68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1055 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1055  hypothetical protein  100 
 
 		 659 aa  1372    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2398  hypothetical protein  75.31 
 
 		 668 aa  1034    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1016  hypothetical protein  96.11 
 
 		 644 aa  1290    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0632  hypothetical protein  40.92 
 
 		 708 aa  502  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4179  putative plasmid transfer protein  39.5 
 
 		 704 aa  478  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4096  putative plasmid transfer protein  38.91 
 
 		 730 aa  476  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0326  putative plasmid transfer protein  39.23 
 
 		 704 aa  477  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0645  TraG-family protein  37.15 
 
 		 703 aa  474  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3718  hypothetical protein  37.15 
 
 		 706 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.387295  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2336  hypothetical protein  37.37 
 
 		 729 aa  460  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000037751  unclonable  0.000000407207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1195  hypothetical protein  37.37 
 
 		 728 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0527  hypothetical protein  37.41 
 
 		 730 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3414  hypothetical protein  38.25 
 
 		 733 aa  459  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41428  normal  0.0672009 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1638  hypothetical protein  37.66 
 
 		 719 aa  462  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1274  hypothetical protein  37.23 
 
 		 730 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1408  hypothetical protein  37.72 
 
 		 730 aa  458  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.950579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2208  hypothetical protein  37.57 
 
 		 718 aa  456  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395932  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4169  hypothetical protein  38.04 
 
 		 727 aa  458  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3012  hypothetical protein  38.02 
 
 		 701 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0963  hypothetical protein  37.1 
 
 		 718 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969966  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0673  hypothetical protein  38.01 
 
 		 719 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3305  hypothetical protein  38 
 
 		 707 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.705232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0448  hypothetical protein  36.35 
 
 		 719 aa  451  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2380  hypothetical protein  37.13 
 
 		 718 aa  450  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.248119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4501  TraG/TraD family protein  37.84 
 
 		 743 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59690  hypothetical protein  38.11 
 
 		 744 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000194089  decreased coverage  4.4297400000000005e-19 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2845  hypothetical protein  37.56 
 
 		 721 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1454  hypothetical protein  38.15 
 
 		 719 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.244013 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2934  hypothetical protein  37.7 
 
 		 708 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1751  hypothetical protein  37.82 
 
 		 743 aa  439  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3937  hypothetical protein  38.07 
 
 		 664 aa  435  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280709  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2764  hypothetical protein  34.82 
 
 		 752 aa  405  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4330  hypothetical protein  29.04 
 
 		 637 aa  228  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2815  type IV conjugative transfer system protein TraD  29.64 
 
 		 615 aa  225  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1549  hypothetical protein  28.61 
 
 		 633 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167533  normal  0.131321 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0066  type IV conjugative transfer system protein TraD  27.68 
 
 		 621 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4266  hypothetical protein  27.14 
 
 		 629 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2598  hypothetical protein  27.26 
 
 		 635 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.887082  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2307  hypothetical protein  27.95 
 
 		 635 aa  210  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3750  hypothetical protein  29.22 
 
 		 635 aa  208  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5471  hypothetical protein  26.39 
 
 		 635 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.170815 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5224  hypothetical protein  24.41 
 
 		 650 aa  186  8e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571099  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0881  hypothetical protein  44.29 
 
 		 293 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6309  hypothetical protein  28.27 
 
 		 622 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.800389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5183  hypothetical protein  27.89 
 
 		 618 aa  183  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1518  hypothetical protein  27.89 
 
 		 618 aa  183  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4741  hypothetical protein  25.26 
 
 		 629 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.404612 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5613  hypothetical protein  26.09 
 
 		 622 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6502  hypothetical protein  25.71 
 
 		 622 aa  160  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571397  normal  0.732963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1175  hypothetical protein  43.35 
 
 		 290 aa  151  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4264  hypothetical protein  22.26 
 
 		 624 aa  134  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000613459  normal  0.436086 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  28.3 
 
 		 464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  25.53 
 
 		 457 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  25.53 
 
 		 457 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3798  TraG family protein  24.82 
 
 		 470 aa  108  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  24.19 
 
 		 455 aa  99.8  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0361  sex pilus assembly and mating pair formation  23.89 
 
 		 589 aa  94  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1251  lipoprotein, putative  23.28 
 
 		 619 aa  74.3  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.684077  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0738  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  22.95 
 
 		 557 aa  71.2  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3686  DotL  22.06 
 
 		 786 aa  60.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00900266  normal  0.235831 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3242  hypothetical protein  35.87 
 
 		 612 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4965  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.94 
 
 		 579 aa  52  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5394  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.94 
 
 		 579 aa  52.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.709491  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1477  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  35.62 
 
 		 609 aa  48.5  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0124  mobilization protein  35.62 
 
 		 635 aa  47.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.795434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0314  hypothetical protein  26.92 
 
 		 425 aa  48.1  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0122  putative type IV secretion system protein IcmO/DotL  20.93 
 
 		 934 aa  45.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0365  TRAG protein  37.36 
 
 		 661 aa  44.3  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00756366  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>