More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1678 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  100 
 
 
292 aa  592  1e-168  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  98.63 
 
 
292 aa  584  1e-166  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  58.08 
 
 
293 aa  343  2e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  59.86 
 
 
292 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  58.62 
 
 
294 aa  333  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  56.36 
 
 
291 aa  329  3e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  56.6 
 
 
289 aa  329  3e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  56.7 
 
 
292 aa  328  9e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  56.21 
 
 
293 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  52.7 
 
 
296 aa  299  4e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  52.7 
 
 
296 aa  299  4e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  55.36 
 
 
290 aa  296  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  54.86 
 
 
285 aa  294  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  55.21 
 
 
285 aa  293  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  55.21 
 
 
285 aa  291  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  55.21 
 
 
285 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  55.21 
 
 
285 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  50.85 
 
 
302 aa  289  4e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  55.2 
 
 
290 aa  288  6e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  53.24 
 
 
292 aa  287  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  53.24 
 
 
292 aa  287  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38980  elongation factor Ts  54.23 
 
 
289 aa  282  6.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  51.96 
 
 
290 aa  277  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  53.12 
 
 
283 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  53.12 
 
 
283 aa  276  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  53.12 
 
 
283 aa  276  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  52.13 
 
 
292 aa  276  3e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  53.12 
 
 
283 aa  276  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  53.12 
 
 
283 aa  276  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  53.12 
 
 
283 aa  276  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  53.12 
 
 
283 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  53.12 
 
 
283 aa  276  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  53.12 
 
 
283 aa  276  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  52.08 
 
 
283 aa  276  4e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  53.5 
 
 
283 aa  275  5e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1273  elongation factor Ts  52.74 
 
 
286 aa  275  6e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00309579  normal  0.676189 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  52.78 
 
 
283 aa  275  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  52.78 
 
 
283 aa  275  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  52.78 
 
 
283 aa  275  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  52.78 
 
 
283 aa  275  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  50.18 
 
 
294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  53.12 
 
 
283 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  52.78 
 
 
283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  52.43 
 
 
283 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  51.74 
 
 
283 aa  273  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  52.14 
 
 
292 aa  272  4.0000000000000004e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  49.49 
 
 
289 aa  270  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1535  translation elongation factor Ts  50.68 
 
 
287 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  50.69 
 
 
292 aa  268  7e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1102  elongation factor Ts  51.37 
 
 
287 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.433956  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1344  elongation factor Ts  49.66 
 
 
287 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1484  elongation factor Ts  51.39 
 
 
289 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113842  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17070  elongation factor Ts  51.39 
 
 
289 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  51.37 
 
 
294 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3052  elongation factor Ts  51.06 
 
 
287 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.204992  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  50 
 
 
294 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  50.17 
 
 
295 aa  256  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  50.17 
 
 
295 aa  256  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  51.39 
 
 
282 aa  256  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  50.17 
 
 
295 aa  255  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  49.49 
 
 
295 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  49.49 
 
 
295 aa  253  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  49.49 
 
 
295 aa  253  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  49.49 
 
 
295 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  49.49 
 
 
295 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  49.49 
 
 
295 aa  252  6e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  49.49 
 
 
295 aa  252  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0390  elongation factor Ts  49.47 
 
 
294 aa  252  6e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.432291  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  50.51 
 
 
295 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  50.69 
 
 
292 aa  251  1e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1592  elongation factor Ts  48.26 
 
 
287 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1147  elongation factor Ts  47.92 
 
 
287 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2547  elongation factor Ts  50 
 
 
306 aa  248  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4185  elongation factor Ts  47.92 
 
 
287 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4081  elongation factor Ts  47.92 
 
 
287 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0351  elongation factor Ts  49.12 
 
 
294 aa  247  2e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.556574  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  50 
 
 
292 aa  247  2e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  46.1 
 
 
291 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  47.16 
 
 
293 aa  244  9e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  45.74 
 
 
290 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1850  elongation factor Ts  52.82 
 
 
280 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000427669  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  47.16 
 
 
293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1140  elongation factor Ts  52.96 
 
 
283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000133846  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  46.45 
 
 
293 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  46.45 
 
 
293 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  46.45 
 
 
293 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  46.45 
 
 
293 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  46.45 
 
 
293 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  46.45 
 
 
293 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  46.45 
 
 
294 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  48.06 
 
 
292 aa  239  5e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  45.04 
 
 
293 aa  238  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  47.16 
 
 
292 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  47.16 
 
 
292 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2634  elongation factor Ts  53.21 
 
 
282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000554469  normal  0.227391 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1265  elongation factor Ts  48.6 
 
 
291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  48.31 
 
 
303 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  48.31 
 
 
303 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  44.33 
 
 
293 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  44.33 
 
 
303 aa  232  5e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.844303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>