More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1155 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  100 
 
 
495 aa  1025    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  97.17 
 
 
495 aa  1002    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  35.57 
 
 
479 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  36.67 
 
 
470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  33.41 
 
 
436 aa  236  6e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  35.03 
 
 
435 aa  232  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  35.45 
 
 
468 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  33.57 
 
 
445 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  32.94 
 
 
466 aa  221  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  32.27 
 
 
427 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  32.18 
 
 
445 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  30.26 
 
 
463 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  31.7 
 
 
481 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  28.67 
 
 
418 aa  166  9e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  28.35 
 
 
628 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  28.93 
 
 
1199 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.602004 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  33.13 
 
 
1274 aa  153  7e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  31.69 
 
 
433 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  29.14 
 
 
422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  29.01 
 
 
422 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  28 
 
 
415 aa  130  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  29.93 
 
 
413 aa  130  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  27.31 
 
 
420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  28.95 
 
 
422 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  27.38 
 
 
418 aa  126  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  27.5 
 
 
429 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  28.16 
 
 
414 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  28.03 
 
 
409 aa  124  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  26.81 
 
 
417 aa  123  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  27.67 
 
 
463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  26.76 
 
 
456 aa  121  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  27.03 
 
 
442 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  26.25 
 
 
419 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  26.54 
 
 
442 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  26.37 
 
 
436 aa  118  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  27.12 
 
 
420 aa  118  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  26.64 
 
 
429 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  26.02 
 
 
474 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44106  predicted protein  25.81 
 
 
577 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.287897  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  27.25 
 
 
424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  27.66 
 
 
494 aa  114  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  26.36 
 
 
450 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  35.92 
 
 
999 aa  111  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  26.94 
 
 
430 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  26.23 
 
 
536 aa  110  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  26.44 
 
 
476 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  27.37 
 
 
470 aa  107  6e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  26.25 
 
 
657 aa  106  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  24.42 
 
 
480 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28515  corticosteroid- binding protein  25.84 
 
 
477 aa  105  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15534  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  24.82 
 
 
425 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  24.41 
 
 
446 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  26.52 
 
 
451 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  26.52 
 
 
485 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  25.53 
 
 
458 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  32.64 
 
 
413 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  24.25 
 
 
457 aa  100  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  25.78 
 
 
439 aa  99  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0048  twin-arginine translocation pathway signal  25.06 
 
 
476 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708369  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  26.74 
 
 
445 aa  96.7  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  23.91 
 
 
434 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  25.85 
 
 
423 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  24.78 
 
 
454 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  25.53 
 
 
438 aa  94  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  26.51 
 
 
422 aa  94  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  22.79 
 
 
449 aa  93.2  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  25.64 
 
 
592 aa  92  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  24.51 
 
 
459 aa  91.3  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  22.37 
 
 
484 aa  89.7  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  30.8 
 
 
422 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  27.34 
 
 
407 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  23.16 
 
 
465 aa  88.2  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  24.66 
 
 
459 aa  87.8  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  25.3 
 
 
419 aa  87.8  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  26.56 
 
 
411 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  23.89 
 
 
492 aa  86.7  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  25.83 
 
 
426 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  25.78 
 
 
484 aa  83.2  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  24.22 
 
 
492 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  22.99 
 
 
447 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  23.55 
 
 
431 aa  82.4  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  23.92 
 
 
412 aa  82.4  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  23.61 
 
 
469 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  23.67 
 
 
456 aa  80.9  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46399  predicted protein  29 
 
 
408 aa  80.1  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  24.46 
 
 
469 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  24.27 
 
 
619 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  23.39 
 
 
450 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  23.33 
 
 
496 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  23.39 
 
 
450 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  24.22 
 
 
616 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  24.02 
 
 
619 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  25.73 
 
 
625 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  23.38 
 
 
496 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48603  flavin-containing amine oxidase  23.82 
 
 
600 aa  76.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.871635  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  23.68 
 
 
446 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  23.4 
 
 
463 aa  75.1  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  25.31 
 
 
491 aa  74.7  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  23.28 
 
 
482 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  24.16 
 
 
565 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>