More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0131 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 125 aa  253  4e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 125 aa  253  4e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  61.29 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  60.98 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  59.68 
 
 		 129 aa  147  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  59.68 
 
 		 129 aa  147  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  59.68 
 
 		 129 aa  147  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  59.68 
 
 		 129 aa  147  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  59.68 
 
 		 129 aa  147  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  58.87 
 
 		 129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  56.3 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  58.06 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  56.3 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  58.06 
 
 		 129 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  58.06 
 
 		 129 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  58.06 
 
 		 129 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 129 aa  144  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  56.1 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  55.65 
 
 		 130 aa  140  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  55.28 
 
 		 129 aa  139  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  55.74 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  57.02 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  53.23 
 
 		 129 aa  137  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  56.45 
 
 		 130 aa  137  7e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 129 aa  136  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1723  glycine cleavage system protein H  57.85 
 
 		 126 aa  136  7.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000363297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  55.65 
 
 		 129 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  54.47 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  54.47 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  52 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  135  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0764  glycine cleavage system protein H  53.66 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  54.31 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  54.17 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  49.18 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  49.18 
 
 		 127 aa  133  8e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  59.46 
 
 		 142 aa  133  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  52.03 
 
 		 131 aa  133  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  51.64 
 
 		 126 aa  133  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  53.66 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3845  glycine cleavage system H protein  50.82 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  53.66 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  53.66 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  54.47 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  54.84 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  51.64 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  59.46 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  52.89 
 
 		 127 aa  130  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  59.46 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  51.28 
 
 		 125 aa  130  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0213  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  55.74 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  56.76 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  54.7 
 
 		 136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  54.7 
 
 		 135 aa  127  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  55.74 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  46.72 
 
 		 128 aa  127  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  52.59 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0135  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 		 131 aa  127  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  52.94 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  45.9 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  45.9 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  52.03 
 
 		 130 aa  126  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  49.15 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  51.64 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0177  glycine cleavage system protein H  52.03 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  47.86 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  48.36 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  48.36 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  48.31 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3294  glycine cleavage system protein H  52.99 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0907  glycine cleavage H-protein  47.97 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  53.28 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  49.14 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2347  glycine cleavage system H protein  53.04 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 125 aa  124  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>