83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0354 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  796  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  95.87 
 
 
387 aa  741  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  51.16 
 
 
1101 aa  413  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  45.62 
 
 
373 aa  322  5e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  44.44 
 
 
379 aa  318  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  46.3 
 
 
395 aa  316  3e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  40.42 
 
 
395 aa  288  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  40.93 
 
 
377 aa  285  8e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3884  domain of unknown function DUF1745  40.2 
 
 
1852 aa  273  5e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  40.93 
 
 
365 aa  265  7e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0140  FIST C domain protein  40.11 
 
 
379 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  36.73 
 
 
381 aa  240  3e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  26.32 
 
 
408 aa  137  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  29.74 
 
 
417 aa  132  1e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  28.81 
 
 
401 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  27.64 
 
 
400 aa  126  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  27.2 
 
 
383 aa  118  2e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  24.72 
 
 
389 aa  110  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  27.32 
 
 
933 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  27.1 
 
 
402 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  25.89 
 
 
396 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  24.18 
 
 
375 aa  103  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  25.65 
 
 
376 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  8.47515e-09 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  25.15 
 
 
629 aa  100  6e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  27.74 
 
 
932 aa  99.8  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  24.8 
 
 
396 aa  98.6  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33222e-19 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  22.35 
 
 
387 aa  93.2  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  23.66 
 
 
396 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  26.25 
 
 
934 aa  90.5  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  25.54 
 
 
931 aa  87.8  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  23.65 
 
 
396 aa  87  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  24.23 
 
 
400 aa  84  5e-15  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2247  hypothetical protein  25.6 
 
 
382 aa  80.1  6e-14  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  25.38 
 
 
379 aa  77.4  4e-13  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  25.48 
 
 
416 aa  77  5e-13  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  24.86 
 
 
381 aa  74.3  3e-12  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2538  hypothetical protein  26.32 
 
 
382 aa  73.6  6e-12  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1883  hypothetical protein  24.12 
 
 
382 aa  72  2e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002115  sensory box/GGDEF family protein  27.75 
 
 
828 aa  70.9  4e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  26.27 
 
 
386 aa  70.5  5e-11  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  25.99 
 
 
392 aa  69.7  8e-11  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  25.99 
 
 
392 aa  69.7  8e-11  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  26.27 
 
 
392 aa  69.7  8e-11  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  25.99 
 
 
392 aa  69.7  8e-11  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  25.99 
 
 
392 aa  69.7  8e-11  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1661  hypothetical protein  26.27 
 
 
384 aa  69.7  8e-11  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  25.99 
 
 
384 aa  69.7  9e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  22.71 
 
 
386 aa  63.9  4e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4044  hypothetical protein  22.04 
 
 
401 aa  62.4  1e-08  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3254  domain of unknown function DUF1745  22.87 
 
 
385 aa  61.2  3e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00305  sensory transduction protein kinase  25.52 
 
 
828 aa  60.8  4e-08  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2675  hypothetical protein  24.23 
 
 
399 aa  60.1  7e-08  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0296571  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0526  hypothetical protein  23.96 
 
 
380 aa  57.4  4e-07  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3362  hypothetical protein  24.91 
 
 
377 aa  57  6e-07  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.103972 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  23.59 
 
 
512 aa  55.1  2e-06  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0688  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.68 
 
 
951 aa  52.8  1e-05  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00399648  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2389  GGDEF family protein  23.56 
 
 
829 aa  52.8  1e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1055  domain of unknown function DUF1745  26.75 
 
 
389 aa  51.6  2e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2479  hypothetical protein  23.85 
 
 
379 aa  51.2  3e-05  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  23.78 
 
 
389 aa  51.6  3e-05  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  20.6 
 
 
427 aa  51.2  3e-05  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  24.73 
 
 
392 aa  50.8  4e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2542  hypothetical protein  25.2 
 
 
395 aa  50.8  4e-05  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2592  hypothetical protein  24.43 
 
 
386 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0895  FIST C domain protein  27.09 
 
 
350 aa  49.3  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  4.43325e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1527  hypothetical protein  22.58 
 
 
390 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.039182 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1250  hypothetical protein  24.43 
 
 
386 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  31.21 
 
 
464 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1891  hypothetical protein  24.9 
 
 
391 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  25.99 
 
 
378 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2881  hypothetical protein  22.31 
 
 
390 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  24.92 
 
 
400 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0615  hypothetical protein  24.21 
 
 
468 aa  47.8  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.948448  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  24.44 
 
 
389 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3113  hypothetical protein  22.56 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  hitchhiker  2.08643e-05 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1931  hypothetical protein  25.39 
 
 
385 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2993  hypothetical protein  26.09 
 
 
368 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4519  domain of unknown function DUF1745  23.8 
 
 
387 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3617  hypothetical protein  25.07 
 
 
378 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0308687  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  23.79 
 
 
405 aa  44.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0889  hypothetical protein  23.72 
 
 
374 aa  43.9  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  23.37 
 
 
385 aa  43.5  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05570  hypothetical protein  24.27 
 
 
387 aa  42.7  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>