More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1670 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  100 
 
 
407 aa  837    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  95.82 
 
 
407 aa  805    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  43.42 
 
 
402 aa  309  5e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  45.03 
 
 
401 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  39.85 
 
 
423 aa  305  9.000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  44.7 
 
 
402 aa  301  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  39.7 
 
 
418 aa  286  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  42.33 
 
 
387 aa  249  5e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  36.02 
 
 
385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  32.66 
 
 
388 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  32.66 
 
 
388 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  36.53 
 
 
391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  33.76 
 
 
378 aa  173  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  28.83 
 
 
394 aa  170  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  28.86 
 
 
409 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  29.87 
 
 
374 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  29.4 
 
 
413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  31.97 
 
 
388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  29.35 
 
 
374 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  28.43 
 
 
413 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  30.59 
 
 
383 aa  160  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  33.59 
 
 
389 aa  159  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  31.54 
 
 
372 aa  159  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.65 
 
 
358 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.65 
 
 
358 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  28.64 
 
 
410 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  28.82 
 
 
415 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  33.33 
 
 
376 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  34.77 
 
 
376 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  28.5 
 
 
432 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  34.8 
 
 
377 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  30.27 
 
 
412 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  31.54 
 
 
409 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  29.59 
 
 
376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  31.68 
 
 
376 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  37.22 
 
 
375 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  28.72 
 
 
436 aa  146  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  31.15 
 
 
376 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  34.95 
 
 
381 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  29.44 
 
 
376 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  29.12 
 
 
409 aa  142  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  29.78 
 
 
424 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  27.59 
 
 
428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  28.03 
 
 
372 aa  139  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  33.85 
 
 
383 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  27.59 
 
 
438 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  33.87 
 
 
420 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  32.93 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  27.96 
 
 
436 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  27.96 
 
 
436 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.36 
 
 
394 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  32.44 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  29.5 
 
 
422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  29.97 
 
 
376 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  33.22 
 
 
367 aa  133  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  33.12 
 
 
376 aa  132  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  27.11 
 
 
418 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  27.65 
 
 
416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  32 
 
 
376 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  33.33 
 
 
376 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.34 
 
 
405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  34.94 
 
 
391 aa  127  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  27.21 
 
 
417 aa  125  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  30.5 
 
 
388 aa  125  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  32.77 
 
 
382 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  30.22 
 
 
385 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  28.54 
 
 
382 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  29.94 
 
 
372 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  30.36 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  28.03 
 
 
382 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  27.18 
 
 
408 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  27.78 
 
 
382 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.86 
 
 
363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  32.14 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  25.68 
 
 
424 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  26.26 
 
 
429 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  26.09 
 
 
432 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  30.23 
 
 
405 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  28.84 
 
 
441 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  24.13 
 
 
434 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0238  peptidase M20  24.88 
 
 
436 aa  83.6  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489939  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.14 
 
 
433 aa  82.8  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.61 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.8 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  34.68 
 
 
402 aa  75.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1008  D-alanine--D-alanine ligase  23.46 
 
 
743 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  29.3 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  26.22 
 
 
377 aa  69.7  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  26.54 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  26 
 
 
446 aa  67.4  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  25.14 
 
 
368 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1901  peptidase M20  25.61 
 
 
403 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  normal  0.958689 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2509  peptidase M20  27 
 
 
337 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  26.59 
 
 
411 aa  63.2  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  28.17 
 
 
374 aa  63.2  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1348  peptidase T-like protein  28.15 
 
 
365 aa  62.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.868823  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0642  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 
402 aa  62.8  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.39661  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2784  peptidase M20  30.62 
 
 
394 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1186  M20/M25/M40 family peptidase  28.77 
 
 
363 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390537  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  27.17 
 
 
391 aa  62.4  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>