More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0454 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0454  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  504  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0430  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  504  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  56.75 
 
 		 259 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  56.75 
 
 		 259 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  55.51 
 
 		 262 aa  279  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3854  ABC transporter, permease protein  55.56 
 
 		 262 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.605289  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2137  ABC-2 type transporter  53.6 
 
 		 257 aa  275  7e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0672016  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  54.72 
 
 		 259 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  53.2 
 
 		 263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  54.33 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1984  ABC-2 type transporter  53.15 
 
 		 260 aa  270  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0219123  normal  0.0104118 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  52.36 
 
 		 263 aa  268  5.9999999999999995e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2833  ABC transporter, inner membrane subunit  53.75 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1171  16S rRNA processing protein RimM  52.92 
 
 		 257 aa  265  4e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.730617  hitchhiker  0.000000152208 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4180  hypothetical protein  55.34 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1352  hypothetical protein  51.6 
 
 		 257 aa  264  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000725132  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1920  ABC-2 type transporter  54.51 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00135758  normal  0.376856 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  51.75 
 
 		 257 aa  262  4e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  53.39 
 
 		 257 aa  262  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15510  ABC-2 type transporter, permease component  54.33 
 
 		 259 aa  261  6e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  50.8 
 
 		 260 aa  261  8.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3819  ABC-2 type transporter  54.72 
 
 		 259 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.728867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  49.02 
 
 		 256 aa  259  4e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1005  ABC transporter, permease protein  49.6 
 
 		 254 aa  257  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0495  ABC-2 type transporter  51.61 
 
 		 259 aa  257  2e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1506  ABC-2 type transporter  53.94 
 
 		 259 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3348  ABC transporter, permease protein  48.8 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0192428  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1779  ABC-2 type transporter  50.2 
 
 		 275 aa  256  3e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3476  ABC-2 type transporter  48.8 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0559  ABC transporter permease protein  51.21 
 
 		 259 aa  254  7e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  47.6 
 
 		 256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  47.6 
 
 		 256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  51.91 
 
 		 257 aa  253  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  49.8 
 
 		 256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  47.6 
 
 		 256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  47.6 
 
 		 256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  48.63 
 
 		 256 aa  253  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1016  ABC transporter permease  48.4 
 
 		 256 aa  253  3e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.875005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  50.6 
 
 		 271 aa  252  5.000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0881  ABC-2 type transporter  47.98 
 
 		 276 aa  251  7e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  48.19 
 
 		 256 aa  251  8.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  47.41 
 
 		 256 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0427  ABC transporter, inner membrane subunit  51.49 
 
 		 257 aa  249  2e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  48.63 
 
 		 271 aa  250  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  47.2 
 
 		 256 aa  250  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0574  ABC-2 type transporter permease protein  50.2 
 
 		 257 aa  249  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  49.21 
 
 		 256 aa  249  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00127  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  48.8 
 
 		 256 aa  248  5e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  48.8 
 
 		 256 aa  248  5e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  48.8 
 
 		 256 aa  248  5e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0132  ABC transporter, permease protein  48.8 
 
 		 256 aa  248  5e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0189  ABC transporter permease protein  49.6 
 
 		 256 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0197  ABC transporter permease  49.6 
 
 		 256 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.737997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  48.24 
 
 		 256 aa  248  5e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  48.8 
 
 		 256 aa  248  5e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  48.8 
 
 		 256 aa  248  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0188  ABC transporter permease  49.6 
 
 		 256 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137921  normal  0.864827 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  48.8 
 
 		 256 aa  248  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0205  ABC transporter, permease protein  49.6 
 
 		 256 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  48.8 
 
 		 256 aa  248  5e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0192  ABC transporter permease  49.6 
 
 		 256 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.333926 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1025  ABC-2 type transporter  48.4 
 
 		 256 aa  248  6e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0880893  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2121  ABC transporter, permease protein  48.19 
 
 		 254 aa  247  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  46.8 
 
 		 256 aa  248  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  47.2 
 
 		 256 aa  247  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  48.8 
 
 		 254 aa  246  2e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  46.8 
 
 		 256 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  46.4 
 
 		 256 aa  246  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0690  ABC-2 type transporter  46.18 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809524  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3231  ABC-2 type transporter  46 
 
 		 256 aa  243  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  45.97 
 
 		 262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0676  ABC-2 type transporter  49.2 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  44.18 
 
 		 258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  47.47 
 
 		 257 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  47.47 
 
 		 257 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  44.22 
 
 		 256 aa  237  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  43.78 
 
 		 258 aa  236  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2614  ABC transporter, integral membrane protein  50.6 
 
 		 256 aa  234  8e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.838377  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1157  ABC-2 type transporter  47.45 
 
 		 256 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0839963  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3928  ABC-2 type transporter  45.42 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2826  ABC-2 type transporter  48.8 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525501  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  38.78 
 
 		 264 aa  189  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0616  ABC-2 type transporter  38.96 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.33089 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0808  hypothetical protein  41.81 
 
 		 253 aa  185  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2722  ABC transporter membrane spanning protein  39.06 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03055  ABC-2 type transporter  37.66 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1332  ABC-2 type transporter  41.7 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.993972  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1912  ABC-2 type transporter  40.99 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846791  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3083  ABC transporter permease  36.33 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.646009  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0836  ABC transporter, inner membrane subunit  39.6 
 
 		 253 aa  178  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0977  ABC transporter permease protein  37.77 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.024266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2088  ABC-2 type transporter  39.51 
 
 		 253 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0318264  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  34.68 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0379  ABC-2 type transporter  36.86 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2524  ABC-2 type transporter  38.96 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3138  ABC-2 type transporter  36.95 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00549881  normal  0.763555 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0411  ABC-2 type transporter  36.86 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.164581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0447  ABC-2 type transporter  36.02 
 
 		 259 aa  176  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1926  ABC-2 type transporter  35.66 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.14437 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0800  ABC-2 type transporter  37.3 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0251444  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>