More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0405 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0405  50S ribosomal protein L24  100 
 
 
109 aa  213  7e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0380  50S ribosomal protein L24  99.08 
 
 
109 aa  212  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2313  50S ribosomal protein L24  54.55 
 
 
105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000126749  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3327  50S ribosomal protein L24  54.63 
 
 
105 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000922916  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2313  50S ribosomal protein L24  55.56 
 
 
105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.103377  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0778  ribosomal protein L24  55.56 
 
 
105 aa  111  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000331203  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  57.41 
 
 
107 aa  110  6e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  57.41 
 
 
107 aa  110  6e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000772359  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0330  50S ribosomal protein L24  54.63 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.5069e-23  unclonable  0.0000000479114 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0416  50S ribosomal protein L24P  53.7 
 
 
107 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000110454  normal  0.227235 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0334  ribosomal protein L24  52.29 
 
 
107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000366107  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  55.66 
 
 
104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0469  50S ribosomal protein L24  51.38 
 
 
106 aa  107  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0847  50S ribosomal protein L24  52.29 
 
 
105 aa  105  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0970  50S ribosomal protein L24  56.48 
 
 
105 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000143141  hitchhiker  0.000000947265 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2361  50S ribosomal protein L24  51.85 
 
 
105 aa  105  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.449778  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4265  50S ribosomal protein L24  57.41 
 
 
105 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000655615  unclonable  0.00000000000267825 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0848  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 
104 aa  103  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08960  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 
104 aa  103  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0786471  normal  0.0497722 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  51.4 
 
 
104 aa  103  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0612  ribosomal protein L24  55.66 
 
 
104 aa  102  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.257804  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0637  ribosomal protein L24  52.78 
 
 
104 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000000374833  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06360  50S ribosomal protein L24  54.63 
 
 
104 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127864  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2158  ribosomal protein L24  48.6 
 
 
104 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0775088  normal  0.23262 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0224  50S ribosomal protein L24  55.24 
 
 
104 aa  102  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000086996  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4537  50S ribosomal protein L24  51.85 
 
 
104 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407127  normal  0.120344 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0432  50S ribosomal protein L24  53.7 
 
 
105 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0323669  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0730  ribosomal protein L24  53.7 
 
 
106 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00351151  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0495  50S ribosomal protein L24  51.85 
 
 
104 aa  100  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105186  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0465  50S ribosomal protein L24  51.85 
 
 
104 aa  100  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.451517  hitchhiker  0.00000267089 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  51.4 
 
 
106 aa  101  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0169  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 
104 aa  101  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000484148  hitchhiker  0.000323291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4738  50S ribosomal protein L24  51.85 
 
 
104 aa  100  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0127139  normal  0.762072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0498  50S ribosomal protein L24  51.85 
 
 
104 aa  100  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000033533  normal  0.098699 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0505  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 
110 aa  100  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0612161  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0242  50S ribosomal protein L24  52.38 
 
 
104 aa  100  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0210  50S ribosomal protein L24  52.38 
 
 
104 aa  100  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216375  unclonable  0.0000000000129617 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0205  50S ribosomal protein L24  52.38 
 
 
104 aa  100  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0210  50S ribosomal protein L24  52.38 
 
 
104 aa  100  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745945  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5068  50S ribosomal protein L24  51.85 
 
 
104 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000162639  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0671  50S ribosomal protein L24  47.75 
 
 
110 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.367854  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0444  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 
105 aa  99.8  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0162317  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3898  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 
104 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00126984  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04510  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 
105 aa  99  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0040022  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0159  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 
104 aa  98.6  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000158735  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0290  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
105 aa  98.2  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000794802  hitchhiker  0.00000184934 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0306  ribosomal protein L24  50.93 
 
 
104 aa  97.4  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0004461  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0195  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 
104 aa  97.1  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000100309  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0181  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 
104 aa  96.3  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000129578  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0211  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000151512  unclonable  0.00000802476 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4159  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000135344  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0207  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000541259  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4306  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 
104 aa  95.9  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000126624  unclonable  0.0000000000482395 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4045  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000115284  unclonable  0.00000000000347385 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  47.27 
 
 
106 aa  94.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  47.27 
 
 
106 aa  94.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3513  ribosomal protein L24  48.57 
 
 
104 aa  95.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000647333  hitchhiker  0.0000000884976 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3748  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 
104 aa  94.4  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000844667  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3938  50S ribosomal protein L24  50.47 
 
 
105 aa  94  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0071  50S ribosomal protein L24  52.38 
 
 
103 aa  93.6  8e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4679  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 
104 aa  93.2  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000175822  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0486  50S ribosomal protein L24  52.34 
 
 
106 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000769902  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3740  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 
104 aa  92  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000337214  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0331  50S ribosomal protein L24  49.53 
 
 
106 aa  92  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000249202  hitchhiker  0.00112167 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  49.53 
 
 
107 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0334  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 
104 aa  90.9  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000849803  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03160  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 
104 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000206027  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0404  ribosomal protein L24  50.48 
 
 
104 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000002398  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3792  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 
104 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256632  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3733  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 
104 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.012207  normal  0.015742 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3625  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 
104 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000301612  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3694  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 
104 aa  90.5  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000331178  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3604  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 
104 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000161475  normal  0.0245278 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0404  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 
104 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839278  hitchhiker  0.0000141467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4632  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 
104 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000390519  normal  0.45352 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  49.06 
 
 
107 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3796  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 
104 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307428  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3811  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 
104 aa  90.5  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000390603  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03111  hypothetical protein  50.48 
 
 
104 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000161136  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3698  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 
104 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000743122  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0416  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 
104 aa  90.5  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000325696  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3503  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 
104 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000502759  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3625  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 
104 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00533524  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0260  50S ribosomal protein L24  50.47 
 
 
102 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0016412  hitchhiker  0.00832042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2314  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 
106 aa  89.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00356207  normal  0.384073 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0495  50S ribosomal protein L24  47.17 
 
 
105 aa  89.4  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000419023  normal  0.0253858 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4533  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 
104 aa  89.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114986  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3990  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 
104 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0024494  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0500  50S ribosomal protein L24  47.17 
 
 
105 aa  89  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000146538  decreased coverage  0.00101346 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0437  50S ribosomal protein L24  45.28 
 
 
105 aa  88.6  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000277232  hitchhiker  0.0000906767 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0392  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 
106 aa  89  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0277402  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  44.95 
 
 
104 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  44.04 
 
 
110 aa  88.6  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0384  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 
106 aa  89  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000110242  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  46.36 
 
 
110 aa  88.6  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  49.07 
 
 
105 aa  88.2  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  44.44 
 
 
104 aa  88.2  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4232  50S ribosomal protein L24  50.47 
 
 
106 aa  88.6  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000941051  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  44.04 
 
 
106 aa  88.2  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3903  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 
104 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000356583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>