171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1187 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1187  hypothetical protein  100 
 
 
795 aa  1663    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1193  hypothetical protein  95.72 
 
 
795 aa  1596    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  32.89 
 
 
423 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  33.33 
 
 
324 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  32.46 
 
 
324 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  32.46 
 
 
324 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  32.46 
 
 
324 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  32.02 
 
 
324 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  32.02 
 
 
324 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  32.46 
 
 
324 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  32.46 
 
 
324 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  32.46 
 
 
324 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.24 
 
 
335 aa  107  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  32.46 
 
 
324 aa  106  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  31.67 
 
 
335 aa  103  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  30.14 
 
 
308 aa  100  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  30 
 
 
335 aa  99.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.95 
 
 
325 aa  94  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  31.84 
 
 
332 aa  92.8  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  34.43 
 
 
342 aa  92.8  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  34.43 
 
 
342 aa  92.8  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  34.43 
 
 
329 aa  92.8  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 
332 aa  91.7  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  29.53 
 
 
303 aa  91.7  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  31.39 
 
 
332 aa  89.4  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  32.21 
 
 
361 aa  88.6  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  28.52 
 
 
357 aa  87.8  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  32.28 
 
 
335 aa  87.4  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  30.94 
 
 
344 aa  85.9  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  30.29 
 
 
362 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  27.67 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  30.18 
 
 
352 aa  84  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  27.2 
 
 
362 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  31.98 
 
 
356 aa  83.2  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  30.36 
 
 
336 aa  82.4  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  29.91 
 
 
334 aa  80.5  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  29.44 
 
 
365 aa  80.1  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  30 
 
 
353 aa  79.3  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  28.43 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2484  hypothetical protein  30.41 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171929  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  35.59 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  32.14 
 
 
325 aa  77  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  30.81 
 
 
331 aa  77.4  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1801  beta-lactamase domain protein  29.02 
 
 
330 aa  77  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  26.86 
 
 
320 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1825  outer membrane protein  27.36 
 
 
362 aa  77  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  31.13 
 
 
353 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  31.13 
 
 
353 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  29.96 
 
 
362 aa  75.1  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.75 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  27.22 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  32.89 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  29.95 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1076  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.84 
 
 
419 aa  74.7  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38719  predicted protein  25.7 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248337  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  27.93 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  26.63 
 
 
320 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  26.63 
 
 
320 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1210  hypothetical protein  29.61 
 
 
358 aa  73.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00957617  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0291  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  28.66 
 
 
372 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  25.15 
 
 
320 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0291  hypothetical protein  28.66 
 
 
356 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619588  hitchhiker  0.0000166139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0248  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 
353 aa  72.4  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01370  conserved hypothetical protein  25.32 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3094  hypothetical protein  28.57 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.815715 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2724  hypothetical protein  25.44 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000835291  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0356  twin-arginine translocation pathway signal  28.35 
 
 
353 aa  70.5  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  27.68 
 
 
351 aa  70.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2786  hypothetical protein  28.14 
 
 
392 aa  70.5  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000899  membrane protein  27.54 
 
 
414 aa  70.1  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3728  hypothetical protein  27.44 
 
 
356 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000279233 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  26.6 
 
 
358 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  30.23 
 
 
358 aa  70.1  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0295  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  27.78 
 
 
318 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03132  Zn-dependent hydrolase/oxidoreductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13010)  31.11 
 
 
414 aa  68.9  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.614609  normal  0.131518 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2256  Zn-dependent hydrolase  30.95 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  26.4 
 
 
320 aa  68.9  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  23.72 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  29.65 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.27 
 
 
386 aa  67  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0369  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  28.25 
 
 
330 aa  67.4  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  27.22 
 
 
364 aa  67  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.92 
 
 
385 aa  67  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  30.11 
 
 
376 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  27.22 
 
 
367 aa  66.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  30.08 
 
 
363 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3291  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 
292 aa  65.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.841788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0332  multidrug resistance protein RomA  28.57 
 
 
333 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0128421  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1004  hypothetical protein  30.06 
 
 
361 aa  65.1  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  26.41 
 
 
361 aa  64.3  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  31.9 
 
 
362 aa  64.3  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  29.55 
 
 
368 aa  64.3  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0511  beta-lactamase-like  27.53 
 
 
324 aa  64.3  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  26.64 
 
 
364 aa  64.3  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04610  conserved hypothetical protein  29.56 
 
 
434 aa  63.9  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.65 
 
 
374 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  30.07 
 
 
350 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1077  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
367 aa  63.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.600818 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>