More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0847 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0847  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  100 
 
 
331 aa  676    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0822  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  98.2 
 
 
333 aa  662    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1044  biotin operon repressor  39.94 
 
 
323 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0937  bifunctional protein birA  39.94 
 
 
323 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2717  biotin--protein ligase  36.94 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000120108  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00240  biotin--protein ligase  38.03 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2876  biotin--protein ligase  36.33 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4564  biotin--protein ligase  36.22 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3943  biotin--protein ligase  36.77 
 
 
320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.596693  decreased coverage  0.000472258 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4471  biotin--protein ligase  36.13 
 
 
320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000340796  hitchhiker  0.00000000000240151 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4381  biotin--protein ligase  36.13 
 
 
320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4468  biotin--protein ligase  36.13 
 
 
320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  hitchhiker  0.00169649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4349  biotin--protein ligase  36.13 
 
 
320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000983671  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4546  biotin--protein ligase  36.13 
 
 
320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000449604  hitchhiker  0.00000000138084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0610  birA bifunctional protein  36.22 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002163  biotin-protein ligase/biotin operon repressor  35.56 
 
 
321 aa  196  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03854  biotin-protein ligase  34.52 
 
 
321 aa  189  8e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0188201  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1781  birA bifunctional protein  33.02 
 
 
331 aa  189  8e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4047  biotin--protein ligase  34.52 
 
 
321 aa  189  8e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0641292  hitchhiker  0.00297103 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4512  biotin--protein ligase  34.52 
 
 
321 aa  189  8e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295045  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4207  biotin--protein ligase  34.52 
 
 
321 aa  189  8e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000658318  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3926  biotin--protein ligase  33.23 
 
 
321 aa  189  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541608  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4461  biotin--protein ligase  34.52 
 
 
321 aa  189  8e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000740491  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03807  hypothetical protein  34.52 
 
 
321 aa  189  8e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4421  biotin--protein ligase  34.52 
 
 
321 aa  188  9e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000434302  hitchhiker  0.00072275 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0219  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.55 
 
 
322 aa  188  9e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.440436  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5438  biotin--protein ligase  34.52 
 
 
321 aa  188  9e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000183056  hitchhiker  0.00134266 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4017  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.52 
 
 
321 aa  188  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0118949  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0467  biotin--protein ligase  34.88 
 
 
319 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800228  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3871  biotin--protein ligase  34.91 
 
 
319 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000364778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0327  biotin--protein ligase  34.91 
 
 
319 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0364706  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3396  biotin--protein ligase  34.91 
 
 
319 aa  187  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.199101  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0132  biotin--protein ligase  35.08 
 
 
320 aa  185  9e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000234608  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0268  biotin--protein ligase  35.53 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0393829  hitchhiker  0.0050705 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3740  biotin--protein ligase  33.65 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00032759  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0915  biotin--(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  32.13 
 
 
332 aa  181  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.277179  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08620  biotin--protein ligase  34.16 
 
 
312 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000664696 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0154  biotin--protein ligase  33.33 
 
 
323 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00266236  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3998  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.86 
 
 
328 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00153965  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0214  biotin--protein ligase  34.81 
 
 
319 aa  178  9e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0182  biotin--protein ligase  33.77 
 
 
319 aa  178  9e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000279859  normal  0.096767 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0142  biotin--protein ligase  33.01 
 
 
319 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.330287  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0183  biotin--protein ligase  33.44 
 
 
319 aa  178  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00618712  normal  0.258521 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4334  biotin--protein ligase  31.02 
 
 
320 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.152634  hitchhiker  0.00000000217796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5096  biotin--protein ligase  34.98 
 
 
317 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000301513  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0195  biotin--protein ligase  34.19 
 
 
319 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4174  biotin--protein ligase  31.07 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000228488  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0184  biotin--protein ligase  31.05 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.570128  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0180  biotin--protein ligase  31.07 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0210584  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3775  biotin--protein ligase  32.08 
 
 
319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00231404  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06050  biotin--protein ligase  35.49 
 
 
330 aa  172  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0470  biotin--protein ligase  35.71 
 
 
319 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0969933  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4072  biotin--protein ligase  31.39 
 
 
319 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3895  biotin--protein ligase  32.08 
 
 
319 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.282712  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0437  biotin--protein ligase  35.71 
 
 
319 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193351  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4766  biotin--protein ligase  34.78 
 
 
321 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0199355  normal  0.789599 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0406  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.77 
 
 
326 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.617579  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0201  biotin--protein ligase  33.22 
 
 
319 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4745  biotin--protein ligase  31.72 
 
 
333 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.167382  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03573  putative BirA bifunctional protein  31.29 
 
 
328 aa  168  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.184427  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0197  biotin--protein ligase  32.65 
 
 
317 aa  163  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00143406  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0177  biotin--protein ligase  33.77 
 
 
319 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131379  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2082  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.65 
 
 
329 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0419  biotin--protein ligase  33.86 
 
 
310 aa  160  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2081  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.99 
 
 
325 aa  158  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2817  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.48 
 
 
336 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000210207  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4706  biotin--protein ligase  31 
 
 
320 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.144079  hitchhiker  0.00201782 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0702  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.58 
 
 
319 aa  155  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0362526  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00660  biotin (acetyl-CoA carboxylase) synthetase  31.4 
 
 
326 aa  155  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4292  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.56 
 
 
317 aa  155  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.422429  hitchhiker  0.0000115964 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2459  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.69 
 
 
329 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.472126  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0816  biotin--protein ligase  33.33 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0168  biotin--protein ligase  30.37 
 
 
320 aa  151  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00063361  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2119  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.36 
 
 
329 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0440  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.09 
 
 
336 aa  149  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.028543  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1704  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  29.45 
 
 
326 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0104372  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0460  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.81 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0775  transcriptional repressor of the biotin operon / biotin acetyl-CoA-carboxylase synthetase; RBL03563  32 
 
 
325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000728901  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0134  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.79 
 
 
326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00373648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1987  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.31 
 
 
338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.417612  normal  0.841631 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2431  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.45 
 
 
330 aa  147  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552331  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1317  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.66 
 
 
328 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.61009  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0500  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.09 
 
 
329 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1935  birA biofunctional protein, putative  30.67 
 
 
323 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.976784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1447  birA bifunctional protein  29.14 
 
 
326 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.867427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1419  biotin operon repressor  29.14 
 
 
326 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1560  bifunctional biotin operon repressor/biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] synthetase  29.14 
 
 
326 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1631  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  29.14 
 
 
326 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.104533 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1420  biotin operon repressor  29.14 
 
 
326 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0085  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.08 
 
 
323 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00153974  normal  0.0550519 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1261  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.45 
 
 
326 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1666  birA bifunctional protein  29.14 
 
 
326 aa  143  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2585  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.53 
 
 
338 aa  143  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000643253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3752  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  28.83 
 
 
326 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1058  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.36 
 
 
326 aa  142  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.101759  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0244  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.71 
 
 
329 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  0.860661 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1588  biotin--(acetyl-COA-carboxylase) synthetase  31.94 
 
 
326 aa  142  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1463  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.14 
 
 
326 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1903  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.43 
 
 
327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.37759 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1593  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  28.22 
 
 
326 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>