58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1117 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1117  hypothetical protein  100 
 
 
782 aa  1583    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1121  hypothetical protein  92.71 
 
 
782 aa  1469    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  31.01 
 
 
1362 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  27.35 
 
 
848 aa  113  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  27.32 
 
 
846 aa  109  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  28.05 
 
 
846 aa  106  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  28.44 
 
 
613 aa  103  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  29.66 
 
 
360 aa  102  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  29.66 
 
 
360 aa  102  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  29.66 
 
 
360 aa  102  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  29.66 
 
 
360 aa  102  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  27.3 
 
 
680 aa  100  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  29.5 
 
 
341 aa  99  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 
360 aa  98.2  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  27.8 
 
 
510 aa  97.4  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  30.43 
 
 
460 aa  97.1  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  29.66 
 
 
360 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  29.66 
 
 
360 aa  95.9  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  27.13 
 
 
648 aa  95.5  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  29.66 
 
 
360 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  29.31 
 
 
360 aa  94.7  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  28.32 
 
 
420 aa  94.4  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  28.01 
 
 
846 aa  92  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  28.36 
 
 
551 aa  92  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  27.74 
 
 
543 aa  83.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  26.39 
 
 
468 aa  81.6  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  26.88 
 
 
1578 aa  77.4  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  25.9 
 
 
467 aa  72.4  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  24.66 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  27.62 
 
 
516 aa  65.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.894433 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  29.21 
 
 
1782 aa  60.8  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  28.06 
 
 
1132 aa  58.2  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  29.87 
 
 
551 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  28.8 
 
 
536 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50155  chitinase chitin binding glycoside hydrolase family 1  31.39 
 
 
525 aa  54.3  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.487357  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 
1443 aa  53.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  28.08 
 
 
1246 aa  53.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.500879 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0039  hypothetical protein  37.8 
 
 
94 aa  52.8  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3523  glycoside hydrolase family protein  25.74 
 
 
375 aa  52.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.416811  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00541  conserved hypothetical protein  23.31 
 
 
1598 aa  52  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  27.42 
 
 
801 aa  51.2  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  28 
 
 
634 aa  50.8  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  36.78 
 
 
189 aa  50.8  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11063  class III chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03850)  25.91 
 
 
305 aa  50.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.111184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  28.33 
 
 
1115 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  23.65 
 
 
492 aa  49.3  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3736  chitinase D  25.82 
 
 
174 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61469e-18 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  29.03 
 
 
578 aa  48.5  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2141  chitinase  23.26 
 
 
665 aa  48.1  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.274855  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  26.85 
 
 
699 aa  46.2  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  27.52 
 
 
727 aa  46.6  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  25.85 
 
 
565 aa  45.8  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  27.07 
 
 
541 aa  45.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  24.49 
 
 
729 aa  44.7  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  24.49 
 
 
729 aa  44.7  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl347  chitinase  21.56 
 
 
1113 aa  44.7  0.007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135445  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  33.33 
 
 
471 aa  44.3  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
471 aa  44.3  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>