155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1629 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1629  hypothetical protein  100 
 
 
445 aa  868    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1623  hypothetical protein  98.88 
 
 
445 aa  860    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  41.61 
 
 
467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  41.61 
 
 
467 aa  313  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  40.18 
 
 
474 aa  313  3.9999999999999997e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  39.96 
 
 
474 aa  312  1e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  36.55 
 
 
473 aa  254  3e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  38.48 
 
 
473 aa  247  3e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  36.29 
 
 
464 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  36.29 
 
 
464 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  31.62 
 
 
474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  30.16 
 
 
466 aa  211  2e-53  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  28.67 
 
 
469 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  31.21 
 
 
475 aa  208  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  31.44 
 
 
475 aa  207  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  27.85 
 
 
473 aa  199  7e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  31.5 
 
 
476 aa  189  7e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  31.5 
 
 
470 aa  189  9e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  28.66 
 
 
494 aa  187  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  28.88 
 
 
490 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  26.01 
 
 
499 aa  179  9e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0552  glutamate/GABA antiporter  27.95 
 
 
506 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3825  glutamate/gamma-aminobutyrate anti-porter  27.51 
 
 
506 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  27.66 
 
 
495 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 
480 aa  153  8e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000156631 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  26.02 
 
 
508 aa  147  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2317  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter family protein  26.11 
 
 
472 aa  137  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  26.42 
 
 
472 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0883  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  26.95 
 
 
511 aa  124  4e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1507  glutamate:gamma-aminobutyrate antiporter family protein  24.94 
 
 
485 aa  123  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1297  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  24.71 
 
 
485 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00362427  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4375  amino acid permease-associated region  24.32 
 
 
495 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  24.55 
 
 
511 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  24.55 
 
 
511 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  24.55 
 
 
511 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  24.6 
 
 
511 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  24.55 
 
 
511 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  24.5 
 
 
511 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  24.55 
 
 
511 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  24.55 
 
 
511 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  24.55 
 
 
511 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1412  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  23.9 
 
 
503 aa  108  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0796975  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  23.37 
 
 
473 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  23.37 
 
 
473 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0047  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  26.17 
 
 
494 aa  106  8e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  23.37 
 
 
473 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  23.37 
 
 
473 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  23.37 
 
 
473 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0159  amino acid permease family protein  24.81 
 
 
495 aa  91.3  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0155  amino acid permease  24.81 
 
 
495 aa  91.7  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  22.16 
 
 
464 aa  79.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0148  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 
720 aa  77  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1975  amino acid permease-associated region  27.87 
 
 
496 aa  73.6  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002656  putative oxidoreductase  27.27 
 
 
477 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  22.43 
 
 
455 aa  68.2  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0623  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 
477 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02947  predicted transporter  26.13 
 
 
477 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4392  amino acid permease family protein  26.13 
 
 
477 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3260  amino acid permease family protein  26.13 
 
 
477 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0622  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 
477 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3372  amino acid permease family protein  26.13 
 
 
477 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3545  amino acid permease family protein  26.13 
 
 
477 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  23.81 
 
 
489 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000367074  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  23.77 
 
 
472 aa  60.5  0.00000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1181  amino acid permease family protein  23.21 
 
 
489 aa  60.5  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  28.77 
 
 
445 aa  60.1  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4085  putrescine transporter  23.21 
 
 
439 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4054  putrescine transporter  23.21 
 
 
439 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3976  putrescine transporter  23.21 
 
 
439 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4172  putrescine transporter  23.21 
 
 
439 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3335  putrescine transporter  24.02 
 
 
438 aa  57.8  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3680  putrescine transporter  23.88 
 
 
439 aa  57.4  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001093  putrescine/proton symporter putrescine/ornithine antiporter PotE  21.86 
 
 
436 aa  56.6  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0627  amino acid transporter  31.08 
 
 
458 aa  56.6  0.0000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00648  putrescine/proton symporter: putrescine/ornithine antiporter  23.15 
 
 
439 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2945  arginine/ornithine antiporter  23.15 
 
 
439 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0313  putrescine transporter  23.88 
 
 
439 aa  56.2  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2964  putrescine transporter  23.15 
 
 
439 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.018093  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00640  hypothetical protein  23.15 
 
 
439 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.167643  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3668  putrescine transporter  23.88 
 
 
439 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0277  putrescine transporter  24.18 
 
 
439 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0784  putrescine transporter  23.15 
 
 
439 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0285849  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1204  putrescine transporter  22.38 
 
 
437 aa  55.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.658764  decreased coverage  0.0000377329 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0217  amino acid antiporter  23.18 
 
 
782 aa  55.1  0.000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04834  putrescine transporter  21.56 
 
 
436 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0717  putrescine transporter  23.15 
 
 
439 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193165  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1574  putrescine transporter  22.8 
 
 
436 aa  54.7  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3872  putrescine transporter  23.88 
 
 
439 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0414158 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1306  amino acid permease  29.32 
 
 
458 aa  54.3  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000234157  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0714  putrescine transporter  23.05 
 
 
439 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0136028  normal  0.578449 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0760  putrescine transporter  22.55 
 
 
439 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.428261  normal  0.419082 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0808  putrescine transporter  22.55 
 
 
439 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.210181  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0857  putrescine transporter  22.55 
 
 
439 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0747  putrescine transporter  22.55 
 
 
439 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110662  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0821  putrescine transporter  22.55 
 
 
439 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.438039  normal  0.147845 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0411  amino acid permease-associated region  29.8 
 
 
473 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  22.17 
 
 
500 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1534  S-methylmethionine transporter  31.21 
 
 
470 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0660  amino acid transporter  30.15 
 
 
479 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232507  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0694  amino acid permease-associated region  30.15 
 
 
479 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0144358 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>