122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0257 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  791    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  50.68 
 
 
388 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  51.08 
 
 
389 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  40 
 
 
390 aa  290  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  38.68 
 
 
391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  51.76 
 
 
307 aa  219  7.999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  47.24 
 
 
285 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  45.7 
 
 
429 aa  162  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  43.15 
 
 
358 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  41.31 
 
 
359 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  43.22 
 
 
372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  40.28 
 
 
438 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  41.12 
 
 
360 aa  145  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  37.9 
 
 
347 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  36.84 
 
 
392 aa  132  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  36.53 
 
 
354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  28.84 
 
 
405 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02190  hypothetical protein  36.45 
 
 
497 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  34.98 
 
 
400 aa  126  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  37.09 
 
 
443 aa  125  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  36.1 
 
 
393 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  30.45 
 
 
402 aa  123  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  35.81 
 
 
389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  28.32 
 
 
395 aa  120  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  32.57 
 
 
534 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  32.57 
 
 
534 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  32.57 
 
 
534 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  37.69 
 
 
306 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1785  chitin binding domain-containing protein  29.59 
 
 
365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361699  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0777  chitin-binding protein  29.59 
 
 
365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.875326  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2045  chitin-binding protein  29.59 
 
 
365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.548348  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1070  chitin-binding protein  29.59 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2047  chitin binding domain-containing protein  30.37 
 
 
417 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0759  chitin binding domain-containing protein  29.59 
 
 
408 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0669  chitin-binding protein  29.59 
 
 
408 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1925  chitin binding domain-containing protein  29.17 
 
 
449 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.6 
 
 
481 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3105  chitin-binding domain-containing protein  33.47 
 
 
276 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.179745 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.64 
 
 
477 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.81 
 
 
491 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.28 
 
 
481 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.28 
 
 
481 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.28 
 
 
481 aa  99.8  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  31.25 
 
 
362 aa  99.4  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  25.8 
 
 
491 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.73 
 
 
486 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  25.48 
 
 
491 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4563  chitin-binding domain 3 protein  34.97 
 
 
212 aa  94  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  24.76 
 
 
481 aa  91.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  31.07 
 
 
368 aa  87  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2475  chitin-binding domain 3 protein  30.23 
 
 
223 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.99 
 
 
471 aa  83.6  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  30.85 
 
 
197 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.62 
 
 
497 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  36.29 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  23.64 
 
 
473 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  29 
 
 
351 aa  79.7  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  28.29 
 
 
485 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  28.14 
 
 
487 aa  77  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.36 
 
 
491 aa  76.3  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1268  putative secreted cellulose-binding protein  29.61 
 
 
222 aa  75.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.459217  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  54.43 
 
 
1204 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  27.54 
 
 
221 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  27.54 
 
 
221 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3518  chitin-binding domain 3 protein  28.37 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  26.69 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  26.92 
 
 
197 aa  71.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  26.69 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  26.27 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  26.27 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  26.27 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  26.27 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  44.58 
 
 
487 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  26.27 
 
 
221 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  26.18 
 
 
221 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  27.66 
 
 
436 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  28.95 
 
 
220 aa  66.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  36.72 
 
 
699 aa  65.1  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  28.92 
 
 
201 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  59.62 
 
 
972 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  27.57 
 
 
216 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4693  chitin-binding domain 3 protein  27.7 
 
 
220 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  26.77 
 
 
455 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  26.77 
 
 
455 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  26.26 
 
 
455 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  32.31 
 
 
445 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  25.5 
 
 
455 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  25.5 
 
 
455 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  23.83 
 
 
459 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  26.26 
 
 
455 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  24.29 
 
 
455 aa  60.1  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  52.94 
 
 
729 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  52.94 
 
 
729 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  25.25 
 
 
455 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0255  endochitinase  67.65 
 
 
587 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.931196 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0271  endochitinase  67.65 
 
 
587 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.527688  normal  0.775272 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0260  basic endochitinase  67.65 
 
 
553 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0274  endochitinase  67.65 
 
 
587 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0255  endochitinase  67.65 
 
 
587 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.942643 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  25.84 
 
 
455 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>