69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0124 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0124  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  712    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0110  hypothetical protein  96.81 
 
 		 345 aa  687    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2280  squalene/phytoene synthase  24 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1173  Squalene/phytoene synthase  26.59 
 
 		 348 aa  99.8  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1321  squalene/phytoene synthase  28.22 
 
 		 366 aa  97.1  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1206  Squalene/phytoene synthase  26.29 
 
 		 355 aa  96.7  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000204086  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20770  Squalene/phytoene synthase  26.53 
 
 		 377 aa  93.2  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00645323  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2309  Squalene/phytoene synthase  26.47 
 
 		 350 aa  89.4  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0934  Squalene/phytoene synthase  27.27 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1784  Squalene synthase  24.29 
 
 		 401 aa  79.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2125  phytoene/squalene synthetase family protein  24.29 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0813  squalene synthase  26.12 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2690  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.88 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.286545  normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3686  squalene/phytoene synthase  24.92 
 
 		 354 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4159  squalene/phytoene synthase  24.92 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283896  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0902  Squalene/phytoene synthase  24.03 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.883554  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3084  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  23.62 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1894  Squalene/phytoene synthase  29.17 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5450  squalene/phytoene synthase  25.61 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.035034 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4328  squalene/phytoene synthase  25.33 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0106814  normal  0.0939133 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10396  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01220)  31.43 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0189  squalene/phytoene synthase  26.16 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433494  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0327  squalene/phytoene synthase family protein  24.92 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479613  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4104  squalene/phytoene synthase  23.4 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132439  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4262  squalene/phytoene synthase  23.4 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0172457  normal  0.1857 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1762  squalene/phytoene synthase family protein  24.62 
 
 		 513 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3255  squalene/phytoene synthase  22.84 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0892  Squalene/phytoene synthase  23.33 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000100627  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2156  squalene/phytoene synthase family protein  24.31 
 
 		 564 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0418  squalene/phytoene synthase family protein  24 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15920  Squalene synthase  26.03 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1133  squalene/phytoene synthase family protein  24 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2107  squalene/phytoene synthase family protein  24 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.666736  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1840  squalene/phytoene synthase family protein  24 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.156378  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0365  Squalene/phytoene synthase  26.61 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4822  Squalene/phytoene synthase  25.35 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000193666  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0843  squalene/phytoene synthase family protein  24 
 
 		 516 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336434  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2043  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.23 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259973  normal  0.118858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4808  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.84 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000603288  normal  0.956727 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5617  Squalene/phytoene synthase  26.18 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1749  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  22.66 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364934  normal  0.191421 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0485  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  23.68 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.501561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0519  Squalene/phytoene synthase  26.42 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000172077  unclonable  0.00000000442805 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0502  Squalene/phytoene synthase  26.42 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13160  predicted protein  28.08 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0957  squalene/phytoene synthase  23.4 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83429  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.83 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.274803  normal  0.0738823 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4026  Squalene/phytoene synthase  22.73 
 
 		 388 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.600735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31144  predicted protein  23.3 
 
 		 456 aa  54.7  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1827  squalene synthase HpnD  34.78 
 
 		 298 aa  53.9  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05660  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative  27.59 
 
 		 542 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.148096  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0169  squalene/phytoene synthase  22.33 
 
 		 340 aa  51.2  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  normal  0.0348824 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3241  squalene synthase HpnD  34.41 
 
 		 294 aa  49.3  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154532 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7144  squalene synthase HpnD  34.74 
 
 		 283 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0118  squalene/phytoene synthase  26.72 
 
 		 290 aa  46.2  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  32.22 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6349  squalene synthase HpnD  31.18 
 
 		 284 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00743094  normal  0.0909411 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2218  squalene synthase HpnD  33.33 
 
 		 283 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.674273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3173  squalene synthase HpnD  26.72 
 
 		 282 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1942  squalene synthase HpnD  33.33 
 
 		 283 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.802248 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  27.48 
 
 		 293 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4149  phytoene synthase  32.61 
 
 		 282 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.165993  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2271  squalene/phytoene synthase  30.69 
 
 		 278 aa  43.9  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.3606  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2967  putative phytoene synthase  32.98 
 
 		 279 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2684  squalene/phytoene synthase  30.69 
 
 		 278 aa  43.1  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1833  squalene synthase HpnD  32.26 
 
 		 283 aa  43.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1718  squalene/phytoene synthase  31.96 
 
 		 279 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150887  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  27.91 
 
 		 302 aa  42.7  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1724  squalene/phytoene synthase  28.45 
 
 		 279 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949729  normal  0.0688647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>