More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1473 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  46.21 
 
 
762 aa  655    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  100 
 
 
718 aa  1463    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  99.03 
 
 
718 aa  1455    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  46.23 
 
 
731 aa  659    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  46.07 
 
 
731 aa  670    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  46.21 
 
 
733 aa  671    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  42.76 
 
 
734 aa  613  9.999999999999999e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  44.33 
 
 
704 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0548  ABC transporter related  43.28 
 
 
722 aa  610  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3202  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  44.02 
 
 
725 aa  606  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.612562  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  45.09 
 
 
704 aa  608  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  41.31 
 
 
737 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  44.05 
 
 
721 aa  600  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  42.42 
 
 
721 aa  595  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  42.13 
 
 
718 aa  593  1e-168  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  42.19 
 
 
734 aa  590  1e-167  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  42.13 
 
 
740 aa  588  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  41.24 
 
 
718 aa  590  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1098  ABC transporter ATP-binding protein  44.41 
 
 
707 aa  589  1e-167  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89235  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  41.8 
 
 
723 aa  587  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  39.94 
 
 
738 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0300  ABC transporter related  44.96 
 
 
721 aa  584  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  41.96 
 
 
712 aa  584  1.0000000000000001e-165  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0564  type I secretion system ATPase  41.5 
 
 
743 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3062  type I secretion system ATPase  43.19 
 
 
767 aa  581  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3770  ABC transporter related  45.21 
 
 
719 aa  579  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  41.29 
 
 
776 aa  582  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1213  type I secretion system ATPase  43.27 
 
 
738 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466678  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1291  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.29 
 
 
711 aa  575  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  41.54 
 
 
712 aa  570  1e-161  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1418  ATPase  41.76 
 
 
756 aa  570  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.702704  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5062  type I secretion system ATPase  42.75 
 
 
718 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.507618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0167  toxin secretion ATP-binding protein  43.92 
 
 
718 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0186  ABC transporter related  43.92 
 
 
718 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0846231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0185  type I secretion system ATPase  43.19 
 
 
718 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.206215 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0785  type I secretion system ATPase  41.31 
 
 
720 aa  557  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.42075  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0635  type I secretion system ATPase  41.8 
 
 
920 aa  551  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.144577  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  39.75 
 
 
725 aa  547  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  40.72 
 
 
723 aa  543  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2242  ABC transporter related  40.35 
 
 
718 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.960631  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  40.17 
 
 
726 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1803  ABC transporter related  42.65 
 
 
716 aa  538  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.239145 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0312  ABC transporter-related protein  39.89 
 
 
726 aa  537  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  40.63 
 
 
725 aa  533  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1634  ABC transporter related  38.99 
 
 
730 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46582  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  39.45 
 
 
725 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  39.6 
 
 
725 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  39.6 
 
 
725 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  39.6 
 
 
725 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  40.49 
 
 
725 aa  526  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  40.51 
 
 
726 aa  525  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  39.77 
 
 
725 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  39.63 
 
 
725 aa  522  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1461  ABC transporter, transmembrane region  42.02 
 
 
719 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0476  type I secretion system ATPase  39.48 
 
 
726 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3592  ABC transporter related  39.31 
 
 
725 aa  514  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0383  ABC transporter related  40.08 
 
 
727 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2660  ABC transporter related  40.18 
 
 
687 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3149  ABC transporter related  39.24 
 
 
776 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2777  cyclic nucleotide-binding protein  38.68 
 
 
727 aa  499  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1077  type I secretion system ATPase  39.83 
 
 
726 aa  501  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3810  type I secretion system ATPase  40.75 
 
 
711 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00509223 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2300  type I secretion system ATPase  38.22 
 
 
739 aa  487  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0053  ABC transporter related  38.76 
 
 
719 aa  465  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2501  ABC transporter  37.23 
 
 
733 aa  459  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.576449 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3410  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  37.29 
 
 
713 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277715  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0381  ATPase  35.33 
 
 
718 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.700678  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40240  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  37.72 
 
 
723 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.587032  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01405  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.4 
 
 
694 aa  449  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.637071  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1002  ABC transporter related  36.06 
 
 
722 aa  440  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1758  type I secretion system ATPase  34.34 
 
 
779 aa  433  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0262668 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0992  type I secretion system ATPase  36.56 
 
 
712 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0584  type I secretion system ATPase family protein  32.76 
 
 
720 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3319  type I secretion system ATPase  36.2 
 
 
712 aa  412  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3711  type I secretion system ATPase  36.77 
 
 
742 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.841937  normal  0.327793 
 
 
-
 
NC_003296  RS05072  ABC transporter ATP-binding protein  34.1 
 
 
739 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4207  ABC transporter related  34.52 
 
 
706 aa  391  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2907  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  33.04 
 
 
726 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2906  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  33.04 
 
 
726 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.452451  normal  0.0897932 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2837  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  32.94 
 
 
726 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2888  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  32.86 
 
 
726 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.110147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0804  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  36.09 
 
 
722 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0384616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0828  ABC transporter related  38.2 
 
 
722 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4601  type I secretion system ATPase  32.25 
 
 
730 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2167  ABC transporter related  37.83 
 
 
729 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.171224  normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0529  ABC transporter related  33.74 
 
 
871 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.299767  normal  0.097306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0843  type I secretion system ATPase  34.1 
 
 
722 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  32.04 
 
 
720 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0760  ABC transporter related  36.72 
 
 
867 aa  371  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00472894  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4382  type I secretion system ATPase  35.83 
 
 
722 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.971787  normal  0.361781 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  31.95 
 
 
731 aa  368  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  33 
 
 
731 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2196  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  34.27 
 
 
763 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.338051  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2060  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.27 
 
 
763 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  31.59 
 
 
724 aa  362  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  31.59 
 
 
724 aa  362  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2275  ABC transporter related  36.55 
 
 
714 aa  360  4e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.405946  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0277  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.93 
 
 
722 aa  360  5e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358475  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  33.09 
 
 
725 aa  360  5e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1190  ABC transporter-related protein  32.87 
 
 
701 aa  360  5e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>