More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1446 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  100 
 
 
441 aa  912    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  94.56 
 
 
431 aa  861    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  51.97 
 
 
735 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  54.17 
 
 
744 aa  238  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  52.34 
 
 
757 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  46.19 
 
 
1207 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  46.58 
 
 
672 aa  188  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  46.12 
 
 
656 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  40.52 
 
 
746 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1699  fused adenylate cyclase and hybrid sensor diguanylate cyclase and response regulator  34.89 
 
 
316 aa  172  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  34.5 
 
 
523 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  43.81 
 
 
658 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  38.33 
 
 
936 aa  166  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  38.46 
 
 
860 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2176  diguanylate cyclase with GAF sensor  50.34 
 
 
321 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59733  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  39.45 
 
 
611 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  39.42 
 
 
861 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2886  diguanylate cyclase with GAF sensor  49.35 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.322967 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.01 
 
 
681 aa  164  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  39.92 
 
 
636 aa  163  5.0000000000000005e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4722  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.69 
 
 
323 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 
1550 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  43.07 
 
 
641 aa  160  5e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  46.2 
 
 
319 aa  160  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  36.11 
 
 
665 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.96 
 
 
348 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.96 
 
 
348 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  38.39 
 
 
734 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  34.57 
 
 
417 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  36.29 
 
 
864 aa  156  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  35.56 
 
 
858 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  37.21 
 
 
911 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3260  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.6 
 
 
327 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  34.03 
 
 
859 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  35.71 
 
 
614 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3513  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.51 
 
 
326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.668666  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.92 
 
 
743 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.766687  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3158  diguanylate cyclase  41.92 
 
 
325 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0066  GGDEF domain-containing protein  39.02 
 
 
743 aa  153  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928161  normal  0.0154172 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  39.72 
 
 
903 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3037  GGDEF domain-containing protein  44.94 
 
 
320 aa  151  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  35.91 
 
 
758 aa  150  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2011  diguanylate cyclase  39.49 
 
 
321 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0759816  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3085  diguanylate cyclase  44.81 
 
 
323 aa  149  7e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0864  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.35 
 
 
323 aa  149  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3096  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  45.28 
 
 
595 aa  149  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665544  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  43.63 
 
 
284 aa  149  9e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.56 
 
 
696 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2253  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  37.82 
 
 
780 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3138  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.68 
 
 
345 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1949  diguanylate cyclase, putative  42.51 
 
 
327 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  35.27 
 
 
479 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  40.54 
 
 
528 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  36.44 
 
 
696 aa  147  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  36.89 
 
 
546 aa  147  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2826  hypothetical protein  33.59 
 
 
314 aa  146  6e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  36.77 
 
 
760 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  42.2 
 
 
343 aa  146  7.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 
399 aa  145  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3759  GGDEF domain-containing protein  44.72 
 
 
324 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  33.2 
 
 
529 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  43.59 
 
 
267 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.72 
 
 
701 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0800  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  43.62 
 
 
781 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2140  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.32 
 
 
318 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  43.59 
 
 
276 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02131  GGDEF domain-containing PAS signal transduction protein  41.18 
 
 
794 aa  145  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.43 
 
 
764 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  48.59 
 
 
506 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0833  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.86 
 
 
322 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  45.35 
 
 
728 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0535292  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0289  adenylate/guanylate cyclase  30.89 
 
 
526 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2479  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.59 
 
 
531 aa  144  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.838154  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0894  diguanylate cyclase  44.97 
 
 
323 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.499341  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.93 
 
 
737 aa  144  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.65 
 
 
753 aa  144  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15351  GAF domain-containing protein  40.91 
 
 
238 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.87 
 
 
662 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0918  diguanylate cyclase with GAF sensor  44.97 
 
 
323 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  35.93 
 
 
794 aa  143  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  37.09 
 
 
645 aa  144  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.58 
 
 
878 aa  143  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3217  diguanylate cyclase  33.33 
 
 
345 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.201545  normal  0.0694192 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3444  diguanylate cyclase  44.97 
 
 
323 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 
680 aa  143  7e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3108  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.54 
 
 
323 aa  143  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  36.36 
 
 
638 aa  143  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  33.78 
 
 
701 aa  143  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0928  diguanylate cyclase  44.3 
 
 
323 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4495  adenylate/guanylate cyclase  33.77 
 
 
532 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4543  GAF domain/GGDEF domain/EAL domain protein  42.86 
 
 
607 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38768  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  38.82 
 
 
542 aa  142  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  34.93 
 
 
701 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0812  Stage II sporulation E family protein  41.82 
 
 
422 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1466  GAF domain-containing protein  42.5 
 
 
249 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3263  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  42.33 
 
 
669 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  40.61 
 
 
729 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  33.91 
 
 
738 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  35.43 
 
 
759 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  38.1 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>