More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0553 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0553  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  496  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0529  hypothetical protein  94.67 
 
 
244 aa  443  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  35.51 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  36.55 
 
 
260 aa  138  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  34.58 
 
 
254 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 
249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3016  extracellular solute-binding protein  31.54 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.032906  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.74 
 
 
251 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  32.39 
 
 
265 aa  132  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  32.53 
 
 
250 aa  132  6.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  35.98 
 
 
245 aa  131  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  35.62 
 
 
247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0986  extracellular solute-binding protein  39.11 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0951  extracellular solute-binding protein  39.11 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  31.68 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3392  extracellular solute-binding protein  39.11 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0624048  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  32.81 
 
 
263 aa  129  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3027  extracellular solute-binding protein  38.67 
 
 
244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 
247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  32.53 
 
 
265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  34.82 
 
 
242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  29.22 
 
 
246 aa  128  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.5 
 
 
244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  30.7 
 
 
266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  35.92 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0972  extracellular solute-binding protein family 3  38.1 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.801508  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  28.98 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  37.05 
 
 
244 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 
252 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0882  extracellular solute-binding protein  37.05 
 
 
244 aa  125  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00121366  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  37.05 
 
 
244 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  36.65 
 
 
246 aa  124  9e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1655  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.26 
 
 
243 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.568539 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  34.47 
 
 
264 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  34.47 
 
 
264 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  33.47 
 
 
247 aa  122  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2908  cystine transporter subunit  30.36 
 
 
265 aa  122  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647057  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0178  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 
299 aa  122  6e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  36.2 
 
 
246 aa  122  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  34.47 
 
 
264 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.3 
 
 
513 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1767  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 
276 aa  122  7e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.99488  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  32.81 
 
 
261 aa  122  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2011  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.986691  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  35.83 
 
 
245 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0434  arginine-binding periplasmic protein 1  34.58 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  32.93 
 
 
259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  30.98 
 
 
256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  33.86 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  34.63 
 
 
279 aa  119  6e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 
254 aa  118  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.2 
 
 
259 aa  118  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1863  extracellular solute-binding protein  31.36 
 
 
292 aa  118  7e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2979  extracellular solute-binding protein  33.98 
 
 
265 aa  118  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  30.88 
 
 
243 aa  118  9e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  32.79 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.79 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1259  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 
295 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.79 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  32.79 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.02 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  33.07 
 
 
271 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3922  extracellular solute-binding protein family 3  30.7 
 
 
282 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.79 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  29.48 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.79 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.73 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.73 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  29.88 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.73 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  29.48 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  31.48 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  29.48 
 
 
285 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  29.48 
 
 
266 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.58 
 
 
250 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.58 
 
 
250 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  29.48 
 
 
266 aa  116  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0888  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  32.39 
 
 
243 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.214233  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.39 
 
 
259 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1455  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.2 
 
 
276 aa  115  5e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000239011  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.46 
 
 
490 aa  115  6e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2377  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30.65 
 
 
243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  30.4 
 
 
266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00865  arginine transporter subunit  31.98 
 
 
243 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2782  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31.98 
 
 
243 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0257892  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2736  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31.98 
 
 
243 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0318086  normal  0.950747 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  30.04 
 
 
247 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.39 
 
 
259 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.69 
 
 
250 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0932  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  31.98 
 
 
243 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05529  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  32.48 
 
 
247 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0964  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  31.98 
 
 
243 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00871  hypothetical protein  31.98 
 
 
243 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.69 
 
 
250 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.69 
 
 
250 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2471  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  31.98 
 
 
243 aa  115  8.999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.198291  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.69 
 
 
250 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.69 
 
 
250 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2724  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30.65 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00108182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>