160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0592 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  769    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  99.21 
 
 
379 aa  765    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  29.31 
 
 
416 aa  169  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  34.04 
 
 
402 aa  136  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  29.84 
 
 
423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  27.92 
 
 
403 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  31.44 
 
 
405 aa  126  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  28.03 
 
 
402 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  26.72 
 
 
411 aa  123  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  26.6 
 
 
397 aa  123  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  25.94 
 
 
400 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  27.84 
 
 
409 aa  120  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  27.69 
 
 
404 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  26.9 
 
 
400 aa  116  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  26.22 
 
 
406 aa  116  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  29.33 
 
 
428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  26.26 
 
 
413 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  28.87 
 
 
400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  32.35 
 
 
410 aa  113  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  26.78 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  25.26 
 
 
444 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  29.39 
 
 
408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  31.62 
 
 
400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  26.48 
 
 
408 aa  109  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  25.71 
 
 
405 aa  109  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  26.85 
 
 
407 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  27.82 
 
 
413 aa  107  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  24.66 
 
 
397 aa  106  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  27.42 
 
 
408 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  28.3 
 
 
406 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  26.13 
 
 
415 aa  103  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  28.24 
 
 
406 aa  103  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  24.48 
 
 
394 aa  102  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  28.21 
 
 
413 aa  102  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  30.24 
 
 
403 aa  102  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  25.2 
 
 
408 aa  102  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  24.49 
 
 
428 aa  100  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  27.03 
 
 
411 aa  99.8  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  25.62 
 
 
412 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  25.86 
 
 
407 aa  97.4  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  28.32 
 
 
412 aa  96.7  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  26.75 
 
 
429 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  26.46 
 
 
417 aa  94.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  24.69 
 
 
480 aa  94.4  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  24.8 
 
 
405 aa  94  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  26.25 
 
 
419 aa  94  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  25.67 
 
 
419 aa  94  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  22.74 
 
 
407 aa  93.6  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  23.47 
 
 
444 aa  92.4  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  25.89 
 
 
411 aa  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  23.71 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  31.86 
 
 
410 aa  90.1  6e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  25.41 
 
 
424 aa  89.7  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  33.88 
 
 
411 aa  87.8  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  22.22 
 
 
431 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  31.07 
 
 
406 aa  87.4  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  24.88 
 
 
463 aa  85.9  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  23.39 
 
 
403 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  25.31 
 
 
464 aa  84.3  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  24.59 
 
 
423 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  27 
 
 
412 aa  84  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  24.59 
 
 
423 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  24.62 
 
 
448 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  27.44 
 
 
413 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  29.03 
 
 
411 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  22.37 
 
 
404 aa  79.3  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  29.76 
 
 
439 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  22.9 
 
 
487 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  24.36 
 
 
449 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  29.49 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  25.29 
 
 
414 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2044  putative signal transduction protein  24.91 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  27.03 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31360  predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains  25.27 
 
 
418 aa  77.4  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.041924 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  25.7 
 
 
438 aa  76.6  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  22.37 
 
 
397 aa  76.6  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  27.23 
 
 
411 aa  76.6  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  22.83 
 
 
458 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  23.05 
 
 
431 aa  76.6  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  23.05 
 
 
431 aa  76.3  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  23.61 
 
 
422 aa  74.7  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  24.79 
 
 
419 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  22.05 
 
 
460 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4432  putative signal transduction protein  23.58 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0558  putative signal transduction protein  24.53 
 
 
410 aa  70.1  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  24.89 
 
 
411 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  22.91 
 
 
447 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0622  putative signal transduction protein  25.27 
 
 
430 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  27.06 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  23.1 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  21.93 
 
 
450 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3839  putative signal transduction protein  22.63 
 
 
403 aa  67  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  26.14 
 
 
403 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  26.62 
 
 
448 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  22.43 
 
 
423 aa  63.2  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  25.62 
 
 
378 aa  62.4  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3112  putative signal transduction protein  24.42 
 
 
413 aa  62  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  22.65 
 
 
445 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0460  putative signal transduction protein  26.36 
 
 
280 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.798096  normal  0.334543 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  29.23 
 
 
544 aa  52.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>