More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1015 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1015  hypothetical protein  100 
 
 
555 aa  1146    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0982  hypothetical protein  97.84 
 
 
555 aa  1127    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  40.37 
 
 
554 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597598  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0356  AMP-dependent synthetase and ligase  40.37 
 
 
554 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000116911  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0359  AMP-dependent synthetase and ligase  40.37 
 
 
554 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00409412  decreased coverage  0.000000000100216 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  38.99 
 
 
551 aa  420  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000026311  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4587  AMP-dependent synthetase and ligase  39.74 
 
 
551 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000231553  unclonable  0.0000000387525 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0355  AMP-binding protein  40.11 
 
 
554 aa  413  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3437  AMP-dependent synthetase and ligase  39.33 
 
 
555 aa  412  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.915272  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0349  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 
554 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000814911  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  40.3 
 
 
554 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0326  AMP-dependent synthetase and ligase  40.3 
 
 
554 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  0.942531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3814  AMP-dependent synthetase and ligase  40.3 
 
 
554 aa  412  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.354824  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3502  AMP-dependent synthetase and ligase  39.37 
 
 
551 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0361  AMP-dependent synthetase and ligase  40.11 
 
 
575 aa  402  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2970  AMP-dependent synthetase and ligase  37.27 
 
 
546 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383632  normal  0.0772174 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0261  AMP-dependent synthetase and ligase  38.59 
 
 
551 aa  402  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000998406  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01022  AMP-binding protein  39.42 
 
 
559 aa  404  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  38.81 
 
 
555 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2464  AMP-dependent synthetase and ligase  36.86 
 
 
555 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105323  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0998  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 
546 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231761  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  38.82 
 
 
547 aa  395  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  39.82 
 
 
554 aa  389  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00109176  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1090  AMP-dependent synthetase and ligase  37.8 
 
 
555 aa  391  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4205  AMP-dependent synthetase and ligase  36.81 
 
 
551 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3656  putative AMP-binding protein  35.95 
 
 
555 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.330411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43610  putative AMP-binding protein  35.4 
 
 
555 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297438  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0267  AMP-dependent synthetase and ligase  35.65 
 
 
563 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002639  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.17 
 
 
563 aa  361  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.409821  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1920  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.68 
 
 
563 aa  360  5e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.022094  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3811  AMP-dependent synthetase and ligase  36.41 
 
 
547 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2888  AMP-dependent synthetase and ligase  35.39 
 
 
560 aa  355  8.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0719534  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03363  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.4 
 
 
563 aa  355  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2479  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 
559 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0631  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  35.92 
 
 
558 aa  348  1e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.365879  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0284  long-chain-fatty-acid-CoA ligase, putative  35.78 
 
 
553 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5098  AMP-dependent synthetase and ligase  34.33 
 
 
566 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.183916  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0675  AMP-binding protein  34.13 
 
 
547 aa  336  5e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2780  AMP-binding domain-containing protein  35.41 
 
 
598 aa  336  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1154  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  35.41 
 
 
598 aa  336  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2935  AMP-binding domain-containing protein  35.41 
 
 
553 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  27.91 
 
 
607 aa  239  8e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  26.18 
 
 
602 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  29.6 
 
 
603 aa  225  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.6 
 
 
610 aa  224  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  28.23 
 
 
605 aa  225  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.84 
 
 
599 aa  223  7e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  27.64 
 
 
596 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  30.49 
 
 
592 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  26.46 
 
 
592 aa  220  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  27.87 
 
 
602 aa  219  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  27.74 
 
 
593 aa  219  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  26.98 
 
 
610 aa  219  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  28.96 
 
 
604 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  29.01 
 
 
604 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  27 
 
 
620 aa  217  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  29.26 
 
 
603 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4067  AMP-dependent synthetase and ligase  26.8 
 
 
603 aa  216  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.675218  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  26.76 
 
 
609 aa  216  9e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  28.5 
 
 
663 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  27.58 
 
 
610 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  26.63 
 
 
600 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  26.95 
 
 
616 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  27.35 
 
 
603 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  27.37 
 
 
600 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  28.16 
 
 
599 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  28.83 
 
 
596 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  26.6 
 
 
599 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  27.55 
 
 
607 aa  213  5.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  27.67 
 
 
633 aa  213  9e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  29.56 
 
 
590 aa  212  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  28.21 
 
 
604 aa  213  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  26.14 
 
 
599 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3508  AMP-dependent synthetase and ligase  26.17 
 
 
607 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185945  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  28.14 
 
 
633 aa  212  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  28.45 
 
 
587 aa  210  5e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  27.77 
 
 
610 aa  210  6e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  26.78 
 
 
610 aa  209  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  27.06 
 
 
610 aa  208  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  27.22 
 
 
592 aa  207  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  26.77 
 
 
600 aa  206  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  26.16 
 
 
609 aa  205  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  25.55 
 
 
605 aa  204  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  28.02 
 
 
509 aa  204  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  28.91 
 
 
613 aa  204  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  25.6 
 
 
609 aa  204  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  25.66 
 
 
679 aa  204  5e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  26.63 
 
 
605 aa  203  6e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  24.87 
 
 
626 aa  203  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  26.85 
 
 
598 aa  203  7e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  27.6 
 
 
601 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  25.86 
 
 
630 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  27.63 
 
 
612 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  28.77 
 
 
592 aa  202  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  25.68 
 
 
597 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  25.68 
 
 
597 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.75 
 
 
597 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  27.7 
 
 
610 aa  201  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  25.85 
 
 
597 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  27.01 
 
 
601 aa  200  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>