266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0601 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0601  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  446  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0582  hypothetical protein  99.53 
 
 
215 aa  446  1e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50 
 
 
215 aa  224  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587779 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0186  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.28 
 
 
213 aa  222  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626116  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1067  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.1 
 
 
211 aa  218  6e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4331  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.64 
 
 
215 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1436  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.11 
 
 
215 aa  215  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0332  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.14 
 
 
211 aa  213  1e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.207205 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3853  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.17 
 
 
215 aa  213  2e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0541085  normal  0.804089 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.01 
 
 
215 aa  211  8e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.225541  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.29 
 
 
215 aa  208  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225533  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0423  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.85 
 
 
211 aa  208  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190408  normal  0.079885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4286  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.95 
 
 
215 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1229  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.01 
 
 
215 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1165  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.48 
 
 
215 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2372  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.87 
 
 
229 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1129  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.48 
 
 
215 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1150  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.48 
 
 
215 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.343525  normal  0.105039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.7 
 
 
214 aa  204  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.01004e-05 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2817  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.57 
 
 
211 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal  0.0808941 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0663  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.67 
 
 
211 aa  203  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0728  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.48 
 
 
214 aa  203  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2616  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.01 
 
 
214 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2487  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.01 
 
 
214 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1895  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.19 
 
 
217 aa  201  9e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85169  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.67 
 
 
212 aa  199  2e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554957  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19500  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.7 
 
 
215 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187849  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1775  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.7 
 
 
215 aa  199  4e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0787  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.92 
 
 
212 aa  198  4e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.222265 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2893  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.29 
 
 
213 aa  198  4e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.01 
 
 
214 aa  197  8e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2568  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.01 
 
 
214 aa  197  8e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387899  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2592  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.01 
 
 
214 aa  197  1e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.984906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.92 
 
 
212 aa  197  1e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.07 
 
 
214 aa  196  2e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495337 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1243  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.76 
 
 
213 aa  196  2e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0527508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0886  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.55 
 
 
214 aa  196  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0555  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.19 
 
 
212 aa  196  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.410968  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0514  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.55 
 
 
212 aa  195  5e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.439872  normal  0.298122 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3221  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.28 
 
 
213 aa  195  5e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110352  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3489  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.66 
 
 
214 aa  193  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.481543  normal  0.892372 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0107  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.07 
 
 
214 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  2.3808e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0359  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.07 
 
 
214 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0016328  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0904  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.07 
 
 
214 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0158513  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0901  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.07 
 
 
214 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.901665  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0767  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.92 
 
 
212 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2494  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.07 
 
 
214 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00659427  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0659  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.07 
 
 
214 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0194138  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.13 
 
 
265 aa  193  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  9.6585e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11923  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.34 
 
 
213 aa  192  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227321  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1061  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.07 
 
 
214 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.040983  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0155  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.93 
 
 
211 aa  192  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.923059  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2993  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.02 
 
 
213 aa  192  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.047465  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0848  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.08 
 
 
217 aa  191  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0741  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.81 
 
 
213 aa  191  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643542  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2888  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.19 
 
 
210 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877962  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2564  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.29 
 
 
212 aa  189  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.252364  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.34 
 
 
214 aa  189  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0557  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.4 
 
 
214 aa  188  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.365319  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2642  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.71 
 
 
212 aa  188  6e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1016  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.42 
 
 
196 aa  188  6e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3586  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.06 
 
 
215 aa  188  6e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.63325  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2922  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.87 
 
 
211 aa  187  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.969034 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0417  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.02 
 
 
213 aa  187  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3713  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.13 
 
 
226 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2989  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.06 
 
 
215 aa  186  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.274237  normal  0.310077 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1146  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.89 
 
 
196 aa  186  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3944  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.33 
 
 
215 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000793587  normal  0.125259 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1992  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.81 
 
 
213 aa  184  6e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1881  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.81 
 
 
217 aa  184  8e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2058  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.29 
 
 
217 aa  184  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.183278  normal  0.448099 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4542  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.71 
 
 
214 aa  184  1e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3559  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.72 
 
 
239 aa  182  2e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.41957 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1311  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.07 
 
 
233 aa  182  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279184  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2931  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.86 
 
 
224 aa  181  6e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0829  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.39 
 
 
212 aa  181  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4533  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.47 
 
 
202 aa  181  8e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2803  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.86 
 
 
225 aa  181  9e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00595972  normal  0.551671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1006  Pyridoxal 5'-phosphate synthase  43.26 
 
 
217 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2153  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.23 
 
 
225 aa  180  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3947  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.39 
 
 
207 aa  178  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.932005 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001014  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.11 
 
 
211 aa  178  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0835  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.37 
 
 
200 aa  178  5e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2258  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.33 
 
 
212 aa  177  9e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.182808  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0930  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.38 
 
 
212 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1068  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.97 
 
 
210 aa  176  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326405  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.18 
 
 
221 aa  176  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32246  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.38 
 
 
212 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2478  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.23 
 
 
213 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.12705  normal  0.1751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.54 
 
 
214 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.912565  decreased coverage  3.90202e-05 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07092  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.11 
 
 
211 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02996  pyridoxine 5-phosphate oxidase  41.71 
 
 
212 aa  175  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.548346  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4813  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.74 
 
 
214 aa  174  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134817  normal  0.171584 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0521  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.4 
 
 
214 aa  174  1e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.745375  hitchhiker  0.00802215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1108  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.27 
 
 
208 aa  173  2e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.536628  normal  0.458712 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2059  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.65 
 
 
258 aa  173  2e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0352298  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4707  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  39.91 
 
 
225 aa  172  3e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0394  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.27 
 
 
215 aa  172  4e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.17512  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4664  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.97 
 
 
214 aa  172  4e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187726 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4295  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.97 
 
 
214 aa  172  4e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>