40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1007 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1007  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  591  1e-168  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1579  hypothetical protein  39.84 
 
 
464 aa  139  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1801  GALA protein 3  38.33 
 
 
522 aa  125  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.0997916 
 
 
-
 
NC_003296  RS01686  GALA protein 1  34.09 
 
 
661 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1356  GALA protein 4  34.23 
 
 
620 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222227  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1800  GALA protein  31.63 
 
 
401 aa  95.9  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0919922 
 
 
-
 
NC_003296  RS01777  GALA protein  34.34 
 
 
981 aa  93.2  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254341  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1436  hypothetical protein  30.5 
 
 
815 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0147013 
 
 
-
 
NC_003296  RS02003  GALA protein  33.33 
 
 
518 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128117  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1477  hypothetical protein  29.48 
 
 
614 aa  82.8  0.000000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  28.83 
 
 
344 aa  82  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4051  hypothetical protein  32.26 
 
 
400 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1357  GALA protein 5  29.17 
 
 
647 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146674  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0112  cyclin domain-containing protein  32.21 
 
 
770 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0458  leucine-rich repeat-containing ribonuclease inhibitor  24.03 
 
 
516 aa  67  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363451  normal  0.370511 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34199  predicted protein  31.67 
 
 
471 aa  65.9  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1120  hypothetical protein  27.35 
 
 
781 aa  65.9  0.0000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42557  predicted protein  28.14 
 
 
692 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0725  hypothetical protein  28.36 
 
 
510 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.426015 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1852  hypothetical protein  29.41 
 
 
553 aa  56.2  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_1199  predicted protein  29.37 
 
 
486 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.89 
 
 
1107 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1857  hypothetical protein  29.41 
 
 
553 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0526  hypothetical protein  28.68 
 
 
372 aa  52.8  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1227  hypothetical protein  28.57 
 
 
430 aa  52.8  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643545 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40174  predicted protein  27.27 
 
 
897 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.18 
 
 
1655 aa  49.3  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34148  predicted protein  27.64 
 
 
466 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0271154  normal  0.859268 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39238  predicted protein  26.76 
 
 
591 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.975604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  31.42 
 
 
760 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  31.7 
 
 
766 aa  46.6  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  29.6 
 
 
760 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47188  predicted protein  24.07 
 
 
916 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0110  hypothetical protein  31.41 
 
 
254 aa  43.9  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  29.88 
 
 
1266 aa  43.5  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  24.72 
 
 
474 aa  43.1  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1383  hypothetical protein  26.39 
 
 
465 aa  42.7  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  36.17 
 
 
507 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  28.9 
 
 
374 aa  42.4  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  25.11 
 
 
1344 aa  42.4  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>