  27.56 
 
 		 485 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00362427  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0148  amino acid permease-associated region  30.38 
 
 		 720 aa  162  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0047  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  24.25 
 
 		 494 aa  160  4e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  26.61 
 
 		 472 aa  140  6e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  26.78 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0388  putative amino acid permease  27.34 
 
 		 467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2190  amino acid permease-associated region  25.8 
 
 		 497 aa  126  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0155  amino acid permease  25.06 
 
 		 495 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1181  amino acid permease family protein  26.73 
 
 		 489 aa  123  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293618  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0159  amino acid permease family protein  24.82 
 
 		 495 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  27.21 
 
 		 489 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000367074  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0671  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 		 500 aa  117  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  hitchhiker  0.0000196904 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  25.2 
 
 		 455 aa  116  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2961  amino acid permease-associated region  26.32 
 
 		 481 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.408205 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  23.98 
 
 		 500 aa  107  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2220  amino acid permease family protein  25.24 
 
 		 476 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.52526 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00903  predicted transporter  24.46 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0976  amino acid permease family protein  24.46 
 
 		 540 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.953218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2744  amino acid permease-associated region  24.46 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397041  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1062  amino acid permease family protein  25.2 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2697  amino acid permease-associated region  24.46 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1005  amino acid permease family protein  24.46 
 
 		 540 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00910  hypothetical protein  24.46 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0973  inner membrane transporter YcaM  23.64 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1033  inner membrane transporter YcaM  23.64 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.843228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1002  inner membrane transporter YcaM  23.64 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1082  inner membrane transporter YcaM  23.64 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1067  inner membrane transporter YcaM  23.64 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.154382  normal  0.709783 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1311  amino acid transporter  24.67 
 
 		 516 aa  100  5e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1536  amino acid transporter  23.74 
 
 		 476 aa  95.1  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0652543  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4627  amino acid permease family protein  24.65 
 
 		 514 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.592733  normal  0.0531629 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04028  predicted transporter  24.77 
 
 		 500 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.853032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03990  hypothetical protein  24.77 
 
 		 489 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.826607  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3834  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 		 514 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4400  amino acid permease family protein  24.77 
 
 		 500 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5674  amino acid permease family protein  24.77 
 
 		 514 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270283  normal  0.215143 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3854  amino acid permease-associated region  24.54 
 
 		 500 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4715  amino acid permease family protein  24.77 
 
 		 500 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.212622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63480  putative amino acid permease  22.59 
 
 		 465 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.982931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1880  amino acid transporter  22.71 
 
 		 492 aa  86.7  9e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000114764  hitchhiker  0.000000000709791 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0828  amino acid transporter  24.56 
 
 		 502 aa  85.1  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000137053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2046  amino acid permease family protein  25 
 
 		 496 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1226  amino acid permease-associated region  24.28 
 
 		 497 aa  82  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1382  amino acid permease-associated region  24.44 
 
 		 501 aa  82  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.320464  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1217  amino acid permease family protein  23.29 
 
 		 540 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0249423  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2332  amino acid permease family protein  25 
 
 		 496 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1034  amino acid permease family protein  23.9 
 
 		 540 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.696759  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4706  inner membrane transporter YjeM  24.65 
 
 		 500 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.929482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4763  inner membrane transporter YjeM  24.65 
 
 		 500 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.520052 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4615  inner membrane transporter YjeM  24.65 
 
 		 500 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4623  inner membrane transporter YjeM  24.65 
 
 		 500 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1995  amino acid transporter  23.13 
 
 		 507 aa  81.3  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0293042  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0217  amino acid antiporter  26 
 
 		 782 aa  80.1  0.00000000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1695  amino acid transporter  23.84 
 
 		 480 aa  79.7  0.00000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00330646  decreased coverage  1.25344e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>