103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0165 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  462  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  71.43 
 
 		 234 aa  330  2e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2375  hypothetical protein  36 
 
 		 220 aa  126  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1077  hypothetical protein  54.93 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1039  hypothetical protein  48.61 
 
 		 84 aa  72  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  28.84 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  28.84 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2539  peptidase S24/S26 domain-containing protein  34.62 
 
 		 149 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692907 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  27.91 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  26.24 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  27.44 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  27.57 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  28.05 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  29.38 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  29.14 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  28.29 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4123  transcriptional regulator, XRE family  40.51 
 
 		 111 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  26.24 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  42.62 
 
 		 347 aa  50.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  25.48 
 
 		 143 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2911  putative phage repressor  26.98 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000204879  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  26.46 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  22.83 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  27.66 
 
 		 138 aa  48.5  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  25.48 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  27.66 
 
 		 138 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  24.32 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  27.66 
 
 		 138 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  28 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  30 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 152 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  23.73 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2211  putative repressor protein encoded within prophage CP-933O  25.89 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000372098  hitchhiker  7.21375e-19 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3686  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 133 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  35.96 
 
 		 181 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  35.96 
 
 		 181 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  29.09 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  25.11 
 
 		 207 aa  46.2  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  35.96 
 
 		 181 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  27.07 
 
 		 214 aa  45.8  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  38.03 
 
 		 210 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2543  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 104 aa  45.8  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0592097  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  35.96 
 
 		 181 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 181 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0134  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 152 aa  45.4  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000191075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  35.96 
 
 		 181 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  35.96 
 
 		 181 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 181 aa  45.4  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0455  XRE family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 214 aa  45.4  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000298649 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  35.96 
 
 		 181 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 175 aa  45.1  0.0009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  28.22 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  42.62 
 
 		 513 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  24.59 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4126  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 84 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  38.33 
 
 		 394 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  27.92 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  28.76 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  27.92 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  29.89 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  38 
 
 		 503 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  28.97 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3859  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 103 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0153162 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 152 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  26.49 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  21.78 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1497  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 85 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  30.11 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1530  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 137 aa  43.5  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  32.29 
 
 		 122 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4196  transcriptional regulator, XRE family  32.53 
 
 		 103 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  38.1 
 
 		 141 aa  43.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  37.88 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1025  XRE family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 104 aa  43.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1668  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 137 aa  42.7  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00903838  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1044  helix-turn-helix domain-containing protein  32.98 
 
 		 104 aa  43.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0449357  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  25.55 
 
 		 240 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  23.6 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  36.36 
 
 		 144 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  32.1 
 
 		 112 aa  42.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1691  transcriptional regulator, XRE family  35.56 
 
 		 99 aa  42.7  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  28.89 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4406  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 108 aa  42.4  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2922  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 96 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371341  hitchhiker  0.000558445 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3290  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 67 aa  42  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605967 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3893  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 107 aa  42  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 132 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  30.93 
 
 		 147 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 228 aa  42  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 272 aa  42  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  24.56 
 
 		 233 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>