More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0739 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0739  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  769    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0720  hypothetical protein  99.47 
 
 
378 aa  766    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  40.75 
 
 
379 aa  300  2e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  38.4 
 
 
381 aa  297  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  38.62 
 
 
380 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  40.11 
 
 
376 aa  296  4e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  37.63 
 
 
384 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  37.37 
 
 
384 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.2 
 
 
384 aa  292  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  37.17 
 
 
384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  35.34 
 
 
388 aa  275  6e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  34.21 
 
 
387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  38.21 
 
 
378 aa  272  5.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  38.03 
 
 
378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  35.62 
 
 
378 aa  270  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  36.32 
 
 
378 aa  269  7e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  36.46 
 
 
382 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  37.57 
 
 
374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  34.32 
 
 
390 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3666  hypothetical protein  35.85 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  35.15 
 
 
385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  34.06 
 
 
385 aa  239  8e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  34.5 
 
 
390 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.0000152274  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2927  ABC-2 type transporter  35.11 
 
 
378 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  35.22 
 
 
377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3129  ABC-2 transporter component  34.64 
 
 
378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000316988  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  33.95 
 
 
382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  35.66 
 
 
691 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  32.89 
 
 
390 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  35.22 
 
 
377 aa  231  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
368 aa  224  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  33.42 
 
 
371 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  33.96 
 
 
369 aa  206  5e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  32.71 
 
 
367 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  31.88 
 
 
381 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  31.72 
 
 
371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.35 
 
 
365 aa  188  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  30.55 
 
 
380 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  30.91 
 
 
382 aa  186  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  28.95 
 
 
379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  31.27 
 
 
370 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  32.1 
 
 
370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  28.72 
 
 
373 aa  182  6e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 
369 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  28.72 
 
 
373 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  30.27 
 
 
373 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  28.72 
 
 
373 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 
373 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 
373 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 
373 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 
373 aa  178  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  28.23 
 
 
373 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 
373 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  30.57 
 
 
369 aa  176  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  32.17 
 
 
366 aa  175  9e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  29.26 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  30.21 
 
 
369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  30.53 
 
 
366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  29.13 
 
 
375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 
366 aa  171  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  29.14 
 
 
377 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  30.4 
 
 
376 aa  169  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  29.97 
 
 
376 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  29.63 
 
 
369 aa  165  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 
405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 
373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 
376 aa  164  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 
376 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 
376 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 
380 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 
369 aa  159  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  28.3 
 
 
369 aa  159  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  27.97 
 
 
380 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 
380 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  28.23 
 
 
378 aa  157  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  28.84 
 
 
377 aa  156  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  28.42 
 
 
375 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 
368 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  29.16 
 
 
366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 
377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  27.64 
 
 
368 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  27.64 
 
 
368 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  27.64 
 
 
368 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  27.64 
 
 
368 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  27.7 
 
 
373 aa  153  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  27.64 
 
 
368 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  27.96 
 
 
371 aa  152  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  26.51 
 
 
376 aa  151  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  29.18 
 
 
376 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  27.64 
 
 
368 aa  151  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 
368 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  27.96 
 
 
369 aa  150  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  27.49 
 
 
370 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 
378 aa  149  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  27.37 
 
 
380 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  25.88 
 
 
371 aa  149  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 
368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 
372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  26.63 
 
 
368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 
372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>